SLITRK6

SLITRK6
Ідентифікатори
Символи	SLITRK6, DFNMYP, SLIT and NTRK like family member 6
Зовнішні ІД	OMIM: 609681 MGI: 2443198 HomoloGene: 12986 GeneCards: SLITRK6
Пов'язані генетичні захворювання
high myopia-sensorineural deafness syndrome[1]
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	84189	239250
Ensembl	ENSG00000184564	ENSMUSG00000045871
UniProt	Q9H5Y7	Q8C110
RefSeq (мРНК)	NM_032229	NM_175499
RefSeq (білок)	NP_115605	NP_780708
Локус (UCSC)	Хр. 13: 85.79 – 85.81 Mb	Хр. 14: 110.99 – 110.99 Mb
PubMed search	[2]	[3]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SLITRK6 (англ. SLIT and NTRK like family member 6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 13-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 841 амінокислот, а молекулярна маса — 95 110^[5].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MKLWIHLFYS		SLLACISLHS		QTPVLSSRGS		CDSLCNCEEK		DGTMLINCEA
KGIKMVSEIS		VPPSRPFQLS		LLNNGLTMLH		TNDFSGLTNA		ISIHLGFNNI
ADIEIGAFNG		LGLLKQLHIN		HNSLEILKED		TFHGLENLEF		LQADNNFITV
IEPSAFSKLN		RLKVLILNDN		AIESLPPNIF		RFVPLTHLDL		RGNQLQTLPY
VGFLEHIGRI		LDLQLEDNKW		ACNCDLLQLK		TWLENMPPQS		IIGDVVCNSP
PFFKGSILSR		LKKESICPTP		PVYEEHEDPS		GSLHLAATSS		INDSRMSTKT
TSILKLPTKA		PGLIPYITKP		STQLPGPYCP		IPCNCKVLSP		SGLLIHCQER
NIESLSDLRP		PPQNPRKLIL		AGNIIHSLMK		SDLVEYFTLE		MLHLGNNRIE
VLEEGSFMNL		TRLQKLYLNG		NHLTKLSKGM		FLGLHNLEYL		YLEYNAIKEI
LPGTFNPMPK		LKVLYLNNNL		LQVLPPHIFS		GVPLTKVNLK		TNQFTHLPVS
NILDDLDLLT		QIDLEDNPWD		CSCDLVGLQQ		WIQKLSKNTV		TDDILCTSPG
HLDKKELKAL		NSEILCPGLV		NNPSMPTQTS		YLMVTTPATT		TNTADTILRS
LTDAVPLSVL		ILGLLIMFIT		IVFCAAGIVV		LVLHRRRRYK		KKQVDEQMRD
NSPVHLQYSM		YGHKTTHHTT		ERPSASLYEQ		HMVSPMVHVY		RSPSFGPKHL
EEEEERNEKE		GSDAKHLQRS		LLEQENHSPL		TGSNMKYKTT		NQSTEFLSFQ
DASSLYRNIL		EKERELQQLG		ITEYLRKNIA		QLQPDMEAHY		PGAHEELKLM
ETLMYSRPRK		VLVEQTKNEY		FELKANLHAE		PDYLEVLEQQ		T

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Aruga J., Yokota N., Mikoshiba K. (2003). Human SLITRK family genes: genomic organization and expression profiling in normal brain and brain tumor tissue. Gene. 315: 87—94. PMID 14557068 DOI:10.1016/S0378-1119(03)00715-7

Примітки

1. Захворювання, генетично пов'язані з SLITRK6 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
2. Human PubMed Reference:.
3. Mouse PubMed Reference:.
4. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:23503 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.
5. UniProt, Q9H5Y7 (англ.) . Архів оригіналу за 26 лютого 2018. Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

• Хромосома 13

Портал «Біологія»   Портал «Хімія»