TBK1

TBK1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4EFO, 4EUT, 4EUU, 4IM0, 4IM2, 4IM3, 4IW0, 4IWO, 4IWP, 4IWQ
Ідентифікатори
Символи	TBK1, Tbk1, 1200008B05Rik, AI462036, AW048562, NAK, T2K, FTDALS4, TANK binding kinase 1, IIAE8
Зовнішні ІД	OMIM: 604834 MGI: 1929658 HomoloGene: 22742 GeneCards: TBK1
Пов'язані генетичні захворювання
FTDALS4[1]
Реагує на сполуку
Viroporin 3a[2]
Онтологія гена Молекулярна функція • transferase activity • nucleotide binding • kinase activity • protein serine/threonine kinase activity • phosphoprotein binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • nucleic acid binding • ATP binding • protein kinase activity • identical protein binding • protein phosphatase binding Клітинна компонента • цитоплазма • гіалоплазма • endosome membrane • нуклеоплазма • aggresome Біологічний процес • фосфорилювання • positive regulation of interferon-alpha production • процес імунної системи • response to virus • positive regulation of xenophagy • negative regulation of gene expression • positive regulation of peptidyl-serine phosphorylation • TRIF-dependent toll-like receptor signaling pathway • type I interferon production • defense response to virus • GO:0035404 peptidyl-serine phosphorylation • regulation of neuron death • activation of innate immune response • positive regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling • negative regulation of type I interferon production • вроджений імунітет • GO:0022415 viral process • inflammatory response • I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling • positive regulation of type I interferon production • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • dendritic cell proliferation • GO:0051637 defense response to Gram-positive bacterium • positive regulation of interferon-beta production • regulation of type I interferon production • positive regulation of macroautophagy • peptidyl-threonine phosphorylation • protein phosphorylation • cellular response to cytokine stimulus • регуляція експресії генів • regulation of cellular metabolic process • positive regulation of type I interferon-mediated signaling pathway Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	29110	56480
Ensembl	ENSG00000183735	ENSMUSG00000020115
UniProt	Q9UHD2	Q9WUN2
RefSeq (мРНК)	NM_013254	NM_019786
RefSeq (білок)	NP_037386	NP_062760
Локус (UCSC)	Хр. 12: 64.45 – 64.5 Mb	Хр. 10: 121.38 – 121.42 Mb
PubMed search	[3]	[4]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

TBK1 (англ. TANK binding kinase 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.^[5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 729 амінокислот, а молекулярна маса — 83 642^[6].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MQSTSNHLWL		LSDILGQGAT		ANVFRGRHKK		TGDLFAIKVF		NNISFLRPVD
VQMREFEVLK		KLNHKNIVKL		FAIEEETTTR		HKVLIMEFCP		CGSLYTVLEE
PSNAYGLPES		EFLIVLRDVV		GGMNHLRENG		IVHRDIKPGN		IMRVIGEDGQ
SVYKLTDFGA		ARELEDDEQF		VSLYGTEEYL		HPDMYERAVL		RKDHQKKYGA
TVDLWSIGVT		FYHAATGSLP		FRPFEGPRRN		KEVMYKIITG		KPSGAISGVQ
KAENGPIDWS		GDMPVSCSLS		RGLQVLLTPV		LANILEADQE		KCWGFDQFFA
ETSDILHRMV		IHVFSLQQMT		AHKIYIHSYN		TATIFHELVY		KQTKIISSNQ
ELIYEGRRLV		LEPGRLAQHF		PKTTEENPIF		VVSREPLNTI		GLIYEKISLP
KVHPRYDLDG		DASMAKAITG		VVCYACRIAS		TLLLYQELMR		KGIRWLIELI
KDDYNETVHK		KTEVVITLDF		CIRNIEKTVK		VYEKLMKINL		EAAELGEISD
IHTKLLRLSS		SQGTIETSLQ		DIDSRLSPGG		SLADAWAHQE		GTHPKDRNVE
KLQVLLNCMT		EIYYQFKKDK		AERRLAYNEE		QIHKFDKQKL		YYHATKAMTH
FTDECVKKYE		AFLNKSEEWI		RKMLHLRKQL		LSLTNQCFDI		EEEVSKYQEY
TNELQETLPQ		KMFTASSGIK		HTMTPIYPSS		NTLVEMTLGM		KKLKEEMEGV
VKELAENNHI		LERFGSLTMD		GGLRNVDCL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, кіназ, серин/треонінових протеїнкіназ, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як імунітет, вроджений імунітет, взаємодія хазяїн-вірус, противірусний захист. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у цитоплазмі.

Література

• Pomerantz J.L., Baltimore D. (1999). NF-kB activation by a signaling complex containing TRAF2, TANK, and TBK1, a novel IKK-related kinase. EMBO J. 18: 6694—6704. PMID 10581243 DOI:10.1093/emboj/18.23.6694
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Johnsen I.B., Nguyen T.T., Bergstroem B., Fitzgerald K.A., Anthonsen M.W. (2009). The tyrosine kinase c-Src enhances RIG-I (retinoic acid-inducible gene I)-elicited antiviral signaling. J. Biol. Chem. 284: 19122—19131. PMID 19419966 DOI:10.1074/jbc.M808233200
• Prins K.C., Cardenas W.B., Basler C.F. (2009). Ebola virus protein VP35 impairs the function of interferon regulatory factor-activating kinases IKKepsilon and TBK-1. J. Virol. 83: 3069—3077. PMID 19153231 DOI:10.1128/JVI.01875-08
• Li S., Wang L., Berman M., Kong Y.Y., Dorf M.E. (2011). Mapping a dynamic innate immunity protein interaction network regulating type I interferon production. Immunity. 35: 426—440. PMID 21903422 DOI:10.1016/j.immuni.2011.06.014
• Liu X.Y., Chen W., Wei B., Shan Y.F., Wang C. (2011). IFN-induced TPR protein IFIT3 potentiates antiviral signaling by bridging MAVS and TBK1. J. Immunol. 187: 2559—2568. PMID 21813773 DOI:10.4049/jimmunol.1100963

Примітки

1. Захворювання, генетично пов'язані з TBK1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
2. Сполуки, які фізично взаємодіють з TANK binding kinase 1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
3. Human PubMed Reference:.
4. Mouse PubMed Reference:.
5. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11584 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.
6. UniProt, Q9UHD2 (англ.) . Архів оригіналу за 23 вересня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

• Хромосома 12

Портал «Біологія»   Портал «Хімія»