SUMO1

SUMO1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4WJQ, 1A5R, 1TGZ, 1WYW, 1Y8R, 1Z5S, 2ASQ, 2BF8, 2G4D, 2IO2, 2IY0, 2IY1, 2KQS, 2LAS, 2MW5, 2PE6, 2UYZ, 2VRR, 3KYC, 3KYD, 3RZW, 3UIP, 4WJN, 4WJO, 4WJP, 5AEK, 2N1V, 2N1A
Ідентифікатори
Символи	SUMO1, DAP1, GMP1, OFC10, PIC1, SENP2, SMT3, SMT3C, SMT3H3, UBL1, small ubiquitin-like modifier 1, small ubiquitin like modifier 1
Зовнішні ІД	OMIM: 601912 MGI: 1197010 HomoloGene: 2514 GeneCards: SUMO1
Онтологія гена Молекулярна функція • transcription factor binding • potassium channel regulator activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein tag • ubiquitin protein ligase binding • RNA binding • transcription corepressor binding • protein C-terminus binding • SUMO transferase activity • enzyme binding • protein-macromolecule adaptor activity • glucocorticoid receptor binding • small protein activating enzyme binding • ubiquitin-like protein ligase binding Клітинна компонента • цитоплазма • PML body • nuclear speck • ядерні тільця • ядерна мембрана • мембрана • voltage-gated potassium channel complex • клітинна мембрана • синапс • ядерна пора • нуклеоплазма • GO:0035328 Гетерохроматин • XY body • дендрит (нейробіологія) • ядерце • fibrillar center • клітинне ядро • nuclear stress granule • SUMO activating enzyme complex • nuclear envelope • гіалоплазма Біологічний процес • roof of mouth development • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • regulation of protein stability • positive regulation of protein-containing complex assembly • protein localization to nuclear pore • protein stabilization • negative regulation of action potential • negative regulation of DNA-binding transcription factor activity • regulation of protein localization • regulation of cardiac muscle cell contraction • global genome nucleotide-excision repair • PML body organization • regulation of interferon-gamma-mediated signaling pathway • GO:0022415 viral process • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • double-strand break repair via nonhomologous end joining • regulation of calcium ion transmembrane transport • positive regulation of proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process • negative regulation of delayed rectifier potassium channel activity • positive regulation of ATPase-coupled calcium transmembrane transporter activity • GO:0100026 Репарація ДНК • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • cellular response to heat • cellular response to cadmium ion • protein sumoylation • negative regulation of DNA binding Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	7341	22218
Ensembl	ENSG00000116030	ENSMUSG00000026021
UniProt	P63165	P63166
RefSeq (мРНК)	NM_003352 NM_001005781 NM_001005782	NM_009460
RefSeq (білок)	NP_001005781 NP_001005782 NP_003343 NP_001358321 NP_001358322 NP_001358323	NP_033486
Локус (UCSC)	Хр. 2: 202.21 – 202.24 Mb	Хр. 1: 59.63 – 59.71 Mb
PubMed search	[1]	[2]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SUMO1 (англ. Small ubiquitin-like modifier 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 101 амінокислот, а молекулярна маса — 11 557^[4].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSDQEAKPST		EDLGDKKEGE		YIKLKVIGQD		SSEIHFKVKM		TTHLKKLKES
YCQRQGVPMN		SLRFLFEGQR		IADNHTPKEL		GMEEEDVIEV		YQEQTGGHST
V

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як взаємодія хазяїн-вірус, убіквітинування білків, ацетиляція, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, ядрі, мембрані.

Література

• Shen Z., Pardington-Purtymun P.E., Comeaux J.C., Moyzis R.K., Chen D.J. (1996). UBL1, a human ubiquitin-like protein associating with human RAD51/RAD52 proteins. Genomics. 36: 271—279. PMID 8812453 DOI:10.1006/geno.1996.0462
• Mahajan R., Delphin C., Guan T., Gerace L., Melchior F. (1997). A small ubiquitin-related polypeptide involved in targeting RanGAP1 to nuclear pore complex protein RanBP2. Cell. 88: 97—107. PMID 9019411 DOI:10.1016/S0092-8674(00)81862-0
• Matunis M.J., Coutavas E., Blobel G. (1996). A novel ubiquitin-like modification modulates the partitioning of the Ran-GTPase-activating protein RanGAP1 between the cytosol and the nuclear pore complex. J. Cell Biol. 135: 1457—1470. PMID 8978815 DOI:10.1083/jcb.135.6.1457
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Kamitani T., Nguyen H.P., Yeh E.T.H. (1997). Preferential modification of nuclear proteins by a novel ubiquitin-like molecule. J. Biol. Chem. 272: 14001—14004. PMID 9162015 DOI:10.1074/jbc.272.22.14001
• Minty A., Dumont X., Kaghad M., Caput D. (2000). Covalent modification of p73alpha by SUMO-1. Two-hybrid screening with p73 identifies novel SUMO-1-interacting proteins and a SUMO-1 interaction motif. J. Biol. Chem. 275: 36316—36323. PMID 10961991 DOI:10.1074/jbc.M004293200

Примітки

1. Human PubMed Reference:.
2. Mouse PubMed Reference:.
3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:12502 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.
4. UniProt, P63165 (англ.) . Архів оригіналу за 27 серпня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.

Див. також

• Хромосома 2

Портал «Біологія»   Портал «Хімія»