STAT6

STAT6
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1OJ5, 4Y5W, 4Y5U
Ідентифікатори
Символи	STAT6, D12S1644, IL-4-STAT, STAT6B, STAT6C, signal transducer and activator of transcription 6
Зовнішні ІД	OMIM: 601512 MGI: 103034 HomoloGene: 2373 GeneCards: STAT6
Пов'язані генетичні захворювання
eosinophilic esophagitis[1]
Онтологія гена Молекулярна функція • identical protein binding • sequence-specific DNA binding • protein phosphatase binding • DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific Клітинна компонента • клітинне ядро • нуклеоплазма • membrane raft • цитоплазма • гіалоплазма • ядерна мембрана Біологічний процес • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • T-helper 1 cell lineage commitment • regulation of cell population proliferation • response to cytokine • interleukin-4-mediated signaling pathway • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • cellular response to hydrogen peroxide • mammary gland epithelial cell proliferation • cellular response to reactive nitrogen species • positive regulation of type I interferon production • positive regulation of isotype switching to IgE isotypes • mammary gland morphogenesis • negative regulation of type 2 immune response • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:0072468 сигнальна трансдукція • transcription, DNA-templated • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription by RNA polymerase II • cytokine-mediated signaling pathway • positive regulation of cold-induced thermogenesis • defense response • receptor signaling pathway via JAK-STAT • response to peptide hormone • growth hormone receptor signaling pathway via JAK-STAT Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	6778	20852
Ensembl	ENSG00000166888	ENSMUSG00000002147
UniProt	P42226	P52633
RefSeq (мРНК)	NM_001178078 NM_001178079 NM_001178080 NM_001178081 NM_003153	NM_009284
RefSeq (білок)	NP_001171549 NP_001171550 NP_001171551 NP_001171552 NP_003144	NP_033310
Локус (UCSC)	Хр. 12: 57.1 – 57.13 Mb	Хр. 10: 127.48 – 127.5 Mb
PubMed search	[2]	[3]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

STAT6 (англ. Signal transducer and activator of transcription 6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 847 амінокислот, а молекулярна маса — 94 135^[5].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSLWGLVSKM		PPEKVQRLYV		DFPQHLRHLL		GDWLESQPWE		FLVGSDAFCC
NLASALLSDT		VQHLQASVGE		QGEGSTILQH		ISTLESIYQR		DPLKLVATFR
QILQGEKKAV		MEQFRHLPMP		FHWKQEELKF		KTGLRRLQHR		VGEIHLLREA
LQKGAEAGQV		SLHSLIETPA		NGTGPSEALA		MLLQETTGEL		EAAKALVLKR
IQIWKRQQQL		AGNGAPFEES		LAPLQERCES		LVDIYSQLQQ		EVGAAGGELE
PKTRASLTGR		LDEVLRTLVT		SCFLVEKQPP		QVLKTQTKFQ		AGVRFLLGLR
FLGAPAKPPL		VRADMVTEKQ		ARELSVPQGP		GAGAESTGEI		INNTVPLENS
IPGNCCSALF		KNLLLKKIKR		CERKGTESVT		EEKCAVLFSA		SFTLGPGKLP
IQLQALSLPL		VVIVHGNQDN		NAKATILWDN		AFSEMDRVPF		VVAERVPWEK
MCETLNLKFM		AEVGTNRGLL		PEHFLFLAQK		IFNDNSLSME		AFQHRSVSWS
QFNKEILLGR		GFTFWQWFDG		VLDLTKRCLR		SYWSDRLIIG		FISKQYVTSL
LLNEPDGTFL		LRFSDSEIGG		ITIAHVIRGQ		DGSPQIENIQ		PFSAKDLSIR
SLGDRIRDLA		QLKNLYPKKP		KDEAFRSHYK		PEQMGKDGRG		YVPATIKMTV
ERDQPLPTPE		LQMPTMVPSY		DLGMAPDSSM		SMQLGPDMVP		QVYPPHSHSI
PPYQGLSPEE		SVNVLSAFQE		PHLQMPPSLG		QMSLPFDQPH		PQGLLPCQPQ
EHAVSSPDPL		LCSDVTMVED		SCLSQPVTAF		PQGTWIGEDI		FPPLLPPTEQ
DLTKLLLEGQ		GESGGGSLGA		QPLLQPSHYG		QSGISMSHMD		LRANPSW

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• Patel B.K., Keck C.L., O'Leary R.S., Popescu N.C., LaRochelle W.J. (1998). Localization of the human stat6 gene to chromosome 12q13.3-q14.1, a region implicated in multiple solid tumors. Genomics. 52: 192—200. PMID 9782085 DOI:10.1006/geno.1998.5436
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Litterst C.M., Pfitzner E. (2002). An LXXLL motif in the transactivation domain of STAT6 mediates recruitment of NCoA-1/SRC-1. J. Biol. Chem. 277: 36052—36060. PMID 12138096 DOI:10.1074/jbc.M203556200

Примітки

1. Захворювання, генетично пов'язані з STAT6 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
2. Human PubMed Reference:.
3. Mouse PubMed Reference:.
4. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11368 (англ.) . Архів оригіналу за 15 березня 2016. Процитовано 11 вересня 2017. [Архівовано 2016-03-15 у Wayback Machine.]
5. UniProt, P42226 (англ.) . Архів оригіналу за 1 вересня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

• Хромосома 12

Портал «Біологія»   Портал «Хімія»