SUPV3L1

SUPV3L1
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Ідентифікатори
Символи SUPV3L1, SUV3, Suv3 like RNA helicase
Зовнішні ІД OMIM: 605122 MGI: 2441711 HomoloGene: 2386 GeneCards: SUPV3L1
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
NM_181423
NM_001359806
RefSeq (білок)
NP_852088
NP_001346735
Локус (UCSC) Хр. 10: 69.18 – 69.21 Mb Хр. 10: 62.26 – 62.29 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

SUPV3L1 (англ. Suv3 like RNA helicase) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 10-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 786 амінокислот, а молекулярна маса — 87 991[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MSFSRALLWARLPAGRQAGHRAAICSALRPHFGPFPGVLGQVSVLATASS
SASGGSKIPNTSLFVPLTVKPQGPSADGDVGAELTRPLDKNEVKKVLDKF
YKRKEIQKLGADYGLDARLFHQAFISFRNYIMQSHSLDVDIHIVLNDICF
GAAHADDLFPFFLRHAKQIFPVLDCKDDLRKISDLRIPPNWYPDARAMQR
KIIFHSGPTNSGKTYHAIQKYFSAKSGVYCGPLKLLAHEIFEKSNAAGVP
CDLVTGEERVTVQPNGKQASHVSCTVEMCSVTTPYEVAVIDEIQMIRDPA
RGWAWTRALLGLCAEEVHLCGEPAAIDLVMELMYTTGEEVEVRDYKRLTP
ISVLDHALESLDNLRPGDCIVCFSKNDIYSVSRQIEIRGLESAVIYGSLP
PGTKLAQAKKFNDPNDPCKILVATDAIGMGLNLSIRRIIFYSLIKPSINE
KGERELEPITTSQALQIAGRAGRFSSRFKEGEVTTMNHEDLSLLKEILKR
PVDPIRAAGLHPTAEQIEMFAYHLPDATLSNLIDIFVDFSQVDGQYFVCN
MDDFKFSAELIQHIPLSLRVRYVFCTAPINKKQPFVCSSLLQFARQYSRN
EPLTFAWLRRYIKWPLLPPKNIKDLMDLEAVHDVLDLYLWLSYRFMDMFP
DASLIRDLQKELDGIIQDGVHNITKLIKMSETHKLLNLEGFPSGSQSRLS
GTLKSQARRTRGTKALGSKATEPPSPDAGELSLASRLVQQGLLTPDMLKQ
LEKEWMTQQTEHNKEKTESGTHPKGTRRKKKEPDSD

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, геліказ, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як ацетилювання. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у ядрі, мітохондрії, мітохондріальному нуклеоїді.

Література

[ред. | ред. код]
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Shu Z., Vijayakumar S., Chen C.-F., Chen P.-L., Lee W.-H. (2004). Purified human SUV3p exhibits multiple-substrate unwinding activity upon conformational change. Biochemistry. 43: 4781—4790. PMID 15096047 DOI:10.1021/bi0356449
  • Minczuk M., Mroczek S., Pawlak S.D., Stepien P.P. (2005). Human ATP-dependent RNA/DNA helicase hSuv3p interacts with the cofactor of survivin HBXIP. FEBS J. 272: 5008—5019. PMID 16176273 DOI:10.1111/j.1742-4658.2005.04910.x
  • Bogenhagen D.F., Rousseau D., Burke S. (2008). The layered structure of human mitochondrial DNA nucleoids. J. Biol. Chem. 283: 3665—3675. PMID 18063578 DOI:10.1074/jbc.M708444200
  • Wang D.D., Shu Z., Lieser S.A., Chen P.L., Lee W.H. (2009). Human mitochondrial SUV3 and polynucleotide phosphorylase form a 330-kDa heteropentamer to cooperatively degrade double-stranded RNA with a 3'-to-5' directionality. J. Biol. Chem. 284: 20812—20821. PMID 19509288 DOI:10.1074/jbc.M109.009605

Примітки

[ред. | ред. код]
  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11471 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
  4. UniProt, Q8IYB8 (англ.) . Архів оригіналу за 10 березня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.

Див. також

[ред. | ред. код]