SLX4

SLX4
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Ідентифікатори
Символи SLX4, BTBD12, FANCP, MUS312, SLX4 structure-specific endonuclease subunit
Зовнішні ІД OMIM: 613278 MGI: 106299 HomoloGene: 23770 GeneCards: SLX4
Пов'язані генетичні захворювання
Fanconi anemia complementation group P[1]
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
NM_032444
NM_177472
RefSeq (білок)
NP_115820
Локус (UCSC) Хр. 16: 3.58 – 3.61 Mb Хр. 16: 3.98 – 4 Mb
PubMed search [2] [3]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

SLX4 (англ. SLX4 structure-specific endonuclease subunit) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 834 амінокислот, а молекулярна маса — 200 012[5].

Послідовність амінокислот
1020304050
MKLSVNEAQLGFYLGSLSHLSACPGIDPRSSEDQPESLKTGQMMDESDED
FKELCASFFQRVKKHGIKEVSGERKTQKAASNGTQIRSKLKRTKQTATKT
KTLQGPAEKKPPSGSQAPRTKKQRVTKWQASEPAHSVNGEGGVLASAPDP
PVLRETAQNTQTGNQQEPSPNLSREKTRENVPNSDSQPPPSCLTTAVPSP
SKPRTAQLVLQRMQQFKRADPERLRHASEECSLEAAREENVPKDPQEEMM
AGNVYGLGPPAPESDAAVALTLQQEFARVGASAHDDSLEEKGLFFCQICQ
KNLSAMNVTRREQHVNRCLDEAEKTLRPSVPQIPECPICGKPFLTLKSRT
SHLKQCAVKMEVGPQLLLQAVRLQTAQPEGSSSPPMFSFSDHSRGLKRRG
PTSKKEPRKRRKVDEAPSEDLLVAMALSRSEMEPGAAVPALRLESAFSER
IRPEAENKSRKKKPPVSPPLLLVQDSETTGRQIEDRVALLLSEEVELSST
PPLPASRILKEGWERAGQCPPPPERKQSFLWEGSALTGAWAMEDFYTARL
VPPLVPQRPAQGLMQEPVPPLVPPEHSELSERRSPALHGTPTAGCGSRGP
SPSASQREHQALQDLVDLAREGLSASPWPGSGGLAGSEGTAGLDVVPGGL
PLTGFVVPSQDKHPDRGGRTLLSLGLLVADFGAMVNNPHLSDVQFQTDSG
EVLYAHKFVLYARCPLLIQYVNNEGFSAVEDGVLTQRVLLGDVSTEAART
FLHYLYTADTGLPPGLSSELSSLAHRFGVSELVHLCEQVPIATDSEGKPW
EEKEAENCESRAENFQELLRSMWADEEEEAETLLKSKDHEEDQENVNEAE
MEEIYEFAATQRKLLQEERAAGAGEDADWLEGGSPVSGQLLAGVQVQKQW
DKVEEMEPLEPGRDEAATTWEKMGQCALPPPQGQHSGARGAEAPEQEAPE
EALGHSSCSSPSRDCQAERKEGSLPHSDDAGDYEQLFSSTQGEISEPSQI
TSEPEEQSGAVRERGLEVSHRLAPWQASPPHPCRFLLGPPQGGSPRGSHH
TSGSSLSTPRSRGGTSQVGSPTLLSPAVPSKQKRDRSILTLSKEPGHQKG
KERRSVLECRNKGVLMFPEKSPSIDLTQSNPDHSSSRSQKSSSKLNEEDE
VILLLDSDEELELEQTKMKSISSDPLEEKKALEISPRSCELFSIIDVDAD
QEPSQSPPRSEAVLQQEDEGALPENRGSLGRRGAPWLFCDRESSPSEAST
TDTSWLVPATPLASRSRDCSSQTQISSLRSGLAVQAVTQHTPRASVGNRE
GNEVAQKFSVIRPQTPPPQTPSSCLTPVSPGTSDGRRQGHRSPSRPHPGG
HPHSSPLAPHPISGDRAHFSRRFLKHSPPGPSFLNQTPAGEVVEVGDSDD
EQEVASHQANRSPPLDSDPPIPIDDCCWHMEPLSPIPIDHWNLERTGPLS
TSSPSRRMNEAADSRDCRSPGLLDTTPIRGSCTTQRKLQEKSSGAGSLGN
SRPSFLNSALWDVWDGEEQRPPETPPPAQMPSAGGAQKPEGLETPKGANR
KKNLPPKVPITPMPQYSIMETPVLKKELDRFGVRPLPKRQMVLKLKEIFQ
YTHQTLDSDSEDESQSSQPLLQAPHCQTLASQTYKPSRAGVHAQQEATTG
PGAHRPKGPAKTKGPRHQRKHHESITPPSRSPTKEAPPGLNDDAQIPASQ
ESVATSVDGSDSSLSSQSSSSCEFGAAFESAGEEEGEGEVSASQAAVQAA
DTDEALRCYIRSKPALYQKVLLYQPFELRELQAELRQNGLRVSSRRLLDF
LDTHCITFTTAATRREKLQGRRRQPRGKKKVERN

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як пошкодження ДНК, репарація ДНК, рекомбінація ДНК, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі.

Література

[ред. | ред. код]
  • Nagase T., Kikuno R., Ohara O. (2001). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XXII. The complete sequences of 50 new cDNA clones which code for large proteins. DNA Res. 8: 319—327. PMID 11853319 DOI:10.1093/dnares/8.6.319
  • Nagase T., Nakayama M., Nakajima D., Kikuno R., Ohara O. (2001). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XX. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 8: 85—95. PMID 11347906 DOI:10.1093/dnares/8.2.85
  • Hendriks I.A., Treffers L.W., Verlaan-de Vries M., Olsen J.V., Vertegaal A.C. (2015). SUMO-2 orchestrates chromatin modifiers in response to DNA damage. Cell Rep. 10: 1778—1791. PMID 25772364 DOI:10.1016/j.celrep.2015.02.033

Примітки

[ред. | ред. код]
  1. Захворювання, генетично пов'язані з SLX4 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. Human PubMed Reference:.
  3. Mouse PubMed Reference:.
  4. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:23845 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
  5. UniProt, Q8IY92 (англ.) . Архів оригіналу за 17 вересня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

[ред. | ред. код]