SNAPC5

SNAPC5
Ідентифікатори
Символи	SNAPC5, SNAP19, small nuclear RNA activating complex polypeptide 5
Зовнішні ІД	OMIM: 605979 MGI: 1914282 HomoloGene: 4414 GeneCards: SNAPC5
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding;
Клітинна компонента	• ядерце; • клітинне ядро; • нуклеоплазма; • ядерні тільця;
Біологічний процес	• GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • transcription by RNA polymerase II; • transcription initiation from RNA polymerase III promoter; • transcription, DNA-templated; • snRNA transcription by RNA polymerase II;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	10302
	330959
	ENSG00000174446
	ENSMUSG00000032398
	O75971
	Q8R2K7
	NM_001329613; NM_001329614; NM_001329615; NM_006049
	NM_183316; NM_025925
	NP_001316542; NP_001316543; NP_001316544; NP_006040
	NP_899139
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

SNAPC5 (англ. Small nuclear RNA activating complex polypeptide 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 15-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 98 амінокислот, а молекулярна маса — 11 328^[4].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MLSRLQELRK		EEETLLRLKA		ALHDQLNRLK		VEELALQSMI		SSRRGDEMLS
SHTVPEQSHD		MLVHVDNEAS		INQTTLELST		KSHVTEEEEE		EEEEESDS

A: Аланін

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі.

Література

Henry R.W., Mittal V., Ma B., Kobayashi R., Hernandez N. (1998). SNAP19 mediates the assembly of a functional core promoter complex (SNAPc) shared by RNA polymerases II and III. Genes Dev. 12: 2664—2672. PMID 9732265 doi:10.1101/gad.12.17.2664
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Ma B., Hernandez N. (2001). A map of protein-protein contacts within the small nuclear RNA-activating protein complex SNAPc. J. Biol. Chem. 276: 5027—5035. PMID 11056176 doi:10.1074/jbc.M009301200

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:15484 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, O75971 (англ.) . Архів оригіналу за 17 березня 2018. Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 15

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:15484 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-4] UniProt, O75971 (англ.) . Архів оригіналу за 17 березня 2018. Процитовано 11 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]