TRPA1

TRPA1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3J9P
Ідентифікатори
Символи	TRPA1, ANKTM1, FEPS, transient receptor potential cation channel subfamily A member 1, FEPS1
Зовнішні ІД	OMIM: 604775 MGI: 3522699 HomoloGene: 7189 GeneCards: TRPA1
Реагує на сполуку
hexamethylene diisocyanate, Етаналь, апоморфін, auranofin, 1,4-Бензохінон, benzyl bromide, Бромоацетон, CS (іритант), Хлоропікрин, Дибензоксазепін, Дибутилфталат, methylglyoxal, methyl isocyanate, oleocanthal, хлорацетофенон, озон, Тимол, Акролеїн, Аліцин, тетрагідроканнабінол, URB597, ментол[1]
Онтологія гена Молекулярна функція • channel activity • calcium-release channel activity • ion channel activity • temperature-gated cation channel activity • calcium channel activity • identical protein binding Клітинна компонента • stereocilium bundle • integral component of membrane • мембрана • клітинна мембрана • integral component of plasma membrane Біологічний процес • GO:1904578 response to organic cyclic compound • detection of chemical stimulus involved in sensory perception of pain • відповідь на стимул • ion transport • response to organic substance • cell surface receptor signaling pathway • response to pain • calcium ion transmembrane transport • response to cold • sensory perception of pain • protein homotetramerization • response to hydrogen peroxide • thermoception • calcium ion transport • detection of mechanical stimulus involved in sensory perception of pain • release of sequestered calcium ion into cytosol • трансмембранний транспорт • ion transmembrane transport Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	8989	277328
Ensembl	ENSG00000104321	ENSMUSG00000032769
UniProt	O75762	Q8BLA8
RefSeq (мРНК)	NM_007332	NM_177781 NM_001348288
RefSeq (білок)	NP_015628	NP_808449 NP_001335217
Локус (UCSC)	Хр. 8: 72.02 – 72.08 Mb	Хр. 1: 14.94 – 14.99 Mb
PubMed search	[2]	[3]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

TRPA1 (англ. Transient receptor potential cation channel subfamily A member 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми. ^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 119 амінокислот, а молекулярна маса — 127 501^[5].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MKRSLRKMWR		PGEKKEPQGV		VYEDVPDDTE		DFKESLKVVF		EGSAYGLQNF
NKQKKLKRCD		DMDTFFLHYA		AAEGQIELME		KITRDSSLEV		LHEMDDYGNT
PLHCAVEKNQ		IESVKFLLSR		GANPNLRNFN		MMAPLHIAVQ		GMNNEVMKVL
LEHRTIDVNL		EGENGNTAVI		IACTTNNSEA		LQILLKKGAK		PCKSNKWGCF
PIHQAAFSGS		KECMEIILRF		GEEHGYSRQL		HINFMNNGKA		TPLHLAVQNG
DLEMIKMCLD		NGAQIDPVEK		GRCTAIHFAA		TQGATEIVKL		MISSYSGSVD
IVNTTDGCHE		TMLHRASLFD		HHELADYLIS		VGADINKIDS		EGRSPLILAT
ASASWNIVNL		LLSKGAQVDI		KDNFGRNFLH		LTVQQPYGLK		NLRPEFMQMQ
QIKELVMDED		NDGCTPLHYA		CRQGGPGSVN		NLLGFNVSIH		SKSKDKKSPL
HFAASYGRIN		TCQRLLQDIS		DTRLLNEGDL		HGMTPLHLAA		KNGHDKVVQL
LLKKGALFLS		DHNGWTALHH		ASMGGYTQTM		KVILDTNLKC		TDRLDEDGNT
ALHFAAREGH		AKAVALLLSH		NADIVLNKQQ		ASFLHLALHN		KRKEVVLTII
RSKRWDECLK		IFSHNSPGNK		CPITEMIEYL		PECMKVLLDF		CMLHSTEDKS
CRDYYIEYNF		KYLQCPLEFT		KKTPTQDVIY		EPLTALNAMV		QNNRIELLNH
PVCKEYLLMK		WLAYGFRAHM		MNLGSYCLGL		IPMTILVVNI		KPGMAFNSTG
IINETSDHSE		ILDTTNSYLI		KTCMILVFLS		SIFGYCKEAG		QIFQQKRNYF
MDISNVLEWI		IYTTGIIFVL		PLFVEIPAHL		QWQCGAIAVY		FYWMNFLLYL
QRFENCGIFI		VMLEVILKTL		LRSTVVFIFL		LLAFGLSFYI		LLNLQDPFSS
PLLSIIQTFS		MMLGDINYRE		SFLEPYLRNE		LAHPVLSFAQ		LVSFTIFVPI
VLMNLLIGLA		VGDIAEVQKH		ASLKRIAMQV		ELHTSLEKKL		PLWFLRKVDQ
KSTIVYPNKP		RSGGMLFHIF		CFLFCTGEIR		QEIPNADKSL		EMEILKQKYR
LKDLTFLLEK		QHELIKLIIQ		KMEIISETED		DDSHCSFQDR		FKKEQMEQRN
SRWNTVLRAV		KAKTHHLEP

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до іонних каналів. Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт іонів, транспорт. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

• Jaquemar D., Schenker T., Trueb B. (1999). An ankyrin-like protein with transmembrane domains is specifically lost after oncogenic transformation of human fibroblasts. J. Biol. Chem. 274: 7325—7333. PMID 10066796 doi:10.1074/jbc.274.11.7325
• Paulsen C.E., Armache J.P., Gao Y., Cheng Y., Julius D. (2015). Structure of the TRPA1 ion channel suggests regulatory mechanisms. Nature. 520: 511—517. PMID 25855297 doi:10.1038/nature14367

Примітки

1. Сполуки, які фізично взаємодіють з Transient receptor potential cation channel subfamily A member 1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
2. Human PubMed Reference:.
3. Mouse PubMed Reference:.
4. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:497 (англ.) . Процитовано 22 серпня 2017.
5. UniProt, O75762 (англ.) . Архів оригіналу за 1 вересня 2017. Процитовано 22 серпня 2017.

Див. також

• Хромосома 8

Портал «Біологія»   Портал «Хімія»