RHOBTB1

RHOBTB1
Ідентифікатори
Символи	RHOBTB1, Rho related BTB domain containing 1
Зовнішні ІД	OMIM: 607351 MGI: 1916538 HomoloGene: 8892 GeneCards: RHOBTB1
Онтологія гена Молекулярна функція • nucleotide binding • GTP binding • GO:0006184 GTPase activity • protein kinase binding Клітинна компонента • гіалоплазма • клітинна мембрана • внутрішньоклітинний • цитоплазма • цитоскелет • cell projection Біологічний процес • regulation of small GTPase mediated signal transduction • small GTPase mediated signal transduction • GO:0000767 cell morphogenesis • actin filament organization • Rho protein signal transduction • cell migration • actin cytoskeleton organization • positive regulation of actin filament polymerization • actin cytoskeleton reorganization • engulfment of apoptotic cell Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	9886	69288
Ensembl	ENSG00000072422	ENSMUSG00000019944
UniProt	O94844	Q9DAK3
RefSeq (мРНК)	NM_001242359 NM_014836 NM_001350902 NM_001350903 NM_001350904 NM_001350905 NM_001350906 NM_001350907 NM_001350908 NM_001350909 NM_001350910 NM_001350911	NM_001081347 NM_001252636 NM_001252637 NM_001252638
RefSeq (білок)	NP_001229288 NP_055651 NP_001337831 NP_001337832 NP_001337833 NP_001337834 NP_001337835 NP_001337836 NP_001337837 NP_001337838 NP_001337839 NP_001337840 NP_001229288.1 NP_055651.1	NP_001074816 NP_001239565 NP_001239566 NP_001239567
Локус (UCSC)	Хр. 10: 60.87 – 61 Mb	Хр. 10: 68.99 – 69.13 Mb
PubMed search	[1]	[2]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

RHOBTB1 (англ. Rho related BTB domain containing 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 10-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 696 амінокислот, а молекулярна маса — 79 417^[4].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MDADMDYERP		NVETIKCVVV		GDNAVGKTRL		ICARACNTTL		TQYQLLATHV
PTVWAIDQYR		VCQEVLERSR		DVVDEVSVSL		RLWDTFGDHH		KDRRFAYGRS
DVVVLCFSIA		NPNSLNHVKS		MWYPEIKHFC		PRTPVILVGC		QLDLRYADLE
AVNRARRPLA		RPIKRGDILP		PEKGREVAKE		LGLPYYETSV		FDQFGIKDVF
DNAIRAALIS		RRHLQFWKSH		LKKVQKPLLQ		APFLPPKAPP		PVIKIPECPS
MGTNEAACLL		DNPLCADVLF		ILQDQEHIFA		HRIYLATSSS		KFYDLFLMEC
EESPNGSEGA		CEKEKQSRDF		QGRILSVDPE		EEREEGPPRI		PQADQWKSSN
KSLVEALGLE		AEGAVPETQT		LTGWSKGFIG		MHREMQVNPI		SKRMGPMTVV
RMDASVQPGP		FRTLLQFLYT		GQLDEKEKDL		VGLAQIAEVL		EMFDLRMMVE
NIMNKEAFMN		QEITKAFHVR		KANRIKECLS		KGTFSDVTFK		LDDGAISAHK
PLLICSCEWM		AAMFGGSFVE		SANSEVYLPN		INKISMQAVL		DYLYTKQLSP
NLDLDPLELI		ALANRFCLPH		LVALAEQHAV		QELTKAATSG		VGIDGEVLSY
LELAQFHNAH		QLAAWCLHHI		CTNYNSVCSK		FRKEIKSKSA		DNQEYFERHR
WPPVWYLKEE		DHYQRVKRER		EKEDIALNKH		RSRRKWCFWN		SSPAVA

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Білок має сайт для зв'язування з нуклеотидами, ГТФ.

Література

• Ramos S., Khademi F., Somesh B.P., Rivero F. (2002). Genomic organization and expression profile of the small GTPases of the RhoBTB family in human and mouse. Gene. 298: 147—157. PMID 12426103 DOI:10.1016/S0378-1119(02)00980-0
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

1. Human PubMed Reference:.
2. Mouse PubMed Reference:.
3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:18738 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.
4. UniProt, O94844 (англ.) . Архів оригіналу за 7 серпня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.

Див. також

• Хромосома 10

Портал «Біологія»   Портал «Хімія»