SNIP1

SNIP1
Ідентифікатори
Символи	SNIP1, PMRED, Smad nuclear interacting protein 1, PML1, NEDHCS
Зовнішні ІД	OMIM: 608241 MGI: 2156003 HomoloGene: 110886 GeneCards: SNIP1
Реагує на сполуку
	Viroporin 3a
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • mRNA binding; • RNA binding;
Клітинна компонента	• нуклеоплазма; • клітинне ядро; • гіалоплазма; • U2-type precatalytic spliceosome;
Біологічний процес	• positive regulation of protein targeting to mitochondrion; • I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling; • Сайленсинг генів; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • production of miRNAs involved in gene silencing by miRNA; • mRNA splicing, via spliceosome;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	79753
	76793
	ENSG00000163877
	ENSMUSG00000050213
	Q8TAD8
	Q8BIZ6
	NM_024700
	NM_175246; NM_001356560
	NP_078976
	NP_780455; NP_001343489
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

SNIP1 (англ. Smad nuclear interacting protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. ^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 396 амінокислот, а молекулярна маса — 45 778^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MKAVKSERER	GSRRRHRDGD	VVLPAGVVVK	QERLSPEVAP	PAHRRPDHSG
GSPSPPTSEP	ARSGHRGNRA	RGVSRSPPKK	KNKASGRRSK	SPRSKRNRSP
HHSTVKVKQE	REDHPRRGRE	DRQHREPSEQ	EHRRARNSDR	DRHRGHSHQR
RTSNERPGSG	QGQGRDRDTQ	NLQAQEEERE	FYNARRREHR	QRNDVGGGGS
ESQELVPRPG	GNNKEKEVPA	KEKPSFELSG	ALLEDTNTFR	GVVIKYSEPP
EARIPKKRWR	LYPFKNDEVL	PVMYIHRQSA	YLLGRHRRIA	DIPIDHPSCS
KQHAVFQYRL	VEYTRADGTV	GRRVKPYIID	LGSGNGTFLN	NKRIEPQRYY
ELKEKDVLKF	GFSSREYVLL	HESSDTSEID	RKDDEDEEEE	EEVSDS

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі як РНК-залежне заглушення генів. Локалізований у ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Roche K.C., Wiechens N., Owen-Hughes T., Perkins N.D. (2004). The FHA domain protein SNIP1 is a regulator of the cell cycle and cyclin D1 expression. Oncogene. 23: 8185—8195. PMID 15378006 DOI:10.1038/sj.onc.1208025
Impens F., Radoshevich L., Cossart P., Ribet D. (2014). Mapping of SUMO sites and analysis of SUMOylation changes induced by external stimuli. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 111: 12432—12437. PMID 25114211 DOI:10.1073/pnas.1413825111
Hendriks I.A., Treffers L.W., Verlaan-de Vries M., Olsen J.V., Vertegaal A.C. (2015). SUMO-2 orchestrates chromatin modifiers in response to DNA damage. Cell Rep. 10: 1778—1791. PMID 25772364 DOI:10.1016/j.celrep.2015.02.033

Примітки

↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з Smad nuclear interacting protein 1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:30587 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q8TAD8 (англ.) . Архів оригіналу за 9 жовтня 2018. Процитовано 28 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 1

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Сполуки, які фізично взаємодіють з Smad nuclear interacting protein 1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:30587 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-5] UniProt, Q8TAD8 (англ.) . Архів оригіналу за 9 жовтня 2018. Процитовано 28 серпня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]