RIPK1

RIPK1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4ITH, 4ITI, 4ITJ, 4NEU, 5HX6
Ідентифікатори
Символи	RIPK1, RIP, RIP1, RIP-1, receptor interacting serine/threonine kinase 1, IMD57, AIEFL
Зовнішні ІД	OMIM: 603453 MGI: 108212 HomoloGene: 2820 GeneCards: RIPK1
Реагує на сполуку
Viroporin 3a[1]
Онтологія гена Молекулярна функція • transferase activity • protein kinase activity • nucleotide binding • death domain binding • kinase activity • protein serine/threonine kinase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • identical protein binding • ATP binding • ubiquitin protein ligase binding • signal transducer activity • GO:0032403 protein-containing complex binding • death receptor binding • JUN kinase kinase kinase activity Клітинна компонента • мембрана • receptor complex • клітинна мембрана • мітохондрія • death-inducing signaling complex • membrane raft • цитоплазма • гіалоплазма • endosome membrane • ripoptosome • GO:0009327 protein-containing complex Біологічний процес • T cell apoptotic process • positive regulation of protein phosphorylation • amyloid fibril formation • positive regulation of cell death • фосфорилювання • regulation of ATP:ADP antiporter activity • peptidyl-serine autophosphorylation • regulation of tumor necrosis factor-mediated signaling pathway • positive regulation of macrophage differentiation • cellular response to tumor necrosis factor • cellular response to growth factor stimulus • negative regulation of extrinsic apoptotic signaling pathway • positive regulation of programmed cell death • tumor necrosis factor-mediated signaling pathway • positive regulation of JNK cascade • GO:1904489 regulation of reactive oxygen species metabolic process • negative regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling • TRIF-dependent toll-like receptor signaling pathway • response to tumor necrosis factor • positive regulation of necroptotic process • protein phosphorylation • positive regulation of reactive oxygen species metabolic process • death-inducing signaling complex assembly • positive regulation of NF-kappaB transcription factor activity • necroptotic signaling pathway • positive regulation of interleukin-8 production • positive regulation of tumor necrosis factor production • positive regulation of apoptotic process • positive regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling • positive regulation of extrinsic apoptotic signaling pathway • protein autophosphorylation • regulation of extrinsic apoptotic signaling pathway via death domain receptors • GO:0060554, GO:0060555 Некроптоз • positive regulation of phosphorylation • negative regulation of extrinsic apoptotic signaling pathway in absence of ligand • I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling • activation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process • protein homooligomerization • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • ripoptosome assembly • GO:0072468 сигнальна трансдукція • positive regulation of MAPK cascade • positive regulation of hydrogen peroxide-induced cell death • apoptotic signaling pathway • GO:0097285 апоптоз • GO:0010703, GO:0010702 запрограмована клітинна смерть • extrinsic apoptotic signaling pathway • positive regulation of necrotic cell death • negative regulation of extrinsic apoptotic signaling pathway via death domain receptors • protein deubiquitination • ripoptosome assembly involved in necroptotic process • MyD88-independent toll-like receptor signaling pathway • toll-like receptor 3 signaling pathway • GO:0022415 viral process • protein heterooligomerization • MAPK cascade • negative regulation of cardiac muscle cell proliferation • cellular response to hydrogen peroxide • programmed necrotic cell death • positive regulation of tumor necrosis factor-mediated signaling pathway • positive regulation of production of miRNAs involved in gene silencing by miRNA • GO:1990376 negative regulation of G1/S transition of mitotic cell cycle Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	8737	19766
Ensembl	ENSG00000137275	ENSMUSG00000021408
UniProt	Q13546	Q60855
RefSeq (мРНК)	NM_003804 NM_001317061 NM_001354930 NM_001354931 NM_001354932 NM_001354933 NM_001354934	NM_009068 NM_001359997
RefSeq (білок)	NP_001303990 NP_003795 NP_001341859 NP_001341860 NP_001341861 NP_001341862 NP_001341863	NP_033094 NP_001346926
Локус (UCSC)	Хр. 6: 3.06 – 3.12 Mb	Хр. 13: 34.19 – 34.22 Mb
PubMed search	[2]	[3]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

