SYT5

SYT5
Ідентифікатори
Символи	SYT5, synaptotagmin 5
Зовнішні ІД	OMIM: 600782 MGI: 1926368 HomoloGene: 55722 GeneCards: SYT5
Онтологія гена Молекулярна функція • clathrin binding • зв'язування з іоном металу • protein heterodimerization activity • calcium-dependent phospholipid binding • syntaxin binding • SNARE binding • phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate binding • phosphatidylserine binding • calcium ion binding Клітинна компонента • integral component of membrane • ендосома • мембрана • синапс • synaptic vesicle membrane • міжклітинні контакти • soma • recycling endosome membrane • perinuclear region of cytoplasm • neuron projection • dense core granule • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • клітинна мембрана • proximal neuron projection • integral component of neuronal dense core vesicle membrane • аксон • exocytic vesicle Біологічний процес • synaptic vesicle endocytosis • chemical synaptic transmission • vesicle fusion • regulation of calcium ion-dependent exocytosis • calcium ion-regulated exocytosis of neurotransmitter • regulation of dopamine secretion • synaptic vesicle exocytosis • vesicle-mediated transport • calcium-ion regulated exocytosis • cellular response to calcium ion Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	6861	53420
Ensembl	ENSG00000129990	ENSMUSG00000004961
UniProt	O00445	Q9R0N5
RefSeq (мРНК)	NM_001297774 NM_003180	NM_016908 NM_001360421 NM_001360422
RefSeq (білок)	NP_001284703 NP_003171	NP_001347350 NP_001347351
Локус (UCSC)	Хр. 19: 55.17 – 55.18 Mb	Хр. 7: 4.54 – 4.55 Mb
PubMed search	[1]	[2]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SYT5 (англ. Synaptotagmin 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 386 амінокислот, а молекулярна маса — 42 900^[4].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MFPEPPTPGP		PSPDTPPDSS		RISHGPVPPW		ALATIVLVSG		LLIFSCCFCL
YRKSCRRRTG		KKSQAQAQVH		LQEVKGLGQS		YIDKVQPEVE		ELEPAPSGPG
QQVADKHELG		RLQYSLDYDF		QSGQLLVGIL		QAMGLAALDL		GGSSDPYVRV
YLLPDKRRRY		ETKVHRQTLN		PHFGETFAFK		VPYVELGGRV		LVMAVYDFDR
FSRNDAIGEV		RVPMSSVDLG		RPVQAWRELQ		AAPREEQEKL		GDICFSLRYV
PTAGKLTVIV		LEAKNLKKMD		VGGLSDPYVK		VHLLQGGKKV		RKKKTTIKKN
TLNPYYNEAF		SFEVPCDQVQ		KVQVELTVLD		YDKLGKNEAI		GRVAVGAAAG
GAGLRHWADM		LANPRRPIAQ		WHSLRPPDRV		RLLPAP

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію. Локалізований у мембрані, клітинних контактах, цитоплазматичних везикулах, синапсах, ендосомах.

Література

• Craxton M.A., Olsen A., Goedert M. (1997). Human synaptotagmin V (SYT5): sequence, genomic structure, and chromosomal location. Genomics. 42: 165—169. PMID 9177789 DOI:10.1006/geno.1997.4722
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Qiu X., Ge J., Gao Y., Teng M., Niu L. (2017). Structural analysis of Ca2+-binding pocket of synaptotagmin 5 C2A domain. Int. J. Biol. Macromol. 95: 946—953. PMID 27793683 DOI:10.1016/j.ijbiomac.2016.10.083

Примітки

1. Human PubMed Reference:.
2. Mouse PubMed Reference:.
3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11513 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
4. UniProt, O00445 (англ.) . Архів оригіналу за 3 лютого 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

• Хромосома 19

Портал «Біологія»   Портал «Хімія»