SERPINF1

SERPINF1
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1IMV
Ідентифікатори
Символи	SERPINF1, EPC-1, OI12, OI6, PEDF, PIG35, serpin family F member 1
Зовнішні ІД	OMIM: 172860 MGI: 108080 HomoloGene: 1965 GeneCards: SERPINF1
Пов'язані генетичні захворювання
	osteogenesis imperfecta type 6
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • serine-type endopeptidase inhibitor activity;
Клітинна компонента	• GO:0005578 Позаклітинна матриця; • Меланосома; • extracellular region; • базальна мембрана; • аксон; • soma; • perinuclear region of cytoplasm; • аксонний горбик; • екзосома; • міжклітинний простір; • collagen-containing extracellular matrix;
Біологічний процес	• cellular response to retinoic acid; • розвиток нирки; • GO:0010260 старіння людини; • response to arsenic-containing substance; • negative regulation of gene expression; • cellular response to dexamethasone stimulus; • negative regulation of endothelial cell migration; • multicellular organism development; • cellular response to cobalt ion; • retina development in camera-type eye; • короткочасна пам'ять; • negative regulation of epithelial cell proliferation involved in prostate gland development; • positive regulation of neuron projection development; • ovulation cycle; • negative regulation of angiogenesis; • проліферація; • negative regulation of inflammatory response; • cellular response to glucose stimulus; • response to acidic pH; • negative regulation of neuron death; • negative regulation of endopeptidase activity; • positive regulation of neurogenesis;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	5176
	20317
	ENSG00000132386; ENSG00000282307
	ENSMUSG00000000753
	P36955
	P97298
	NM_002615; NM_001329903; NM_001329904; NM_001329905
	NM_011340
	NP_001316832; NP_001316833; NP_001316834; NP_002606
	NP_035470
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

SERPINF1 (англ. Serpin family F member 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми. ^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 418 амінокислот, а молекулярна маса — 46 312^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MQALVLLLCI	GALLGHSSCQ	NPASPPEEGS	PDPDSTGALV	EEEDPFFKVP
VNKLAAAVSN	FGYDLYRVRS	STSPTTNVLL	SPLSVATALS	ALSLGAEQRT
ESIIHRALYY	DLISSPDIHG	TYKELLDTVT	APQKNLKSAS	RIVFEKKLRI
KSSFVAPLEK	SYGTRPRVLT	GNPRLDLQEI	NNWVQAQMKG	KLARSTKEIP
DEISILLLGV	AHFKGQWVTK	FDSRKTSLED	FYLDEERTVR	VPMMSDPKAV
LRYGLDSDLS	CKIAQLPLTG	SMSIIFFLPL	KVTQNLTLIE	ESLTSEFIHD
IDRELKTVQA	VLTVPKLKLS	YEGEVTKSLQ	EMKLQSLFDS	PDFSKITGKP
IKLTQVEHRA	GFEWNEDGAG	TTPSPGLQPA	HLTFPLDYHL	NQPFIFVLRD
TDTGALLFIG	KILDPRGP

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Секретований назовні.

Література

Steele F.R., Chader G.J., Johnson L.V., Tombran-Tink J. (1993). Pigment epithelium-derived factor: neurotrophic activity and identification as a member of the serine protease inhibitor gene family. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 90: 1526—1530. PMID 8434014 doi:10.1073/pnas.90.4.1526
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Petersen S.V., Valnickova Z., Enghild J.J. (2003). Pigment-epithelium-derived factor (PEDF) occurs at a physiologically relevant concentration in human blood: purification and characterization. Biochem. J. 374: 199—206. PMID 12737624 doi:10.1042/BJ20030313
Becerra S.P., Sagasti A., Spinella P., Notario V. (1995). Pigment epithelium-derived factor behaves like a noninhibitory serpin. Neurotrophic activity does not require the serpin reactive loop. J. Biol. Chem. 270: 25992—25999. PMID 7592790 doi:10.1074/jbc.270.43.25992
Maik-Rachline G., Shaltiel S., Seger R. (2005). Extracellular phosphorylation converts pigment epithelium-derived factor from a neurotrophic to an antiangiogenic factor. Blood. 105: 670—678. PMID 15374885 doi:10.1182/blood-2004-04-1569
Simonovic M., Gettins P.G.W., Volz K. (2001). Crystal structure of human PEDF, a potent anti-angiogenic and neurite growth-promoting factor. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 98: 11131—11135. PMID 11562499 doi:10.1073/pnas.211268598

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з SERPINF1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:8824 (англ.) . Процитовано 6 лютого 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, P36955 (англ.) . Архів оригіналу за 7 жовтня 2016. Процитовано 6 лютого 2017.

Див. також

Хромосома 17

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Захворювання, генетично пов'язані з SERPINF1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:8824 (англ.) . Процитовано 6 лютого 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-5] UniProt, P36955 (англ.) . Архів оригіналу за 7 жовтня 2016. Процитовано 6 лютого 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]