SUPV3L1

SUPV3L1
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	3RC3, 3RC8
Ідентифікатори
Символи	SUPV3L1, SUV3, Suv3 like RNA helicase
Зовнішні ІД	OMIM: 605122 MGI: 2441711 HomoloGene: 2386 GeneCards: SUPV3L1
Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding; • nucleotide binding; • protein homodimerization activity; • GO:0008026 helicase activity; • GO:0034459 3'-5' RNA helicase activity; • hydrolase activity, acting on acid anhydrides; • GO:0004003 DNA helicase activity; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • double-stranded RNA binding; • ATP binding; • hydrolase activity; • RNA binding;
Клітинна компонента	• mitochondrial degradosome; • мітохондріальний матрикс; • мітохондрія; • mitochondrial nucleoid; • клітинне ядро;
Біологічний процес	• DNA recombination; • mitochondrial mRNA catabolic process; • mitochondrial ncRNA surveillance; • mitochondrial RNA 3'-end processing; • Деградація РНК; • negative regulation of apoptotic process; • positive regulation of cell growth; • DNA duplex unwinding; • mitochondrial mRNA surveillance; • mitochondrion morphogenesis; • mitochondrial RNA surveillance; • positive regulation of mitochondrial RNA catabolic process;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	6832
	338359
	ENSG00000156502
	ENSMUSG00000020079
	Q8IYB8
	Q80YD1
NM_001301683; NM_003171; NM_001323584; NM_001323585; NM_001323586;
	NM_001323587; NM_001323588
	NM_181423; NM_001359806
NP_001288612; NP_001310513; NP_001310514; NP_001310515; NP_001310516;
	NP_001310517; NP_003162
	NP_852088; NP_001346735
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

SUPV3L1 (англ. Suv3 like RNA helicase) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 10-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 786 амінокислот, а молекулярна маса — 87 991^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSFSRALLWA	RLPAGRQAGH	RAAICSALRP	HFGPFPGVLG	QVSVLATASS
SASGGSKIPN	TSLFVPLTVK	PQGPSADGDV	GAELTRPLDK	NEVKKVLDKF
YKRKEIQKLG	ADYGLDARLF	HQAFISFRNY	IMQSHSLDVD	IHIVLNDICF
GAAHADDLFP	FFLRHAKQIF	PVLDCKDDLR	KISDLRIPPN	WYPDARAMQR
KIIFHSGPTN	SGKTYHAIQK	YFSAKSGVYC	GPLKLLAHEI	FEKSNAAGVP
CDLVTGEERV	TVQPNGKQAS	HVSCTVEMCS	VTTPYEVAVI	DEIQMIRDPA
RGWAWTRALL	GLCAEEVHLC	GEPAAIDLVM	ELMYTTGEEV	EVRDYKRLTP
ISVLDHALES	LDNLRPGDCI	VCFSKNDIYS	VSRQIEIRGL	ESAVIYGSLP
PGTKLAQAKK	FNDPNDPCKI	LVATDAIGMG	LNLSIRRIIF	YSLIKPSINE
KGERELEPIT	TSQALQIAGR	AGRFSSRFKE	GEVTTMNHED	LSLLKEILKR
PVDPIRAAGL	HPTAEQIEMF	AYHLPDATLS	NLIDIFVDFS	QVDGQYFVCN
MDDFKFSAEL	IQHIPLSLRV	RYVFCTAPIN	KKQPFVCSSL	LQFARQYSRN
EPLTFAWLRR	YIKWPLLPPK	NIKDLMDLEA	VHDVLDLYLW	LSYRFMDMFP
DASLIRDLQK	ELDGIIQDGV	HNITKLIKMS	ETHKLLNLEG	FPSGSQSRLS
GTLKSQARRT	RGTKALGSKA	TEPPSPDAGE	LSLASRLVQQ	GLLTPDMLKQ
LEKEWMTQQT	EHNKEKTESG	THPKGTRRKK	KEPDSD

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, геліказ, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як ацетилювання. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у ядрі, мітохондрії, мітохондріальному нуклеоїді.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Shu Z., Vijayakumar S., Chen C.-F., Chen P.-L., Lee W.-H. (2004). Purified human SUV3p exhibits multiple-substrate unwinding activity upon conformational change. Biochemistry. 43: 4781—4790. PMID 15096047 DOI:10.1021/bi0356449
Minczuk M., Mroczek S., Pawlak S.D., Stepien P.P. (2005). Human ATP-dependent RNA/DNA helicase hSuv3p interacts with the cofactor of survivin HBXIP. FEBS J. 272: 5008—5019. PMID 16176273 DOI:10.1111/j.1742-4658.2005.04910.x
Bogenhagen D.F., Rousseau D., Burke S. (2008). The layered structure of human mitochondrial DNA nucleoids. J. Biol. Chem. 283: 3665—3675. PMID 18063578 DOI:10.1074/jbc.M708444200
Wang D.D., Shu Z., Lieser S.A., Chen P.L., Lee W.H. (2009). Human mitochondrial SUV3 and polynucleotide phosphorylase form a 330-kDa heteropentamer to cooperatively degrade double-stranded RNA with a 3'-to-5' directionality. J. Biol. Chem. 284: 20812—20821. PMID 19509288 DOI:10.1074/jbc.M109.009605

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11471 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q8IYB8 (англ.) . Архів оригіналу за 10 березня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 10

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11471 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-4] UniProt, Q8IYB8 (англ.) . Архів оригіналу за 10 березня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]