SLBP

SLBP
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2KJM, 4QOZ
Ідентифікатори
Символи	SLBP, HBP, stem-loop binding protein
Зовнішні ІД	OMIM: 602422 MGI: 108402 HomoloGene: 31389 GeneCards: SLBP
Онтологія гена
Молекулярна функція	• histone pre-mRNA DCP binding; • histone pre-mRNA stem-loop binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • mRNA binding; • RNA binding; • identical protein binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • histone pre-mRNA 3'end processing complex; • нуклеоплазма; • клітинне ядро; • ядерце; • гіалоплазма; • Рибонуклеопротеїни;
Біологічний процес	• termination of RNA polymerase II transcription; • mRNA transport; • mRNA 3'-end processing by stem-loop binding and cleavage; • mRNA processing; • mRNA export from nucleus; • nuclear DNA replication; • histone mRNA metabolic process; • cell cycle phase transition;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	7884
	20492
	ENSG00000163950
	ENSMUSG00000004642
	Q14493; Q53XR2
	P97440
	NM_001306074; NM_001306075; NM_006527
	NM_001289724; NM_001289725; NM_009193
	NP_001293003; NP_001293004; NP_006518; NP_006518.1
	NP_001276653; NP_001276654; NP_033219
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

SLBP (англ. Stem-loop binding protein) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 270 амінокислот, а молекулярна маса — 31 286^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MACRPRSPPR	HQSRCDGDAS	PPSPARWSLG	RKRRADGRRW	RPEDAEEAEH
RGAERRPESF	TTPEGPKPRS	RCSDWASAVE	EDEMRTRVNK	EMARYKRKLL
INDFGRERKS	SSGSSDSKES	MSTVPADFET	DESVLMRRQK	QINYGKNTIA
YDRYIKEVPR	HLRQPGIHPK	TPNKFKKYSR	RSWDQQIKLW	KVALHFWDPP
AEEGCDLQEI	HPVDLESAES	SSEPQTSSQD	DFDVYSGTPT	KVRHMDSQVE
DEFDLEACLT	EPLRDFSAMS

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рибонуклеопротеїнів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як процесінг мРНК, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

Wang Z.-F., Whitfield M.L., Ingledue T.C. III, Dominski Z., Marzluff W.F. (1996). The protein that binds the 3' end of histone mRNA: a novel RNA-binding protein required for histone pre-mRNA processing. Genes Dev. 10: 3028—3040. PMID 8957003 doi:10.1101/gad.10.23.3028
Martin F., Schaller A., Eglite S., Schuemperli D., Mueller B. (1997). The gene for histone RNA hairpin binding protein is located on human chromosome 4 and encodes a novel type of RNA binding protein. EMBO J. 16: 769—778. PMID 9049306 doi:10.1093/emboj/16.4.769
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Dominski Z., Erkmann J.A., Yang X., Sanchez R., Marzluff W.F. (2002). A novel zinc finger protein is associated with U7 snRNP and interacts with the stem-loop binding protein in the histone pre-mRNP to stimulate 3'-end processing. Genes Dev. 16: 58—71. PMID 11782445 doi:10.1101/gad.932302
Kaygun H., Marzluff W.F. (2005). Regulated degradation of replication-dependent histone mRNAs requires both ATR and Upf1. Nat. Struct. Mol. Biol. 12: 794—800. PMID 16086026 doi:10.1038/nsmb972
Yang X.-C., Purdy M., Marzluff W.F., Dominski Z. (2006). Characterization of 3'hExo, a 3' exonuclease specifically interacting with the 3' end of histone mRNA. J. Biol. Chem. 281: 30447—30454. PMID 16912046 doi:10.1074/jbc.M602947200

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10904 (англ.) . Процитовано 30 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q14493 (англ.) . Архів оригіналу за 31 серпня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 4

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10904 (англ.) . Процитовано 30 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-4] UniProt, Q14493 (англ.) . Архів оригіналу за 31 серпня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]