SUDS3

SUDS3
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2N2H, 4ZQA
Ідентифікатори
Символи	SUDS3, SAP45, SDS3, SDS3 homolog, SIN3A corepressor complex component
Зовнішні ІД	OMIM: 608250 MGI: 1919204 HomoloGene: 15906 GeneCards: SUDS3
Онтологія гена
Молекулярна функція	• histone deacetylase binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • enzyme binding; • histone deacetylase activity;
Клітинна компонента	• Sin3 complex; • нуклеоплазма; • Sin3-type complex; • клітинне ядро; • гіалоплазма; • ядерні тільця;
Біологічний процес	• GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • substantia nigra development; • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II; • transcription, DNA-templated; • positive regulation of apoptotic process; • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated; • histone deacetylation; • GO:0097285 апоптоз; • protein deubiquitination; • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	64426
	71954
	ENSG00000111707
	ENSMUSG00000066900
	Q9H7L9
	Q8BR65
	NM_022491
	NM_001122666; NM_178622
	NP_071936
	NP_001116138; NP_848737
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

SUDS3 (англ. SDS3 homolog, SIN3A corepressor complex component) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 328 амінокислот, а молекулярна маса — 38 136^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSAAGLLAPA	PAQAGAPPAP	EYYPEEDEEL	ESAEDDERSC	RGRESDEDTE
DASETDLAKH	DEEDYVEMKE	QMYQDKLASL	KRQLQQLQEG	TLQEYQKRMK
KLDQQYKERI	RNAELFLQLE	TEQVERNYIK	EKKAAVKEFE	DKKVELKENL
IAELEEKKKM	IENEKLTMEL	TGDSMEVKPI	MTRKLRRRPN	DPVPIPDKRR
KPAPAQLNYL	LTDEQIMEDL	RTLNKLKSPK	RPASPSSPEH	LPATPAESPA
QRFEARIEDG	KLYYDKRWYH	KSQAIYLESK	DNQKLSCVIS	SVGANEIWVR
KTSDSTKMRI	YLGQLQRGLF	VIRRRSAA

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, регуляторів хроматину, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як апоптоз, транскрипція, регуляція транскрипції, ацетилювання. Локалізований у ядрі.

Література

Fleischer T.C., Yun U.J., Ayer D.E. (2003). Identification and characterization of three new components of the mSin3A corepressor complex. Mol. Cell. Biol. 23: 3456—3467. PMID 12724404 DOI:10.1128/MCB.23.10.3456-3467.2003
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Wysocka J., Myers M.P., Laherty C.D., Eisenman R.N., Herr W. (2003). Human Sin3 deacetylase and trithorax-related Set1/Ash2 histone H3-K4 methyltransferase are tethered together selectively by the cell-proliferation factor HCF-1. Genes Dev. 17: 896—911. PMID 12670868 DOI:10.1101/gad.252103

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:29545 (англ.) . Архів оригіналу за 5 квітня 2016. Процитовано 11 вересня 2017. [Архівовано 2016-04-05 у Wayback Machine.]
↑ UniProt, Q9H7L9 (англ.) . Архів оригіналу за 19 вересня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 12

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:29545 (англ.) . Архів оригіналу за 5 квітня 2016. Процитовано 11 вересня 2017. [Архівовано 2016-04-05 у Wayback Machine.]

[UniProt-4] UniProt, Q9H7L9 (англ.) . Архів оригіналу за 19 вересня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]