SYT2

SYT2
Ідентифікатори
Символи	SYT2, SytII, CMS7, MYSPC, synaptotagmin 2, CMS7A, CMS7B
Зовнішні ІД	OMIM: 600104 MGI: 99666 HomoloGene: 22516 GeneCards: SYT2
Пов'язані генетичні захворювання
congenital myasthenic syndrome 7[1]
Онтологія гена Молекулярна функція • зв'язування з іоном металу • calcium ion binding • inositol 1,3,4,5 tetrakisphosphate binding • clathrin binding • syntaxin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • calcium-dependent phospholipid binding • SNARE binding • phosphatidylserine binding Клітинна компонента • міжклітинні контакти • chromaffin granule membrane • Синаптичні бульбашки • мембрана • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • синапс • integral component of membrane • synaptic vesicle membrane • клітинна мембрана • clathrin-coated vesicle membrane • аксон • dense core granule • exocytic vesicle Біологічний процес • synaptic vesicle endocytosis • диференціація клітин • GO:0010554 neurotransmitter secretion • positive regulation of dendrite extension • vesicle fusion • regulation of calcium ion-dependent exocytosis • calcium ion-regulated exocytosis of neurotransmitter • membrane organization • regulation of dopamine secretion • synaptic vesicle exocytosis • vesicle-mediated transport • calcium-ion regulated exocytosis • cellular response to calcium ion Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	127833	20980
Ensembl	ENSG00000143858	ENSMUSG00000026452
UniProt	Q8N9I0	P46097
RefSeq (мРНК)	NM_001136504 NM_177402	NM_009307 NM_001355726
RefSeq (білок)	NP_001129976 NP_796376	NP_033333 NP_001342655
Локус (UCSC)	Хр. 1: 202.59 – 202.71 Mb	Хр. 1: 134.57 – 134.69 Mb
PubMed search	[2]	[3]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SYT2 (англ. Synaptotagmin 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. ^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 419 амінокислот, а молекулярна маса — 46 872^[5].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MRNIFKRNQE		PIVAPATTTA		TMPIGPVDNS		TESGGAGESQ		EDMFAKLKEK
LFNEINKIPL		PPWALIAIAV		VAGLLLLTCC		FCICKKCCCK		KKKNKKEKGK
GMKNAMNMKD		MKGGQDDDDA		ETGLTEGEGE		GEEEKEPENL		GKLQFSLDYD
FQANQLTVGV		LQAAELPALD		MGGTSDPYVK		VFLLPDKKKK		YETKVHRKTL
NPAFNETFTF		KVPYQELGGK		TLVMAIYDFD		RFSKHDIIGE		VKVPMNTVDL
GQPIEEWRDL		QGGEKEEPEK		LGDICTSLRY		VPTAGKLTVC		ILEAKNLKKM
DVGGLSDPYV		KIHLMQNGKR		LKKKKTTVKK		KTLNPYFNES		FSFEIPFEQI
QKVQVVVTVL		DYDKLGKNEA		IGKIFVGSNA		TGTELRHWSD		MLANPRRPIA
QWHSLKPEEE		VDALLGKNK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі як диференціація. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію. Локалізований у мембрані, клітинних контактах, цитоплазматичних везикулах, синапсах.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
• Martina J.A., Bonangelino C.J., Aguilar R.C., Bonifacino J.S. (2001). Stonin 2: an adaptor-like protein that interacts with components of the endocytic machinery. J. Cell Biol. 153: 1111—1120. PMID 11381094 doi:10.1083/jcb.153.5.1111

Примітки

1. Захворювання, генетично пов'язані з SYT2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
2. Human PubMed Reference:.
3. Mouse PubMed Reference:.
4. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11510 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.
5. UniProt, Q8N9I0 (англ.) . Архів оригіналу за 27 липня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.

Див. також

• Хромосома 1

Портал «Біологія»   Портал «Хімія»