SNW1

SNW1
Ідентифікатори
Символи	SNW1, Bx42, NCOA-62, PRPF45, Prp45, SKIIP, SKIP, SNW domain containing 1, SKIP1, FUN20
Зовнішні ІД	OMIM: 603055 MGI: 1913604 HomoloGene: 56557 GeneCards: SNW1
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001106 transcription corepressor activity; • GO:0001105 transcription coactivator activity; • Notch binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • retinoic acid receptor binding; • SMAD binding; • vitamin D receptor binding; • RNA binding; • enzyme binding; • androgen receptor binding;
Клітинна компонента	• catalytic step 2 spliceosome; • nuclear matrix; • нуклеоплазма; • cyclin/CDK positive transcription elongation factor complex; • spliceosomal complex; • клітинне ядро; • ядерні тільця; • post-mRNA release spliceosomal complex; • nuclear speck; • U2-type catalytic step 2 spliceosome;
Біологічний процес	• Сигнальний шлях Notch; • cellular response to retinoic acid; • positive regulation of transforming growth factor beta receptor signaling pathway; • intrinsic apoptotic signaling pathway in response to DNA damage by p53 class mediator; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • positive regulation of mRNA splicing, via spliceosome; • regulation of retinoic acid receptor signaling pathway; • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II; • mRNA processing; • regulation of vitamin D receptor signaling pathway; • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II; • positive regulation of neurogenesis; • retinoic acid receptor signaling pathway; • positive regulation of histone H3-K4 methylation; • Сплайсинг РНК; • positive regulation of vitamin D receptor signaling pathway; • transcription initiation from RNA polymerase II promoter; • GO:0022415 viral process; • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated; • positive regulation by host of viral transcription; • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II; • transcription, DNA-templated; • mRNA splicing, via spliceosome; • generation of catalytic spliceosome for second transesterification step; • positive regulation of transcription of Notch receptor target; • positive regulation of Notch signaling pathway;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	22938
	66354
	ENSG00000100603
	ENSMUSG00000021039
	Q13573
	Q9CSN1
	NM_012245; NM_001318844
	NM_025507
	NP_001305773; NP_036377
	NP_079783
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

SNW1 (англ. SNW domain containing 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 14-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 536 амінокислот, а молекулярна маса — 61 494^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MALTSFLPAP	TQLSQDQLEA	EEKARSQRSR	QTSLVSSRRE	PPPYGYRKGW
IPRLLEDFGD	GGAFPEIHVA	QYPLDMGRKK	KMSNALAIQV	DSEGKIKYDA
IARQGQSKDK	VIYSKYTDLV	PKEVMNADDP	DLQRPDEEAI	KEITEKTRVA
LEKSVSQKVA	AAMPVRAADK	LAPAQYIRYT	PSQQGVAFNS	GAKQRVIRMV
EMQKDPMEPP	RFKINKKIPR	GPPSPPAPVM	HSPSRKMTVK	EQQEWKIPPC
ISNWKNAKGY	TIPLDKRLAA	DGRGLQTVHI	NENFAKLAEA	LYIADRKARE
AVEMRAQVER	KMAQKEKEKH	EEKLREMAQK	ARERRAGIKT	HVEKEDGEAR
ERDEIRHDRR	KERQHDRNLS	RAAPDKRSKL	QRNENRDISE	VIALGVPNPR
TSNEVQYDQR	LFNQSKGMDS	GFAGGEDEIY	NVYDQAWRGG	KDMAQSIYRP
SKNLDKDMYG	DDLEARIKTN	RFVPDKEFSG	SDRRQRGREG	PVQFEEDPFG
LDKFLEEAKQ	HGGSKRPSDS	SRPKEHEHEG	KKRRKE

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як взаємодія хазяїн-вірус, процесинг мРНК, сплайсинг мРНК, транскрипція, регуляція транскрипції, ацетилювання. Локалізований у ядрі.

Література

Dahl R., Wani B., Hayman M.J. (1998). The Ski oncoprotein interacts with Skip, the human homolog of Drosophila Bx42. Oncogene. 16: 1579—1586. PMID 9569025 DOI:10.1038/sj.onc.1201687
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Zhou S., Fujimuro M., Hsieh J.J., Chen L., Hayward S.D. (2000). A role for SKIP in EBNA2 activation of CBF1-repressed promoters. J. Virol. 74: 1939—1947. PMID 10644367 DOI:10.1128/JVI.74.4.1939-1947.2000
Prathapam T., Kuhne C., Banks L. (2001). The HPV-16 E7 oncoprotein binds Skip and suppresses its transcriptional activity. Oncogene. 20: 7677—7685. PMID 11753645 DOI:10.1038/sj.onc.1204960
Prathapam T., Kuhne C., Banks L. (2002). Skip interacts with the retinoblastoma tumor suppressor and inhibits its transcriptional repression activity. Nucleic Acids Res. 30: 5261—5268. PMID 12466551 DOI:10.1093/nar/gkf658
Jurica M.S., Licklider L.J., Gygi S.P., Grigorieff N., Moore M.J. (2002). Purification and characterization of native spliceosomes suitable for three-dimensional structural analysis. RNA. 8: 426—439. PMID 11991638 DOI:10.1017/S1355838202021088

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:16696 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q13573 (англ.) . Архів оригіналу за 2 жовтня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 14

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:16696 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-4] UniProt, Q13573 (англ.) . Архів оригіналу за 2 жовтня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]