RIPK1 (англ. Receptor interacting serine/threonine kinase 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 671 амінокислот, а молекулярна маса — 75 931^[5].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MQPDMSLNVI		KMKSSDFLES		AELDSGGFGK		VSLCFHRTQG		LMIMKTVYKG
PNCIEHNEAL		LEEAKMMNRL		RHSRVVKLLG		VIIEEGKYSL		VMEYMEKGNL
MHVLKAEMST		PLSVKGRIIL		EIIEGMCYLH		GKGVIHKDLK		PENILVDNDF
HIKIADLGLA		SFKMWSKLNN		EEHNELREVD		GTAKKNGGTL		YYMAPEHLND
VNAKPTEKSD		VYSFAVVLWA		IFANKEPYEN		AICEQQLIMC		IKSGNRPDVD
DITEYCPREI		ISLMKLCWEA		NPEARPTFPG		IEEKFRPFYL		SQLEESVEED
VKSLKKEYSN		ENAVVKRMQS		LQLDCVAVPS		SRSNSATEQP		GSLHSSQGLG
MGPVEESWFA		PSLEHPQEEN		EPSLQSKLQD		EANYHLYGSR		MDRQTKQQPR
QNVAYNREEE		RRRRVSHDPF		AQQRPYENFQ		NTEGKGTAYS		SAASHGNAVH
QPSGLTSQPQ		VLYQNNGLYS		SHGFGTRPLD		PGTAGPRVWY		RPIPSHMPSL
HNIPVPETNY		LGNTPTMPFS		SLPPTDESIK		YTIYNSTGIQ		IGAYNYMEIG
GTSSSLLDST		NTNFKEEPAA		KYQAIFDNTT		SLTDKHLDPI		RENLGKHWKN
CARKLGFTQS		QIDEIDHDYE		RDGLKEKVYQ		MLQKWVMREG		IKGATVGKLA
QALHQCSRID		LLSSLIYVSQ		N

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, кіназ, серин/треонінових протеїнкіназ, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, мембрані.

Література

• Hsu H., Huang J., Shu H.-B., Baichwal V.R., Goeddel D.V. (1996). TNF-dependent recruitment of the protein kinase RIP to the TNF receptor-1 signaling complex. Immunity. 4: 387—396. PMID 8612133 doi:10.1016/S1074-7613(00)80252-6
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
• Stanger B.Z., Leder P., Lee T.-H., Kim E., Seed B. (1995). RIP: a novel protein containing a death domain that interacts with Fas/APO-1 (CD95) in yeast and causes cell death. Cell. 81: 513—523. PMID 7538908 doi:10.1016/0092-8674(95)90072-1
• Lin Y., Devin A., Rodriguez Y., Liu Z.-G. (1999). Cleavage of the death domain kinase RIP by caspase-8 prompts TNF-induced apoptosis. Genes Dev. 13: 2514—2526. PMID 10521396 doi:10.1101/gad.13.19.2514
• Sanz L., Sanchez P., Lallena M.-J., Diaz-Meco M.T., Moscat J. (1999). The interaction of p62 with RIP links the atypical PKCs to NF-kappaB activation. EMBO J. 18: 3044—3053. PMID 10356400 doi:10.1093/emboj/18.11.3044
• Chen D., Li X., Zhai Z., Shu H.-B. (2002). A novel zinc finger protein interacts with receptor-interacting protein (RIP) and inhibits tumor necrosis factor (TNF)- and IL1-induced NF-kappa B activation. J. Biol. Chem. 277: 15985—15991. PMID 11854271 doi:10.1074/jbc.M108675200

Примітки

1. Сполуки, які фізично взаємодіють з Receptor interacting serine/threonine kinase 1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
2. Human PubMed Reference:.
3. Mouse PubMed Reference:.
4. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10019 (англ.) . Процитовано 6 вересня 2017.
5. UniProt, Q13546 (англ.) . Архів оригіналу за 13 вересня 2017. Процитовано 6 вересня 2017.

Див. також

• Хромосома 6

Портал «Біологія»   Портал «Хімія»