SNAPC3

SNAPC3
Ідентифікатори
Символи	SNAPC3, PTFbeta, SNAP50, small nuclear RNA activating complex polypeptide 3
Зовнішні ІД	OMIM: 602348 MGI: 1916338 HomoloGene: 31130 GeneCards: SNAPC3
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • DNA binding Клітинна компонента • клітинне ядро • нуклеоплазма • ядерце • ядерні тільця Біологічний процес • snRNA transcription • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • transcription by RNA polymerase III • snRNA transcription by RNA polymerase II Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	6619	77634
Ensembl	ENSG00000164975	ENSMUSG00000028483
UniProt	Q92966	Q9D2C9
RefSeq (мРНК)	NM_001039697 NM_003084	NM_029949 NM_001358795
RefSeq (білок)	NP_001034786 NP_001356576 NP_001356577 NP_001356578 NP_001356579 NP_001356580	NP_084225 NP_001345724
Локус (UCSC)	Хр. 9: 15.42 – 15.47 Mb	Хр. 4: 83.42 – 83.47 Mb
PubMed search	[1]	[2]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SNAPC3 (англ. Small nuclear RNA activating complex polypeptide 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 411 амінокислот, а молекулярна маса — 46 753^[4].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAEGSRGGPT		CSGVGGRQDP		VSGSGGCNFP		EYELPELNTR		AFHVGAFGEL
WRGRLRGAGD		LSLREPPASA		LPGSQAADSD		REDAAVARDL		DCSLEAAAEL
RAVCGLDKLK		CLEDGEDPEV		IPENTDLVTL		GVRKRFLEHR		EETITIDRAC
RQETFVYEME		SHAIGKKPEN		SADMIEEGEL		ILSVNILYPV		IFHKHKEHKP
YQTMLVLGSQ		KLTQLRDSIR		CVSDLQIGGE		FSNTPDQAPE		HISKDLYKSA
FFYFEGTFYN		DKRYPECRDL		SRTIIEWSES		HDRGYGKFQT		ARMEDFTFND
LCIKLGFPYL		YCHQGDCEHV		IVITDIRLVH		HDDCLDRTLY		PLLIKKHWLW
TRKCFVCKMY		TARWVTNNDS		FAPEDPCFFC		DVCFRMLHYD		SEGNKLGEFL
AYPYVDPGTF		N

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• Bai L., Wang Z., Yoon J.B., Roeder R.G. (1996). Cloning and characterization of the beta subunit of human proximal sequence element-binding transcription factor and its involvement in transcription of small nuclear RNA genes by RNA polymerases II and III. Mol. Cell. Biol. 16: 5419—5426. PMID 8816454 DOI:10.1128/MCB.16.10.5419
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Ma B., Hernandez N. (2001). A map of protein-protein contacts within the small nuclear RNA-activating protein complex SNAPc. J. Biol. Chem. 276: 5027—5035. PMID 11056176 DOI:10.1074/jbc.M009301200
• Hinkley C.S., Hirsch H.A., Gu L., LaMere B., Henry R.W. (2003). The small nuclear RNA-activating protein 190 Myb DNA binding domain stimulates TATA box-binding protein-TATA box recognition. J. Biol. Chem. 278: 18649—18657. PMID 12621023 DOI:10.1074/jbc.M204247200
• Henry R.W., Ma B., Sadowski C.L., Kobayashi R., Hernandez N. (1996). Cloning and characterization of SNAP50, a subunit of the snRNA-activating protein complex SNAPc. EMBO J. 15: 7129—7136. PMID 9003788

Примітки

1. Human PubMed Reference:.
2. Mouse PubMed Reference:.
3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11136 (англ.) . Процитовано 7 вересня 2017.
4. UniProt, Q92966 (англ.) . Архів оригіналу за 9 лютого 2017. Процитовано 7 вересня 2017.

Див. також

• Хромосома 9

Портал «Біологія»   Портал «Хімія»