RNF128

RNF128
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3ICU
Ідентифікатори
Символи	RNF128, GRAIL, ring finger protein 128, E3 ubiquitin protein ligase, ring finger protein 128
Зовнішні ІД	OMIM: 300439 MGI: 1914139 HomoloGene: 11337 GeneCards: RNF128
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:1904264, GO:1904822, GO:0090622, GO:0090302 ubiquitin protein ligase activity • зв'язування з іоном металу • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • transferase activity Клітинна компонента • комплекс Ґольджі • система ендомембран • late endosome • мембрана • цитоплазма • integral component of membrane • цитоскелет • ендоплазматичний ретикулум • perinuclear region of cytoplasm • гіалоплазма Біологічний процес • positive regulation of protein catabolic process in the vacuole • Убіквітин-залежний протеоліз • regulation of protein stability • protein localization to lysosome • protein deubiquitination • ubiquitin-dependent protein catabolic process Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	79589	66889
Ensembl	ENSG00000133135	ENSMUSG00000031438
UniProt	Q8TEB7	Q9D304
RefSeq (мРНК)	NM_194463 NM_024539	NM_001254761 NM_023270
RefSeq (білок)	NP_078815 NP_919445	NP_001241690 NP_075759
Локус (UCSC)	Хр. X: 106.69 – 106.8 Mb	Хр. X: 138.46 – 138.57 Mb
PubMed search	[1]	[2]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

RNF128 (англ. Ring finger protein 128, E3 ubiquitin protein ligase) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на X-хромосомі.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 428 амінокислот, а молекулярна маса — 46 521^[4].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MGPPPGAGVS		CRGGCGFSRL		LAWCFLLALS		PQAPGSRGAE		AVWTAYLNVS
WRVPHTGVNR		TVWELSEEGV		YGQDSPLEPV		AGVLVPPDGP		GALNACNPHT
NFTVPTVWGS		TVQVSWLALI		QRGGGCTFAD		KIHLAYERGA		SGAVIFNFPG
TRNEVIPMSH		PGAVDIVAIM		IGNLKGTKIL		QSIQRGIQVT		MVIEVGKKHG
PWVNHYSIFF		VSVSFFIITA		ATVGYFIFYS		ARRLRNARAQ		SRKQRQLKAD
AKKAIGRLQL		RTLKQGDKEI		GPDGDSCAVC		IELYKPNDLV		RILTCNHIFH
KTCVDPWLLE		HRTCPMCKCD		ILKALGIEVD		VEDGSVSLQV		PVSNEISNSA
SSHEEDNRSE		TASSGYASVQ		GTDEPPLEEH		VQSTNESLQL		VNHEANSVAV
DVIPHVDNPT		FEEDETPNQE		TAVREIKS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до трансфераз. Задіяний у таких біологічних процесах, як убіквітинування білків, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, мембрані.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
• Ichikawa D., Mizuno M., Yamamura T., Miyake S. (2011). GRAIL (gene related to anergy in lymphocytes) regulates cytoskeletal reorganization through ubiquitination and degradation of Arp2/3 subunit 5 and coronin 1A. J. Biol. Chem. 286: 43465—43474. PMID 22016387 doi:10.1074/jbc.M111.222711

Примітки

1. Human PubMed Reference:.
2. Mouse PubMed Reference:.
3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:21153 (англ.) . Архів оригіналу за 8 вересня 2015. Процитовано 13 вересня 2017. [Архівовано 2015-09-08 у Wayback Machine.]
4. UniProt, Q8TEB7 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 13 вересня 2017.

Див. також

• Хромосома X

Портал «Біологія»   Портал «Хімія»