SHANK1

SHANK1
Ідентифікатори
Символи	SHANK1, SPANK-1, SSTRIP, synamon, SH3 and multiple ankyrin repeat domains 1
Зовнішні ІД	OMIM: 604999 MGI: 3613677 HomoloGene: 22949 GeneCards: SHANK1
Онтологія гена Молекулярна функція • somatostatin receptor binding • SH3 domain binding • ankyrin repeat binding • scaffold protein binding • protein C-terminus binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • synaptic receptor adaptor activity • identical protein binding • ionotropic glutamate receptor binding • signaling receptor complex adaptor activity • GO:0032403 protein-containing complex binding Клітинна компонента • цитоплазма • postsynaptic membrane • мембрана • dendritic spine • синапс • excitatory synapse • внутрішньоклітинний • NMDA selective glutamate receptor complex • міжклітинні контакти • дендрит (нейробіологія) • neuron projection • ionotropic glutamate receptor complex • GO:0097483, GO:0097481 постсинаптичне ущільнення • гіалоплазма • клітинна мембрана • Schaffer collateral - CA1 synapse • glutamatergic synapse • neuron spine Біологічний процес • диференціація клітин • olfactory behavior • associative learning • neuromuscular process controlling balance • negative regulation of actin filament bundle assembly • positive regulation of dendritic spine development • нейробіологія розвитку • regulation of AMPA receptor activity • dendritic spine morphogenesis • vocalization behavior • adult behavior • довготривала пам'ять • synapse maturation • positive regulation of excitatory postsynaptic potential • соціальна поведінка • Звикання • determination of affect • righting reflex • protein localization to synapse • GO:0034622 protein-containing complex assembly • postsynapse organization • synapse assembly • brain morphogenesis • synaptic assembly at neuromuscular junction • positive regulation of synaptic transmission, glutamatergic • довготривала потенціація • postsynaptic density assembly Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	50944	243961
Ensembl	ENSG00000161681	ENSMUSG00000038738
UniProt	Q9Y566	D3YZU1
RefSeq (мРНК)	NM_016148	NM_001034115
RefSeq (білок)	NP_057232	NP_001029287
Локус (UCSC)	Хр. 19: 50.66 – 50.72 Mb	Хр. 7: 43.96 – 44.01 Mb
PubMed search	[1]	[2]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SHANK1 (англ. SH3 and multiple ankyrin repeat domains 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 161 амінокислот, а молекулярна маса — 224 959^[4].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MTHSPATSED		EERHSASECP		EGGSESDSSP		DGPGRGPRGT		RGQGSGAPGS
LASVRGLQGR		SMSVPDDAHF		SMMVFRIGIP		DLHQTKCLRF		NPDATIWTAK
QQVLCALSES		LQDVLNYGLF		QPATSGRDAN		FLEEERLLRE		YPQSFEKGVP
YLEFRYKTRV		YKQTNLDEKQ		LAKLHTKTGL		KKFLEYVQLG		TSDKVARLLD
KGLDPNYHDS		DSGETPLTLA		AQTEGSVEVI		RTLCLGGAHI		DFRARDGMTA
LHKAACARHC		LALTALLDLG		GSPNYKDRRG		LTPLFHTAMV		GGDPRCCELL
LFNRAQLGIA		DENGWQEIHQ		ACQRGHSQHL		EHLLFYGAEP		GAQNASGNTA
LHICALYNKE		TCARILLYRG		ADKDVKNNNG		QTPFQVAVIA		GNFELGELIR
NHREQDVVPF		QESPKYAARR		RGPPGTGLTV		PPALLRANSD		TSMALPDWMV
FSAPGAASSG		APGPTSGSQG		QSQPSAPTTK		LSSGTLRSAS		SPRGARARSP
SRGRHPEDAK		RQPRGRPSSS		GTPREGPAGG		TGGSGGPGGS		LGSRGRRRKL
