TPBG

TPBG
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4CNC, 4CNM
Ідентифікатори
Символи	TPBG, 5T4, 5T4AG, M6P1, WAIF1, trophoblast glycoprotein
Зовнішні ІД	OMIM: 190920 MGI: 1341264 HomoloGene: 4859 GeneCards: TPBG
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	7162	21983
Ensembl	ENSG00000146242 ENSG00000283085	ENSMUSG00000035274
UniProt	Q13641	Q9Z0L0
RefSeq (мРНК)	NM_001166392 NM_006670 NM_001376922	NM_001164792 NM_011627
RefSeq (білок)	NP_001159864 NP_006661 NP_001363851	NP_001158264 NP_035757
Локус (UCSC)	Хр. 6: 82.36 – 82.37 Mb	Хр. 9: 85.72 – 85.73 Mb
PubMed search	[1]	[2]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

TPBG (англ. Trophoblast glycoprotein) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 420 амінокислот, а молекулярна маса — 46 032^[4].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MPGGCSRGPA		AGDGRLRLAR		LALVLLGWVS		SSSPTSSASS		FSSSAPFLAS
AVSAQPPLPD		QCPALCECSE		AARTVKCVNR		NLTEVPTDLP		AYVRNLFLTG
NQLAVLPAGA		FARRPPLAEL		AALNLSGSRL		DEVRAGAFEH		LPSLRQLDLS
HNPLADLSPF		AFSGSNASVS		APSPLVELIL		NHIVPPEDER		QNRSFEGMVV
AALLAGRALQ		GLRRLELASN		HFLYLPRDVL		AQLPSLRHLD		LSNNSLVSLT
YVSFRNLTHL		ESLHLEDNAL		KVLHNGTLAE		LQGLPHIRVF		LDNNPWVCDC
HMADMVTWLK		ETEVVQGKDR		LTCAYPEKMR		NRVLLELNSA		DLDCDPILPP
SLQTSYVFLG		IVLALIGAIF		LLVLYLNRKG		IKKWMHNIRD		ACRDHMEGYH
YRYEINADPR		LTNLSSNSDV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
• Zhao Y., Malinauskas T., Harlos K., Jones E.Y. (2014). Structural insights into the inhibition of Wnt signaling by cancer antigen 5T4/Wnt-activated inhibitory factor 1. Structure. 22: 612—620. PMID 24582434 doi:10.1016/j.str.2014.01.009

Примітки

1. Human PubMed Reference:.
2. Mouse PubMed Reference:.
3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:12004 (англ.) . Процитовано 6 вересня 2017.
4. UniProt, Q13641 (англ.) . Архів оригіналу за 24 серпня 2017. Процитовано 6 вересня 2017.

Див. також

• Хромосома 6

Портал «Біологія»   Портал «Хімія»