SSBP2

SSBP2
Ідентифікатори
Символи	SSBP2, HSPC116, SOSS-B2, single stranded DNA binding protein 2
Зовнішні ІД	OMIM: 607389 MGI: 1914220 HomoloGene: 22724 GeneCards: SSBP2
Пов'язані генетичні захворювання
	гліобластома
Онтологія гена
Молекулярна функція	• single-stranded DNA binding; • DNA binding; • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding; • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • клітинне ядро;
Біологічний процес	• GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • transcription by RNA polymerase II; • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	23635
	66970
	ENSG00000145687
	ENSMUSG00000003992
	P81877
	Q9CYZ8
NM_001256732; NM_001256733; NM_001256734; NM_001256735; NM_001256736;
	NM_012446; NM_001345886; NM_001394350; NM_001394351; NM_001394352
	NM_024186; NM_024272; NM_001360775; NM_001360776
NP_001243661; NP_001243662; NP_001243663; NP_001243664; NP_001243665;
	NP_001332815; NP_036578
	NP_077148; NP_077234; NP_001347704; NP_001347705
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

SSBP2 (англ. Single stranded DNA binding protein 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 361 амінокислот, а молекулярна маса — 37 828^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MYGKGKSNSS	AVPSDSQARE	KLALYVYEYL	LHVGAQKSAQ	TFLSEIRWEK
NITLGEPPGF	LHSWWCVFWD	LYCAAPERRE	TCEHSSEAKA	FHDYSAAAAP
SPVLGNIPPG	DGMPVGPVPP	GFFQPFMSPR	YPGGPRPPLR	IPNQALGGVP
GSQPLLPSGM	DPTRQQGHPN	MGGPMQRMTP	PRGMVPLGPQ	NYGGAMRPPL
NALGGPGMPG	MNMGPGGGRP	WPNPTNANSI	PYSSASPGNY	VGPPGGGGPP
GTPIMPSPAD	STNSGDNMYT	LMNAVPPGPN	RPNFPMGPGS	DGPMGGLGGM
ESHHMNGSLG	SGDMDSISKN	SPNNMSLSNQ	PGTPRDDGEM	GGNFLNPFQS
ESYSPSMTMS	V

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

Castro P.D., Liang H., Liang J.C., Nagarajan L. (2002). A novel, evolutionarily conserved gene family with putative sequence-specific single-stranded DNA-binding activity. Genomics. 80: 78—85. PMID 12079286 DOI:10.1006/geno.2002.6805
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з SSBP2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:15831 (англ.) . Процитовано 5 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, P81877 (англ.) . Архів оригіналу за 24 лютого 2018. Процитовано 5 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 5

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Захворювання, генетично пов'язані з SSBP2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:15831 (англ.) . Процитовано 5 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-5] UniProt, P81877 (англ.) . Архів оригіналу за 24 лютого 2018. Процитовано 5 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]