TIMP3

TIMP3
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	3CKI
Ідентифікатори
Символи	TIMP3, HSMRK222, K222, K222TA2, SFD, TIMP metallopeptidase inhibitor 3
Зовнішні ІД	OMIM: 188826 MGI: 98754 HomoloGene: 36322 GeneCards: TIMP3
Пов'язані генетичні захворювання
	Sorsby's fundus dystrophy
Онтологія гена
Молекулярна функція	• peptidase inhibitor activity; • GO:0048551 enzyme inhibitor activity; • зв'язування з іоном металу; • protease binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • metalloendopeptidase inhibitor activity;
Клітинна компонента	• GO:0005578 Позаклітинна матриця; • базальна мембрана; • екзосома; • клітинне ядро; • extracellular region; • platelet dense granule lumen; • міжклітинний простір; • collagen-containing extracellular matrix;
Біологічний процес	• cellular response to organic substance; • negative regulation of peptidase activity; • відповідь на стимул; • positive regulation of TRAIL-activated apoptotic signaling pathway; • negative regulation of ERK1 and ERK2 cascade; • negative regulation of membrane protein ectodomain proteolysis; • зір; • platelet degranulation; • response to organic substance; • negative regulation of metalloendopeptidase activity; • response to hormone; • negative regulation of endopeptidase activity; • response to cytokine;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ; ; ;
	Більше даних
Ортологи
	7078
	21859
	ENSG00000100234
	ENSMUSG00000020044
	P35625
	P39876
	NM_000362
	NM_011595
	NP_000353
	NP_035725
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

TIMP3 (англ. TIMP metallopeptidase inhibitor 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 22-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 211 амінокислот, а молекулярна маса — 24 145^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MTPWLGLIVL	LGSWSLGDWG	AEACTCSPSH	PQDAFCNSDI	VIRAKVVGKK
LVKEGPFGTL	VYTIKQMKMY	RGFTKMPHVQ	YIHTEASESL	CGLKLEVNKY
QYLLTGRVYD	GKMYTGLCNF	VERWDQLTLS	QRKGLNYRYH	LGCNCKIKSC
YYLPCFVTSK	NECLWTDMLS	NFGYPGYQSK	HYACIRQKGG	YCSWYRGWAP
PDKSIINATD	P

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до інгібіторів протеаз, інгібіторів металоферментів. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у позаклітинному матриксі. Також секретований назовні.

Література

Silbiger S.M., Jacobsen V.L., Cupples R.L., Koski R.A. (1994). Cloning of cDNAs encoding human TIMP-3, a novel member of the tissue inhibitor of metalloproteinase family. Gene. 141: 293—297. PMID 8163205 doi:10.1016/0378-1119(94)90588-6
Stoehr H., Roomp K., Felbor U., Weber B.H.F. (1995). Genomic organization of the human tissue inhibitor of metalloproteinases-3 (TIMP3). Genome Res. 5: 483—487. PMID 8808469 doi:10.1101/gr.5.5.483
Ruiz A.C., Brett P., Bok D. (1996). TIMP-3 is expressed in the human retinal pigment epithelium. Biochem. Biophys. Res. Commun. 226: 467—474. PMID 8806658 doi:10.1006/bbrc.1996.1379
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Apte S.S., Mattei M.-G., Olsen B.R. (1994). Cloning of the cDNA encoding human tissue inhibitor of metalloproteinases-3 (TIMP-3) and mapping of the TIMP3 gene to chromosome 22. Genomics. 19: 86—90. PMID 8188246 doi:10.1006/geno.1994.1016
Kishnani N.S., Staskus P.W., Yang T.-T., Masiarz F.R., Hawkes S.P. (1995). Identification and characterization of human tissue inhibitor of metalloproteinase-3 and detection of three additional metalloproteinase inhibitor activities in extracellular matrix. Matrix Biol. 14: 479—488. PMID 7795886 doi:10.1016/0945-053X(95)90005-5

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з TIMP3 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11822 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, P35625 (англ.) . Архів оригіналу за 23 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 22

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Захворювання, генетично пов'язані з TIMP3 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11822 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-5] UniProt, P35625 (англ.) . Архів оригіналу за 23 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]