TRIM32

TRIM32
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2CT2, 5FEY
Ідентифікатори
Символи	TRIM32, BBS11, HT2A, LGMD2H, TATIP, tripartite motif containing 32, LGMDR8
Зовнішні ІД	OMIM: 602290 MGI: 1917057 HomoloGene: 36327 GeneCards: TRIM32
Пов'язані генетичні захворювання
autosomal recessive limb-girdle muscular dystrophy type 2H, Bardet-Biedl syndrome 11, autosomal recessive limb-girdle muscular dystrophy[1]
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:1904264, GO:1904822, GO:0090622, GO:0090302 ubiquitin protein ligase activity • myosin binding • GO:0001105 transcription coactivator activity • zinc ion binding • Tat protein binding • зв'язування з іоном металу • GO:0050372 ubiquitin-protein transferase activity • protein self-association • ubiquitin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA binding • translation initiation factor binding • transferase activity • identical protein binding Клітинна компонента • цитоплазма • гіалоплазма • внутрішньоклітинний • striated muscle myosin thick filament • клітинне ядро Біологічний процес • positive regulation of interleukin-17-mediated signaling pathway • axon development • positive regulation of cell motility • GO:1903364 positive regulation of protein catabolic process • muscle cell cellular homeostasis • positive regulation of tumor necrosis factor-mediated signaling pathway • positive regulation of cell migration • positive regulation of DNA-binding transcription factor activity • protein polyubiquitination • negative regulation of intrinsic apoptotic signaling pathway in response to DNA damage • actin ubiquitination • regulation of type I interferon production • response to tumor necrosis factor • positive regulation of neurogenesis • positive regulation of cell growth • positive regulation of cell cycle • positive regulation of NF-kappaB transcription factor activity • Убіквітин-залежний протеоліз • positive regulation of neuron differentiation • tissue homeostasis • positive regulation of striated muscle cell differentiation • positive regulation of proteolysis • positive regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling • вроджений імунітет • negative regulation of fibroblast proliferation • positive regulation of chemokine (C-C motif) ligand 20 production • fat cell differentiation • response to UV • negative regulation of viral transcription • ubiquitin-dependent protein catabolic process • positive regulation of nucleic acid-templated transcription • protein K48-linked ubiquitination Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	22954	69807
Ensembl	ENSG00000119401	ENSMUSG00000051675
UniProt	Q13049	Q8CH72
RefSeq (мРНК)	NM_001099679 NM_012210 NM_001379048 NM_001379049 NM_001379050	NM_001161782 NM_053084
RefSeq (білок)	NP_001093149 NP_036342 NP_001365977 NP_001365978 NP_001365979	NP_001155254 NP_444314
Локус (UCSC)	Хр. 9: 116.69 – 116.7 Mb	Хр. 4: 65.52 – 65.53 Mb
PubMed search	[2]	[3]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

TRIM32 (англ. Tripartite motif containing 32) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 653 амінокислот, а молекулярна маса — 71 989^[5].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAAAAASHLN		LDALREVLEC		PICMESFTEE		QLRPKLLHCG		HTICRQCLEK
LLASSINGVR		CPFCSKITRI		TSLTQLTDNL		TVLKIIDTAG		LSEAVGLLMC
RSCGRRLPRQ		FCRSCGLVLC		EPCREADHQP		PGHCTLPVKE		AAEERRRDFG
EKLTRLRELM		GELQRRKAAL		EGVSKDLQAR		YKAVLQEYGH		EERRVQDELA
RSRKFFTGSL		AEVEKSNSQV		VEEQSYLLNI		AEVQAVSRCD		YFLAKIKQAD
VALLEETADE		EEPELTASLP		RELTLQDVEL		LKVGHVGPLQ		IGQAVKKPRT
VNVEDSWAME		ATASAASTSV		TFREMDMSPE		EVVASPRASP		AKQRGPEAAS
NIQQCLFLKK		MGAKGSTPGM		FNLPVSLYVT		SQGEVLVADR		GNYRIQVFTR
KGFLKEIRRS		PSGIDSFVLS		FLGADLPNLT		PLSVAMNCQG		LIGVTDSYDN
SLKVYTLDGH		CVACHRSQLS		KPWGITALPS		GQFVVTDVEG		GKLWCFTVDR
GSGVVKYSCL		CSAVRPKFVT		CDAEGTVYFT		QGLGLNLENR		QNEHHLEGGF
SIGSVGPDGQ		LGRQISHFFS		ENEDFRCIAG		MCVDARGDLI		VADSSRKEIL
HFPKGGGYSV		LIREGLTCPV		GIALTPKGQL		LVLDCWDHCI		KIYSYHLRRY
STP

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як убіквітинування білків, ацетилювання. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі.

Література

• Fridell R.A., Harding L.S., Bogerd H.P., Cullen B.R. (1995). Identification of a novel human zinc finger protein that specifically interacts with the activation domain of lentiviral Tat proteins. Virology. 209: 347—357. PMID 7778269 DOI:10.1006/viro.1995.1266
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Locke M., Tinsley C.L., Benson M.A., Blake D.J. (2009). TRIM32 is an E3 ubiquitin ligase for dysbindin. Hum. Mol. Genet. 18: 2344—2358. PMID 19349376 DOI:10.1093/hmg/ddp167
• Zhang Q., Yu D., Seo S., Stone E.M., Sheffield V.C. (2012). Intrinsic protein-protein interaction-mediated and chaperonin-assisted sequential assembly of stable Bardet-Biedl syndrome protein complex, the BBSome. J. Biol. Chem. 287: 20625—20635. PMID 22500027 DOI:10.1074/jbc.M112.341487

Примітки

1. Захворювання, генетично пов'язані з TRIM32 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
2. Human PubMed Reference:.
3. Mouse PubMed Reference:.
4. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:16380 (англ.) . Архів оригіналу за 26 вересня 2017. Процитовано 8 вересня 2017. [Архівовано 2017-09-26 у Wayback Machine.]
5. UniProt, Q13049 (англ.) . Архів оригіналу за 24 вересня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.

Див. також

• Хромосома 9

Портал «Біологія»   Портал «Хімія»