SNX18

SNX18
Ідентифікатори
Символи	SNX18, SH3PX2, SH3PXD3B, SNAG1, sorting nexin 18
Зовнішні ІД	MGI: 2137642 HomoloGene: 14164 GeneCards: SNX18
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • phosphatidylinositol binding • phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate binding • lipid binding Клітинна компонента • мембрана • extrinsic component of cytoplasmic side of plasma membrane • клітинна мембрана • endosome membrane • екзосома • cytoplasmic vesicle membrane • система ендомембран • clathrin-coated vesicle • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • ендосома Біологічний процес • cleavage furrow formation • поділ клітини • endosomal transport • GO:0032320, GO:0032321, GO:0032855, GO:0043089, GO:0032854 positive regulation of GTPase activity • protein transport • клітинний цикл • ендоцитоз • mitotic cytokinesis • GO:0007067 мітоз • GO:0015915 транспорт Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	112574	170625
Ensembl	ENSG00000178996	ENSMUSG00000042364
UniProt	Q96RF0	Q91ZR2 Q8C788
RefSeq (мРНК)	NM_052870 NM_001102575 NM_001145427	NM_130796
RefSeq (білок)	NP_001096045 NP_001138899 NP_443102	NP_570614
Локус (UCSC)	Хр. 5: 54.52 – 54.55 Mb	Хр. 13: 113.73 – 113.76 Mb
PubMed search	[1]	[2]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SNX18 (англ. Sorting nexin 18) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 628 амінокислот, а молекулярна маса — 68 894^[4].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MALRARALYD		FRSENPGEIS		LREHEVLSLC		SEQDIEGWLE		GVNSRGDRGL
FPASYVQVIR		APEPGPAGDG		GPGAPARYAN		VPPGGFEPLP		VAPPASFKPP
PDAFQALLQP		QQAPPPSTFQ		PPGAGFPYGG		GALQPSPQQL		YGGYQASQGS
DDDWDDEWDD		SSTVADEPGA		LGSGAYPDLD		GSSSAGVGAA		GRYRLSTRSD
LSLGSRGGSV		PPQHHPSGPK		SSATVSRNLN		RFSTFVKSGG		EAFVLGEASG
FVKDGDKLCV		VLGPYGPEWQ		ENPYPFQCTI		DDPTKQTKFK		GMKSYISYKL
VPTHTQVPVH		RRYKHFDWLY		ARLAEKFPVI		SVPHLPEKQA		TGRFEEDFIS
KRRKGLIWWM		NHMASHPVLA		QCDVFQHFLT		CPSSTDEKAW		KQGKRKAEKD
EMVGANFFLT		LSTPPAAALD		LQEVESKIDG		FKCFTKKMDD		SALQLNHTAN
EFARKQVTGF		KKEYQKVGQS		FRGLSQAFEL		DQQAFSVGLN		QAIAFTGDAY
DAIGELFAEQ		PRQDLDPVMD		LLALYQGHLA		NFPDIIHVQK		GKAWPLEQVI
WSVLCRLKGA		TLTAVPLWVS		ESYSTGEEAS		RDVDAWVFSL		ECKLDCSTGS
FLLEYLALGN		EYSFSKVQRV		PLMTVLSF

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків, клітинний цикл, поділ клітини, мітоз, ендоцитоз, альтернативний сплайсинг, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з ліпідами. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, цитоплазматичних везикулах, ендосомах.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
• Haberg K., Lundmark R., Carlsson S.R. (2008). SNX18 is an SNX9 paralog that acts as a membrane tubulator in AP-1-positive endosomal trafficking. J. Cell Sci. 121: 1495—1505. PMID 18411244 doi:10.1242/jcs.028530
• Baumann C., Lindholm C.K., Rimoldi D., Levy F. (2010). The E3 ubiquitin ligase Itch regulates sorting nexin 9 through an unconventional substrate recognition domain. FEBS J. 277: 2803—2814. PMID 20491914 doi:10.1111/j.1742-4658.2010.07698.x
• Ma M.P., Chircop M. (2012). SNX9, SNX18 and SNX33 are required for progression through and completion of mitosis. J. Cell Sci. 125: 4372—4382. PMID 22718350 doi:10.1242/jcs.105981

Примітки

1. Human PubMed Reference:.
2. Mouse PubMed Reference:.
3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:19245 (англ.) . Архів оригіналу за 15 вересня 2015. Процитовано 5 вересня 2017. [Архівовано 2015-09-15 у Wayback Machine.]
4. UniProt, Q96RF0 (англ.) . Архів оригіналу за 26 жовтня 2016. Процитовано 5 вересня 2017.

Див. також

• Хромосома 5

Портал «Біологія»   Портал «Хімія»