RNF8

RNF8
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2CSW, 2PIE, 4AYC, 4ORH, 4WHV
Ідентифікатори
Символи	RNF8, hring finger protein 8
Зовнішні ІД	OMIM: 611685 MGI: 1929069 HomoloGene: 2944 GeneCards: RNF8
Онтологія гена
Молекулярна функція	• protein homodimerization activity; • GO:0031493 histone binding; • chromatin binding; • зв'язування з іоном металу; • GO:0050372 ubiquitin-protein transferase activity; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • ubiquitin protein ligase binding; • transferase activity; • identical protein binding; • zinc ion binding; • ubiquitin binding; • GO:1904264, GO:1904822, GO:0090622, GO:0090302 ubiquitin protein ligase activity;
Клітинна компонента	• site of double-strand break; • ubiquitin ligase complex; • нуклеоплазма; • хромосома; • теломера; • midbody; • клітинне ядро; • гіалоплазма; • цитоплазма;
Біологічний процес	• response to ionizing radiation; • histone H2A ubiquitination; • interstrand cross-link repair; • ubiquitin-dependent protein catabolic process; • protein K63-linked ubiquitination; • GO:1900404 positive regulation of DNA repair; • histone H2A K63-linked ubiquitination; • negative regulation of transcription elongation from RNA polymerase II promoter; • cellular response to DNA damage stimulus; • поділ клітини; • protein K48-linked ubiquitination; • Перемикання класу імуноглобулінів; • Убіквітин-залежний протеоліз; • spermatid development; • клітинний цикл; • histone H2B ubiquitination; • double-strand break repair via nonhomologous end joining; • GO:0035042 histone exchange; • protein autoubiquitination; • double-strand break repair; • GO:0100026 Репарація ДНК; • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	9025
	58230
	ENSG00000112130
	ENSMUSG00000090083
	O76064
	Q8VC56
	NM_003958; NM_183078
	NM_021419
	NP_003949; NP_898901
	NP_067394
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

RNF8 (англ. Ring finger protein 8) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 485 амінокислот, а молекулярна маса — 55 518^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MGEPGFFVTG	DRAGGRSWCL	RRVGMSAGWL	LLEDGCEVTV	GRGFGVTYQL
VSKICPLMIS	RNHCVLKQNP	EGQWTIMDNK	SLNGVWLNRA	RLEPLRVYSI
HQGDYIQLGV	PLENKENAEY	EYEVTEEDWE	TIYPCLSPKN	DQMIEKNKEL
RTKRKFSLDE	LAGPGAEGPS	NLKSKINKVS	CESGQPVKSQ	GKGEVASTPS
DNLDPKLTAL	EPSKTTGAPI	YPGFPKVTEV	HHEQKASNSS	ASQRSLQMFK
VTMSRILRLK	IQMQEKHEAV	MNVKKQTQKG	NSKKVVQMEQ	ELQDLQSQLC
AEQAQQQARV	EQLEKTFQEE	EQHLQGLEIA	QGEKDLKQQL	AQALQEHWAL
MEELNRSKKD	FEAIIQAKNK	ELEQTKEEKE	KMQAQKEEVL	SHMNDVLENE
LQCIICSEYF	IEAVTLNCAH	SFCSYCINEW	MKRKIECPIC	RKDIKSKTYS
LVLDNCINKM	VNNLSSEVKE	RRIVLIRERK	AKRLF

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, регуляторів хроматину, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинний цикл, поділ клітини, пошкодження ДНК, репарація ДНК, мітоз, убіквітинування білків, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, хромосомах.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Wang B., Elledge S.J. (2007). Ubc13/Rnf8 ubiquitin ligases control foci formation of the Rap80/Abraxas/Brca1/Brcc36 complex in response to DNA damage. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 104: 20759—20763. PMID 18077395 DOI:10.1073/pnas.0710061104
Plans V., Guerra-Rebollo M., Thomson T.M. (2008). Regulation of mitotic exit by the RNF8 ubiquitin ligase. Oncogene. 27: 1355—1365. PMID 17724460 DOI:10.1038/sj.onc.1210782
Sakasai R., Tibbetts R. (2008). RNF8-dependent and RNF8-independent regulation of 53BP1 in response to DNA damage. J. Biol. Chem. 283: 13549—13555. PMID 18337245 DOI:10.1074/jbc.M710197200
Gong Z., Cho Y.-W., Kim J.-E., Ge K., Chen J. (2009). Accumulation of Pax2 transactivation domain interaction protein (PTIP) at sites of DNA breaks via RNF8-dependent pathway is required for cell survival after DNA damage. J. Biol. Chem. 284: 7284—7293. PMID 19124460 DOI:10.1074/jbc.M809158200
Shanbhag N.M., Rafalska-Metcalf I.U., Balane-Bolivar C., Janicki S.M., Greenberg R.A. (2010). ATM-dependent chromatin changes silence transcription in cis to DNA double-strand breaks. Cell. 141: 970—981. PMID 20550933 DOI:10.1016/j.cell.2010.04.038

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10071 (англ.) . Архів оригіналу за 30 травня 2017. Процитовано 6 вересня 2017. [Архівовано 2017-05-30 у Wayback Machine.]
↑ UniProt, O76064 (англ.) . Архів оригіналу за 7 серпня 2017. Процитовано 6 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 6

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10071 (англ.) . Архів оригіналу за 30 травня 2017. Процитовано 6 вересня 2017. [Архівовано 2017-05-30 у Wayback Machine.]

[UniProt-4] UniProt, O76064 (англ.) . Архів оригіналу за 7 серпня 2017. Процитовано 6 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]