STRN

STRN
Ідентифікатори
Символи	STRN, SG2NA, PPP2R6A, striatin, STRN1
Зовнішні ІД	OMIM: 614765 MGI: 1333757 HomoloGene: 2380 GeneCards: STRN
Онтологія гена Молекулярна функція • protein phosphatase 2A binding • estrogen receptor binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • calmodulin binding • armadillo repeat domain binding • GO:0032403 protein-containing complex binding Клітинна компонента • цитоплазма • soma • postsynaptic membrane • dendritic spine • protein phosphatase type 2A complex • cell projection • мембрана • GO:0097483, GO:0097481 постсинаптичне ущільнення • bicellular tight junction • дендрит (нейробіологія) • FAR/SIN/STRIPAK complex Біологічний процес • dendrite development • Wnt signaling pathway • locomotory behavior • negative regulation of cell population proliferation • bicellular tight junction assembly Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	6801	268980
Ensembl	ENSG00000115808	ENSMUSG00000024077
UniProt	O43815	O55106
RefSeq (мРНК)	NM_003162	NM_011500
RefSeq (білок)	NP_003153	NP_035630
Локус (UCSC)	Хр. 2: 36.84 – 36.97 Mb	Хр. 17: 78.96 – 79.04 Mb
PubMed search	[1]	[2]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

STRN (англ. Striatin) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 780 амінокислот, а молекулярна маса — 86 132^[4].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MDEQAGPGVF		FSNNHPGAGG		AKGLGPLAEA		AAAGDGAAAA		GAARAQYSLP
GILHFLQHEW		ARFEVERAQW		EVERAELQAQ		IAFLQGERKG		QENLKKDLVR
RIKMLEYALK		QERAKYHKLK		YGTELNQGDM		KPPSYDSDEG		NETEVQPQQN
SQLMWKQGRQ		LLRQYLQEVG		YTDTILDVKS		KRVRALLGFS		SDVTDREDDK
NQDSVVNGTE		AEVKETAMIA		KSELTDSASV		LDNFKFLESA		AADFSDEDED
DDVDGREKSV		IDTSTIVRKK		ALPDSGEDRD		TKEALKEFDF		LVTSEEGDNE
SRSAGDGTDW		EKEDQCLMPE		AWNVDQGVIT		KLKEQYKKER		KGKKGVKRPN
RSKLQDMLAN		LRDVDELPSL		QPSVGSPSRP		SSSRLPEHEI		NRADEVEALT
FPPSSGKSFI		MGADEALESE		LGLGELAGLT		VANEADSLTY		DIANNKDALR
KTWNPKFTLR		SHFDGIRALA		FHPIEPVLIT		ASEDHTLKMW		NLQKTAPAKK
STSLDVEPIY		TFRAHKGPVL		CVVMSSNGEQ		CYSGGTDGLI		QGWNTTNPNI
DPYDSYDPSV		LRGPLLGHTD		AVWGLAYSAA		HQRLLSCSAD		GTLRLWNTTE
VAPALSVFND		TKELGIPASV		DLVSSDPSHM		VASFSKGYTS		IFNMETQQRI
LTLESNVDTT		ANSSCQINRV		ISHPTLPISI		TAHEDRHIKF		YDNNTGKLIH
SMVAHLEAVT		SLAVDPNGLY		LMSGSHDCSI		RLWNLESKTC		IQEFTAHRKK
FEESIHDVAF		HPSKCYIASA		GADALAKVFV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з молекулою кальмодуліну. Локалізований у цитоплазмі, мембрані, клітинних відростках.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

1. Human PubMed Reference:.
2. Mouse PubMed Reference:.
3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11424 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.
4. UniProt, O43815 (англ.) . Архів оригіналу за 29 жовтня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.

Див. також

• Хромосома 2

Портал «Біологія»   Портал «Хімія»