TREM2

TREM2
Ідентифікатори
Символи	TREM2, TREM-2, Trem2a, Trem2b, Trem2c, triggering receptor expressed on myeloid cells 2, PLOSL2
Зовнішні ІД	OMIM: 605086 MGI: 1913150 HomoloGene: 10352 GeneCards: TREM2
Пов'язані генетичні захворювання
	хвороба Альцгеймера, Nasu-Hakola disease
Онтологія гена
Молекулярна функція	• scaffold protein binding; • lipopolysaccharide binding; • lipoteichoic acid binding; • peptidoglycan binding; • phospholipid binding; • signaling receptor activity; • amyloid-beta binding; • high-density lipoprotein particle binding; • lipid binding; • low-density lipoprotein particle binding; • apolipoprotein binding; • apolipoprotein A-I binding; • very-low-density lipoprotein particle binding; • GO:0032403 protein-containing complex binding; • lipoprotein particle binding; • protein tyrosine kinase binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding;
Клітинна компонента	• integral component of membrane; • мембрана; • extracellular region; • клітинна мембрана; • integral component of plasma membrane; • intrinsic component of plasma membrane;
Біологічний процес	• dendritic cell differentiation; • positive regulation of CD40 signaling pathway; • positive regulation of calcium-mediated signaling; • positive regulation of C-C chemokine receptor CCR7 signaling pathway; • phagocytosis, engulfment; • detection of peptidoglycan; • humoral immune response; • cellular response to lipoteichoic acid; • positive regulation of protein localization to plasma membrane; • regulation of immune response; • positive regulation of peptidyl-tyrosine phosphorylation; • detection of lipoteichoic acid; • вроджений імунітет; • detection of lipopolysaccharide; • cellular response to peptidoglycan; • positive regulation of antigen processing and presentation of peptide antigen via MHC class II; • positive regulation of ERK1 and ERK2 cascade; • GO:0072468 сигнальна трансдукція; • osteoclast differentiation; • positive regulation of macrophage fusion; • positive regulation of amyloid-beta clearance; • positive regulation of protein phosphorylation; • регуляція експресії генів; • negative regulation of autophagy; • GO:1901313 positive regulation of gene expression; • positive regulation of mitochondrion organization; • regulation of TOR signaling; • positive regulation of TOR signaling; • regulation of interleukin-6 production; • regulation of peptidyl-tyrosine phosphorylation; • positive regulation of chemotaxis; • regulation of resting membrane potential; • positive regulation of astrocyte activation; • regulation of macrophage inflammatory protein 1 alpha production; • import into cell; • regulation of plasma membrane bounded cell projection organization; • positive regulation of proteasomal protein catabolic process; • positive regulation of inward rectifier potassium channel activity; • regulation of intracellular signal transduction; • positive regulation of microglial cell activation; • negative regulation of autophagic cell death; • positive regulation of microglial cell migration; • cellular response to amyloid-beta; • positive regulation of CAMKK-AMPK signaling cascade; • positive regulation of ATP biosynthetic process; • apoptotic cell clearance; • positive regulation of protein secretion; • microglial cell activation; • response to ischemia; • negative regulation of interleukin-1 beta production; • negative regulation of tumor necrosis factor production; • positive regulation of interleukin-10 production; • negative regulation of apoptotic process; • positive regulation of osteoclast differentiation; • positive regulation of NIK/NF-kappaB signaling; • microglial cell activation involved in immune response; • defense response to bacterium; • regulation of innate immune response; • positive regulation of phagocytosis, engulfment; • microglial cell proliferation; • amyloid-beta clearance; • complement-mediated synapse pruning; • neuroinflammatory response; • positive regulation of neuroinflammatory response; • positive regulation of engulfment of apoptotic cell;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	54209
	83433
	ENSG00000095970
	ENSMUSG00000023992
	Q9NZC2
	Q99NH8
	NM_001271821; NM_018965
	NM_001272078; NM_031254
	NP_001258750; NP_061838
	NP_001259007; NP_112544
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

TREM2 (англ. Triggering receptor expressed on myeloid cells 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 230 амінокислот, а молекулярна маса — 25 447^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MEPLRLLILL	FVTELSGAHN	TTVFQGVAGQ	SLQVSCPYDS	MKHWGRRKAW
CRQLGEKGPC	QRVVSTHNLW	LLSFLRRWNG	STAITDDTLG	GTLTITLRNL
QPHDAGLYQC	QSLHGSEADT	LRKVLVEVLA	DPLDHRDAGD	LWFPGESESF
EDAHVEHSIS	RSLLEGEIPF	PPTSILLLLA	CIFLIKILAA	SALWAAAWHG
QKPGTHPPSE	LDCGHDPGYQ	LQTLPGLRDT

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до рецепторів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані. Також секретований назовні.

Література

Bouchon A., Dietrich J., Colonna M. (2000). Inflammatory responses can be triggered by TREM-1, a novel receptor expressed on neutrophils and monocytes. J. Immunol. 164: 4991—4995. PMID 10799849 DOI:10.4049/jimmunol.164.10.4991
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з TREM2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:17761 (англ.) . Архів оригіналу за 5 квітня 2016. Процитовано 6 вересня 2017. [Архівовано 2016-04-05 у Wayback Machine.]
↑ UniProt, Q9NZC2 (англ.) . Архів оригіналу за 17 вересня 2017. Процитовано 6 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 6

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Захворювання, генетично пов'язані з TREM2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:17761 (англ.) . Архів оригіналу за 5 квітня 2016. Процитовано 6 вересня 2017. [Архівовано 2016-04-05 у Wayback Machine.]

[UniProt-5] UniProt, Q9NZC2 (англ.) . Архів оригіналу за 17 вересня 2017. Процитовано 6 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]