Shewanella oneidensis

Shewanella oneidensis
Мікрофотографія S. oneidensis під СЕМ
Мікрофотографія S. oneidensis під СЕМ
Біологічна класифікація
Домен: Бактерії (Bacteria)
Тип: Proteobacteria
Клас: Gamma Proteobacteria
Ряд: Alteromonadales
Родина: Shewanellaceae
Рід: Shewanella
Вид: Shewanella oneidensis
Shewanella oneidensis
Venkateswaran et al. 1999
Посилання
Вікісховище: Shewanella oneidensis
EOL: 972511
ITIS: 965992
NCBI: 70863

Shewanella oneidensis — грамнегативна, факультативно анаеробна бактерія роду Shewanella, що мешкає переважно на дні морів в анаеробних умовах, осадкових відкладеннях, також може бути знайдена в ґрунті. Здатна відновлювати сполуки металів. Зараз ведуться роботи по використанню Shewanella oneidensis в біозахисті металевих поверхонь від корозії. Видову назву бактерія отримала на честь озера Онейда в штаті Нью-Йорк, США, з якого цей мікроорганізм був вперше виділений.

Систематика

[ред. | ред. код]

Номенклатура бактерій Alteromonas hanedai і A. putrefacians була розроблена в 1981 році. A. hanedai була новим описаним видом, а A. putrefacians була виділена з роду Achromobacter. У 1985 році, на підставі вивчення нуклеотидних послідовностей 5S рРНК, Макдоннел (MacDonell) і Колвелл (Colwell) виділили A. hanedai і A. putrefacians до окремого роду Shewanella[1]. Автори також запропонували класифікувати виділені з дна моря барофільні бактерії як Shewanella benthica. У 1989 році, на підставі молекулярних досліджень (ДНК-ДНК гібридизації, аналізу 5S рРНК) і вивченні серологічних властивостей, Койне (Coyne) запропонував перенести Alteromonas colwelliana до роду Shewanella. У 1999 році Венкатесварен (Venkateswaran) та ін. описали два нових види роду — Shewanella oneidensis і Shewanella pealeana[2].

Біологічні властивості

[ред. | ред. код]

Морфологія

[ред. | ред. код]

Shewanella oneidensis — грамнегативні прямі або злегка зігнуті паличкоподібні бактерії розміром 1,5-4,6 × 0,4-1 мікрон. Не утворюють спор, рухомі, за допомогою полярно розташованих джгутиків.

Фізіологічні властивості

[ред. | ред. код]

Це галотолерантний (здатний рости в 3 % розчині NaCl), факультативно анаеробний мікроорганізм. Утворює оксидазу і каталазу, не продукує індол, не зброджуює глюкозу. Здатний відновлювати тріметиламін-N-оксид, оксиди заліза[3], оксид марганцю[4], оксиди хрому[5], розчинені сполуки урану[6]. Здібний до утворення біоплівок на поверхні твердого субстрату[7], також здатний до адгезії на поверхню оксидів металів[8].

Геном

[ред. | ред. код]

Геном S. oneidensis штаму MR-1 складається з одної хромосоми, що є кільцевою дволанцюжковою молекулою ДНК розміром 4969803 пар основ, містить 4561 гени та має вміст ГЦ 45,96 %; і плазміди pMR-1 розміром 161613 пар основ, що містить 184 гени та має вміст ГЦ 43,69 %[9].

Посилання

[ред. | ред. код]
  1. MacDonell M.T., Colwell R.R (1985). Phylogeny of the Vibrionaceae, and recommendation for two new genera, Listonella and Shewanella. Syst. Appl. Microbiol. 6: 171—182.
  2. Venkateswaran 0K та ін. (1999). Polyphasic taxonomy of the genus Shewanella and description of Shewanella oneidensis sp. nov. Int J Syst Bacteriol. 49 (2): 705—724. Архів оригіналу за 29 грудня 2007. Процитовано 25 вересня 2008. {{cite journal}}: Явне використання «та ін.» у: |author= (довідка)
  3. Архівована копія (PDF). Архів оригіналу (PDF) за 5 вересня 2008. Процитовано 25 вересня 2008.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з текстом «archived copy» як значення параметру title (посилання)
  4. http://www.faqs.org/abstracts/Biological-sciences/VanadiumV-reduction-by-Shewanella-oneidensis-MR-1-requires-menaquinone-and-cytochromes-from-the-cyto.html
  5. http://www3.interscience.wiley.com/journal/104540611/abstract[недоступне посилання з травня 2019]
  6. Архівована копія. Архів оригіналу за 20 червня 2008. Процитовано 25 вересня 2008.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з текстом «archived copy» як значення параметру title (посилання)
  7. http://lib.bioinfo.pl/pmid:15659679[недоступне посилання з лютого 2019]
  8. Архівована копія. Архів оригіналу за 13 лютого 2008. Процитовано 25 вересня 2008.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з текстом «archived copy» як значення параметру title (посилання)
  9. Shewanella oneidensis (Shewanella oneidensis MR-1) Genome Browser Gateway [Архівовано 10 листопада 2007 у Wayback Machine.] The UCSC Genome Browser

Ресурси Інтернету

[ред. | ред. код]