YSAVPGRSFM		AVKSYQAQAE		GEISLSKGEK		IKVLSIGEGG		FWEGQVKGRV
GWFPSDCLEE		VANRSQESKQ		ESRSDKAKRL		FRHYTVGSYD		SFDAPSLMDG
IGPGSDYIIK		EKTVLLQKKD		SEGFGFVLRG		AKAQTPIEEF		TPTPAFPALQ
YLESVDEGGV		AWRAGLRMGD		FLIEVNGQNV		VKVGHRQVVN		MIRQGGNTLM
VKVVMVTRHP		DMDEAVHKKA		PQQAKRLPPP		TISLRSKSMT		SELEEMEYEQ
QPAPVPSMEK		KRTVYQMALN		KLDEILAAAQ		QTISASESPG		PGGLASLGKH
RPKGFFATES		SFDPHHRAQP		SYERPSFLPP		GPGLMLRQKS		IGAAEDDRPY
LAPPAMKFSR		SLSVPGSEDI		PPPPTTSPPE		PPYSTPPVPS		SSGRLTPSPR
GGPFNPGSGG		PLPASSPASF		DGPSPPDTRV		GSREKSLYHS		GPLPPAHHHP
PHHHHHHAPP		PQPHHHHAHP		PHPPEMETGG		SPDDPPPRLA		LGPQPSLRGW
RGGGPSPTPG		APSPSHHGSA		GGGGGSSQGP		ALRYFQLPPR		AASAAMYVPA
RSGRGRKGPL		VKQTKVEGEP		QKGGGLPPAP		SPTSPASPQP		PPAVAAPSEK
NSIPIPTIII		KAPSTSSSGR		SSQGSSTEAE		PPTQPEPTGG		GGGGGSSPSP
APAMSPVPPS		PSPVPTPASP		SGPATLDFTS		QFGAALVGAA		RREGGWQNEA
RRRSTLFLST		DAGDEDGGDG		GLGTGAAPGP		RLRHSKSIDE		GMFSAEPYLR
LESAGSGAGY		GGYGAGSRAY		GGGGGSSAFT		SFLPPRPLVH		PLTGKALDPA
SPLGLALAAR		ERALKESSEG		GGAPQPPPRP		PSPRYEAPPP		TPHHHSPHAH
HEPVLRLWGA		SPPDPARREL		GYRAGLGSQE		KSLPASPPAA		RRSLLHRLPP
TAPGVGPLLL		QLGTEPPAPH		PGVSKPWRSA		APEEPERLPL		HVRFLENCQP
RAPVTSGRGP		PSEDGPGVPP		PSPRRSVPPS		PTSPRASEEN		GLPLLVLPPP
APSVDVEDGE		FLFVEPLPPP		LEFSNSFEKP		ESPLTPGPPH		PLPDTPAPAT
PLPPVPPPAV		AAAPPTLDST		ASSLTSYDSE		VATLTQGASA		APGDPHPPGP
PAPAAPAPAA		PQPGPDPPPG		TDSGIEEVDS		RSSSDHPLET		ISSASTLSSL
SAEGGGSAGG		GGGAGAGVAS		GPELLDTYVA		YLDGQAFGGS		STPGPPYPPQ
LMTPSKLRGR		ALGASGGLRP		GPSGGLRDPV		TPTSPTVSVT		GAGTDGLLAL
RACSGPPTAG		VAGGPVAVEP		EVPPVPLPTA		SSLPRKLLPW		EEGPGPPPPP
LPGPLAQPQA		SALATVKASI		ISELSSKLQQ		FGGSSAAGGA		LPWARGGSGG
GGDSHHGGAS		YVPERTSSLQ		RQRLSDDSQS		SLLSKPVSSL		FQNWPKPPLP
PLPTGTGVSP		TAAAAPGATS		PSASSSSTST		RHLQGVEFEM		RPPLLRRAPS
PSLLPASEHK		VSPAPRPSSL		PILPSGPLYP		GLFDIRGSPT		GGAGGSADPF
APVFVPPHPG		ISGGLGGALS		GASRSLSPTR		LLSLPPDKPF		GAKPLGFWTK
FDVADWLEWL		GLAEHRAQFL		DHEIDGSHLP		ALTKEDYVDL		GVTRVGHRMN
IDRALKFFLE		R

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як диференціація клітин, нейрогенез, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, мембрані, клітинних контактах, синапсах.

Література

• Zitzer H., Hoenck H.-H., Baechner D., Richter D., Kreienkamp H.-J. (1999). Somatostatin receptor interacting protein defines a novel family of multidomain proteins present in human and rodent brain. J. Biol. Chem. 274: 32997—33001. PMID 10551867 DOI:10.1074/jbc.274.46.32997
• Soltau M., Richter D., Kreienkamp H.-J. (2002). The insulin receptor substrate IRSp53 links postsynaptic shank1 to the small G-protein cdc42. Mol. Cell. Neurosci. 21: 575—583. PMID 12504591 DOI:10.1006/mcne.2002.1201
• Sheng M., Kim E. (2000). The Shank family of scaffold proteins. J. Cell Sci. 113: 1851—1856. PMID 10806096

Примітки

1. Human PubMed Reference:.
2. Mouse PubMed Reference:.
3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:15474 (англ.) . Архів оригіналу за 14 липня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
4. UniProt, Q9Y566 (англ.) . Архів оригіналу за 12 жовтня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

• Хромосома 19

Портал «Біологія»   Портал «Хімія»