SCARB1

SCARB1
Ідентифікатори
Символи	SCARB1, CD36L1, CLA-1, CLA1, HDLQTL6, SR-BI, SRB1, scavenger receptor class B member 1
Зовнішні ІД	OMIM: 601040 MGI: 893578 HomoloGene: 21132 GeneCards: SCARB1
Пов'язані генетичні захворювання
Рак нирки[1]
Реагує на сполуку
Viroporin 3a[2]
Онтологія гена Молекулярна функція • apolipoprotein binding • protein homodimerization activity • virus receptor activity • transporter activity • high-density lipoprotein particle receptor activity • phosphatidylserine binding • apolipoprotein A-I binding • lipopolysaccharide binding • low-density lipoprotein particle binding • 1-phosphatidylinositol binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • high-density lipoprotein particle binding • lipopolysaccharide immune receptor activity • amyloid-beta binding • scavenger receptor activity Клітинна компонента • цитоплазма • integral component of membrane • endocytic vesicle membrane • внутрішньоклітинна мембранна органела • мембрана • клітинна мембрана • integral component of plasma membrane • cell surface • lysosomal membrane • caveola • екзосома • microvillus membrane Біологічний процес • cholesterol import • positive regulation of triglyceride biosynthetic process • regulation of phosphatidylcholine catabolic process • recognition of apoptotic cell • lipid transport • low-density lipoprotein particle clearance • blood vessel endothelial cell migration • positive regulation of cholesterol storage • phospholipid transport • cholesterol transport • Загоєння ран • cholesterol catabolic process • рецептор-опосередкований ендоцитоз • high-density lipoprotein particle remodeling • positive regulation of endothelial cell migration • androgen biosynthetic process • vitamin transmembrane transport • positive regulation of nitric-oxide synthase activity • endothelial cell proliferation • GO:0015921 lipopolysaccharide transport • cholesterol efflux • phagocytosis, recognition • viral entry into host cell • intestinal absorption • cholesterol homeostasis • regulation of phagocytosis • GO:0051856 adhesion of symbiont to host • GO:0022415 viral process • detection of lipopolysaccharide • triglyceride homeostasis • reverse cholesterol transport • lipopolysaccharide-mediated signaling pathway • high-density lipoprotein particle clearance Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	949	20778
Ensembl	ENSG00000073060	ENSMUSG00000037936
UniProt	Q8WTV0	Q61009
RefSeq (мРНК)	NM_005505 NM_001082959	NM_001205082 NM_001205083 NM_016741
RefSeq (білок)	NP_001076428 NP_005496 NP_001354910 NP_001354911 NP_001354912 NP_001354913 NP_001354914 NP_001354915 NP_001354916 NP_001354917 NP_001354918	NP_001192011 NP_001192012 NP_058021
Локус (UCSC)	Хр. 12: 124.78 – 124.88 Mb	Хр. 5: 125.35 – 125.42 Mb
PubMed search	[3]	[4]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SCARB1 (англ. Scavenger receptor class B member 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.^[5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 552 амінокислот, а молекулярна маса — 60 878^[6].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MGCSAKARWA		AGALGVAGLL		CAVLGAVMIV		MVPSLIKQQV		LKNVRIDPSS
LSFNMWKEIP		IPFYLSVYFF		DVMNPSEILK		GEKPQVRERG		PYVYREFRHK
SNITFNNNDT		VSFLEYRTFQ		FQPSKSHGSE		SDYIVMPNIL		VLGAAVMMEN
KPMTLKLIMT		LAFTTLGERA		FMNRTVGEIM		WGYKDPLVNL		INKYFPGMFP
FKDKFGLFAE		LNNSDSGLFT		VFTGVQNISR		IHLVDKWNGL		SKVDFWHSDQ
CNMINGTSGQ		MWPPFMTPES		SLEFYSPEAC		RSMKLMYKES		GVFEGIPTYR
FVAPKTLFAN		GSIYPPNEGF		CPCLESGIQN		VSTCRFSAPL		FLSHPHFLNA
DPVLAEAVTG		LHPNQEAHSL		FLDIHPVTGI		PMNCSVKLQL		SLYMKSVAGI
GQTGKIEPVV		LPLLWFAESG		AMEGETLHTF		YTQLVLMPKV		MHYAQYVLLA
LGCVLLLVPV		ICQIRSQVGA		GQRAARADSH		SLACWGKGAS		DRTLWPTAAW
SPPPAAVLRL		CRSGSGHCWG		LRSTLASFAC		RVATTLPVLE		GLGPSLGGGT
GS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів клітини-хазяїна для входу вірусу, рецепторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як взаємодія хазяїн-вірус, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Kawasaki Y., Nakagawa A., Nagaosa K., Shiratsuchi A., Nakanishi Y. (2002). Phosphatidylserine binding of class B scavenger receptor type I, a phagocytosis receptor of testicular Sertoli cells. J. Biol. Chem. 277: 27559—27566. PMID 12016218 DOI:10.1074/jbc.M202879200
• Philips J.A., Rubin E.J., Perrimon N. (2005). Drosophila RNAi screen reveals CD36 family member required for mycobacterial infection. Science. 309: 1251—1253. PMID 16020694 DOI:10.1126/science.1116006
• Calvo D., Vega M. (1993). Identification, primary structure and distribution of CLA-1, a novel member of the CD36/LIMPII gene family. J. Biol. Chem. 268: 18929—18935. PMID 7689561
• Webb N.R., de Villiers W.J., Connell P.M., de Beer F.C., van der Westhuyzen D.R. (1997). Alternative forms of the scavenger receptor BI (SR-BI). J. Lipid Res. 38: 1490—1495. PMID 9254074

Примітки

1. Захворювання, генетично пов'язані з SCARB1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
2. Сполуки, які фізично взаємодіють з SCARB1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
3. Human PubMed Reference:.
4. Mouse PubMed Reference:.
5. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1664 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.
6. UniProt, Q8WTV0 (англ.) . Архів оригіналу за 14 жовтня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

• Хромосома 12

Портал «Біологія»   Портал «Хімія»