SLIT3

SLIT3
Ідентифікатори
Символи	SLIT3, MEGF5, SLIL2, SLIT1, Slit-3, slit2, slit guidance ligand 3
Зовнішні ІД	OMIM: 603745 MGI: 1315202 HomoloGene: 2303 GeneCards: SLIT3
Онтологія гена Молекулярна функція • Roundabout binding • calcium ion binding • heparin binding Клітинна компонента • extracellular region • мітохондрія • міжклітинний простір Біологічний процес • negative regulation of chemokine-mediated signaling pathway • chemorepulsion involved in embryonic olfactory bulb interneuron precursor migration • диференціація клітин • negative chemotaxis • Roundabout signaling pathway • negative regulation of gene expression • нейробіологія розвитку • multicellular organism development • cellular response to hormone stimulus • negative regulation of cell growth • response to cortisol • apoptotic process involved in luteolysis • animal organ morphogenesis • axon extension involved in axon guidance • negative regulation of cell population proliferation • axon guidance • aortic valve morphogenesis • atrioventricular valve morphogenesis • ventricular septum morphogenesis Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	6586	20564
Ensembl	ENSG00000184347	ENSMUSG00000056427
UniProt	O75094	Q9WVB4
RefSeq (мРНК)	NM_003062 NM_001271946	NM_011412
RefSeq (білок)	NP_001258875 NP_003053	NP_035542
Локус (UCSC)	Хр. 5: 168.66 – 169.3 Mb	Хр. 11: 35.01 – 35.6 Mb
PubMed search	[1]	[2]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SLIT3 (англ. Slit guidance ligand 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 523 амінокислот, а молекулярна маса — 167 713^[4].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAPGWAGVGA		AVRARLALAL		ALASVLSGPP		AVACPTKCTC		SAASVDCHGL
GLRAVPRGIP		RNAERLDLDR		NNITRITKMD		FAGLKNLRVL		HLEDNQVSVI
ERGAFQDLKQ		LERLRLNKNK		LQVLPELLFQ		STPKLTRLDL		SENQIQGIPR
KAFRGITDVK		NLQLDNNHIS		CIEDGAFRAL		RDLEILTLNN		NNISRILVTS
FNHMPKIRTL		RLHSNHLYCD		CHLAWLSDWL		RQRRTVGQFT		LCMAPVHLRG
FNVADVQKKE		YVCPAPHSEP		PSCNANSISC		PSPCTCSNNI		VDCRGKGLME
IPANLPEGIV		EIRLEQNSIK		AIPAGAFTQY		KKLKRIDISK		NQISDIAPDA
FQGLKSLTSL		VLYGNKITEI		VKGLFDGLVS		LQLLLLNANK		INCLRVNTFQ
DLQNLNLLSL		YDNKLQTISK		GLFAPLQSIQ		TLHLAQNPFV		CDCHLKWLAD
YLQDNPIETS		GARCSSPRRL		ANKRISQIKS		KKFRCSGSED		YRSRFSSECF
MDLVCPEKCR		CEGTIVDCSN		QKLVRIPSHL		PEYVTDLRLN		DNEVSVLEAT
GIFKKLPNLR		KINLSNNKIK		EVREGAFDGA		ASVQELMLTG		NQLETVHGRV
FRGLSGLKTL		MLRSNLIGCV		SNDTFAGLSS		VRLLSLYDNR		ITTITPGAFT
TLVSLSTINL		LSNPFNCNCH		LAWLGKWLRK		RRIVSGNPRC		QKPFFLKEIP
IQDVAIQDFT		CDGNEESSCQ		LSPRCPEQCT		CMETVVRCSN		KGLRALPRGM
PKDVTELYLE		GNHLTAVPRE		LSALRHLTLI		DLSNNSISML		TNYTFSNMSH
LSTLILSYNR		LRCIPVHAFN		GLRSLRVLTL		HGNDISSVPE		GSFNDLTSLS
HLALGTNPLH		CDCSLRWLSE		WVKAGYKEPG		IARCSSPEPM		ADRLLLTTPT
HRFQCKGPVD		INIVAKCNAC		LSSPCKNNGT		CTQDPVELYR		CACPYSYKGK
DCTVPINTCI		QNPCQHGGTC		HLSDSHKDGF		SCSCPLGFEG		QRCEINPDDC
EDNDCENNAT		CVDGINNYVC		ICPPNYTGEL		CDEVIDHCVP		ELNLCQHEAK
CIPLDKGFSC		ECVPGYSGKL		CETDNDDCVA		HKCRHGAQCV		DTINGYTCTC
PQGFSGPFCE		HPPPMVLLQT		SPCDQYECQN		GAQCIVVQQE		PTCRCPPGFA
GPRCEKLITV		NFVGKDSYVE		LASAKVRPQA		NISLQVATDK		DNGILLYKGD
NDPLALELYQ		GHVRLVYDSL		SSPPTTVYSV		ETVNDGQFHS		VELVTLNQTL
NLVVDKGTPK		SLGKLQKQPA		VGINSPLYLG		GIPTSTGLSA		LRQGTDRPLG
GFHGCIHEVR		INNELQDFKA		LPPQSLGVSP		GCKSCTVCKH		GLCRSVEKDS
VVCECRPGWT		GPLCDQEARD		PCLGHRCHHG		KCVATGTSYM		CKCAEGYGGD
LCDNKNDSAN		ACSAFKCHHG		QCHISDQGEP		YCLCQPGFSG		EHCQQENPCL
GQVVREVIRR		QKGYASCATA		SKVPIMECRG		GCGPQCCQPT		RSKRRKYVFQ
CTDGSSFVEE		VERHLECGCL		ACS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до білків розвитку. Задіяний у таких біологічних процесах, як диференціація клітин, нейрогенез, альтернативний сплайсинг, поліморфізм. Секретований назовні.

Література

• Itoh A., Miyabayashi T., Ohno M., Sakano S. (1998). Cloning and expressions of three mammalian homologues of Drosophila slit suggest possible roles for Slit in the formation and maintenance of the nervous system. Brain Res. Mol. Brain Res. 62: 175—186. PMID 9813312 doi:10.1016/S0169-328X(98)00224-1
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504

Примітки

1. Human PubMed Reference:.
2. Mouse PubMed Reference:.
3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11087 (англ.) . Процитовано 5 вересня 2017.
4. UniProt, O75094 (англ.) . Архів оригіналу за 6 серпня 2017. Процитовано 5 вересня 2017.

Див. також

• Хромосома 5

Портал «Біологія»   Портал «Хімія»