SNAPC2

SNAPC2
Ідентифікатори
Символи	SNAPC2, PTFDELTA, SNAP45, small nuclear RNA activating complex polypeptide 2
Зовнішні ІД	OMIM: 605076 MGI: 1914861 HomoloGene: 2318 GeneCards: SNAPC2
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity Клітинна компонента • клітинне ядро • нуклеоплазма • гіалоплазма • ядерні тільця Біологічний процес • snRNA transcription • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • transcription by RNA polymerase III • snRNA transcription by RNA polymerase II Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	6618	102209
Ensembl	н/д	ENSMUSG00000011837
UniProt	Q13487	Q91XA5
RefSeq (мРНК)	NM_003083	NM_133968
RefSeq (білок)	NP_003074	NP_598729
Локус (UCSC)	н/д	Хр. 8: 4.3 – 4.31 Mb
PubMed search	[1]	[2]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SNAPC2 (англ. Small nuclear RNA activating complex polypeptide 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 334 амінокислот, а молекулярна маса — 35 556^[4].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MKPPPRRRAA		PARYLGEVTG		PATWSAREKR		QLVRLLQARQ		GQPEPDATEL
ARELRGRSEA		EIRVFLQQLK		GRVAREAIQK		VHPGGLQGPR		RREAQPPAPI
EVWTDLAEKI		TGPLEEALAV		AFSQVLTIAA		TEPVTLLHSK		PPKPTQARGK
PLLLSAPGGQ		EDPAPEIPSS		APAAPSSAPR		TPDPAPEKPS		ESSAGPSTEE
DFAVDFEKIY		KYLSSVSRSG		RSPELSAAES		AVVLDLLMSL		PEELPLLPCT
ALVEHMTETY		LRLTAPQPIP		AGGSLGPAAE		GDGAGSKAPE		ETPPATEKAE
HSELKSPWQA		AGICPLNPFL		VPLELLGRAA		TPAR

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції. Локалізований у ядрі.

Література

• Sadowski C.L., Henry R.W., Kobayashi R., Hernandez N. (1996). The SNAP45 subunit of the small nuclear RNA (snRNA) activating protein complex is required for RNA polymerase II and III snRNA gene transcription and interacts with the TATA box binding protein. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 93: 4289—4293. PMID 8633057 DOI:10.1073/pnas.93.9.4289
• Yoon J.B., Roeder R.G. (1996). Cloning of two proximal sequence element-binding transcription factor subunits (gamma and delta) that are required for transcription of small nuclear RNA genes by RNA polymerases II and III and interact with the TATA-binding protein. Mol. Cell. Biol. 16: 1—9. PMID 8524284 DOI:10.1128/MCB.16.1.1
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Hinkley C.S., Hirsch H.A., Gu L., LaMere B., Henry R.W. (2003). The small nuclear RNA-activating protein 190 Myb DNA binding domain stimulates TATA box-binding protein-TATA box recognition. J. Biol. Chem. 278: 18649—18657. PMID 12621023 DOI:10.1074/jbc.M204247200

Примітки

1. Human PubMed Reference:.
2. Mouse PubMed Reference:.
3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11135 (англ.) . Архів оригіналу за 7 квітня 2016. Процитовано 12 вересня 2017. [Архівовано 2016-04-07 у Wayback Machine.]
4. UniProt, Q13487 (англ.) . Архів оригіналу за 19 серпня 2016. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

• Хромосома 19

Портал «Біологія»   Портал «Хімія»