TRPC5

TRPC5
Ідентифікатори
Символи	TRPC5, PPP1R159, TRP5, transient receptor potential cation channel subfamily C member 5
Зовнішні ІД	OMIM: 300334 MGI: 109524 HomoloGene: 74915 GeneCards: TRPC5
Реагує на сполуку
Розиглітазон, Дайджеїн, Геністейн, 2-aminoethoxydiphenylborate, Прогестерон, хлорпромазин, flufenamic acid[1]
Онтологія гена Молекулярна функція • inositol 1,4,5 trisphosphate binding • ion channel activity • store-operated calcium channel activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • calcium channel activity • clathrin binding • actin binding • actinin binding • ATPase binding Клітинна компонента • integral component of membrane • клітинна мембрана • integral component of plasma membrane • Кальцієві канали • мембрана • цитоплазма • growth cone • soma • дендрит (нейробіологія) • membrane raft • cation channel complex Біологічний процес • manganese ion transport • ion transport • regulation of cytosolic calcium ion concentration • calcium ion transmembrane transport • calcium ion transport • нейробіологія розвитку • regulation of membrane hyperpolarization • positive regulation of peptidyl-threonine phosphorylation • positive regulation of axon extension • positive regulation of cell population proliferation • positive regulation of cytosolic calcium ion concentration • neuron differentiation • positive regulation of neuron differentiation • negative regulation of dendrite morphogenesis • трансмембранний транспорт Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	7224	22067
Ensembl	ENSG00000072315	ENSMUSG00000041710
UniProt	Q9UL62	Q9QX29
RefSeq (мРНК)	NM_012471	NM_009428
RefSeq (білок)	NP_036603	NP_033454
Локус (UCSC)	Хр. X: 111.77 – 112.08 Mb	Хр. X: 143.16 – 143.47 Mb
PubMed search	[2]	[3]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

TRPC5 (англ. Transient receptor potential cation channel subfamily C member 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на X-хромосомі.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 973 амінокислот, а молекулярна маса — 111 412^[5].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAQLYYKKVN		YSPYRDRIPL		QIVRAETELS		AEEKAFLNAV		EKGDYATVKQ
ALQEAEIYYN		VNINCMDPLG		RSALLIAIEN		ENLEIMELLL		NHSVYVGDAL
LYAIRKEVVG		AVELLLSYRR		PSGEKQVPTL		MMDTQFSEFT		PDITPIMLAA
HTNNYEIIKL		LVQKRVTIPR		PHQIRCNCVE		CVSSSEVDSL		RHSRSRLNIY
KALASPSLIA		LSSEDPILTA		FRLGWELKEL		SKVENEFKAE		YEELSQQCKL
FAKDLLDQAR		SSRELEIILN		HRDDHSEELD		PQKYHDLAKL		KVAIKYHQKE
FVAQPNCQQL		LATLWYDGFP		GWRRKHWVVK		LLTCMTIGFL		FPMLSIAYLI
SPRSNLGLFI		KKPFIKFICH		TASYLTFLFM		LLLASQHIVR		TDLHVQGPPP
TVVEWMILPW		VLGFIWGEIK		EMWDGGFTEY		IHDWWNLMDF		AMNSLYLATI
SLKIVAYVKY		NGSRPREEWE		MWHPTLIAEA		LFAISNILSS		LRLISLFTAN
SHLGPLQISL		GRMLLDILKF		LFIYCLVLLA		FANGLNQLYF		YYETRAIDEP
NNCKGIRCEK		QNNAFSTLFE		TLQSLFWSVF		GLLNLYVTNV		KARHEFTEFV
GATMFGTYNV		ISLVVLLNML		IAMMNNSYQL		IADHADIEWK		FARTKLWMSY
FDEGGTLPPP		FNIIPSPKSF		LYLGNWFNNT		FCPKRDPDGR		RRRRNLRSFT
ERNADSLIQN		QHYQEVIRNL		VKRYVAAMIR		NSKTHEGLTE		ENFKELKQDI
SSFRYEVLDL		LGNRKHPRSF		STSSTELSQR		DDNNDGSGGA		RAKSKSVSFN
LGCKKKTCHG		PPLIRTMPRS		SGAQGKSKAE		SSSKRSFMGP		SLKKLGLLFS
KFNGHMSEPS		SEPMYTISDG		IVQQHCMWQD		IRYSQMEKGK		AEACSQSEIN
LSEVELGEVQ		GAAQSSECPL		ACSSSLHCAS		SICSSNSKLL		DSSEDVFETW
GEACDLLMHK		WGDGQEEQVT		TRL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до іонних каналів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт іонів, транспорт, транспорт кальцію. Білок має сайт для зв'язування з іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Hofmann T., Schaefer M., Schultz G., Gudermann T. (2002). Subunit composition of mammalian transient receptor potential channels in living cells. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 99: 7461—7466. PMID 12032305 DOI:10.1073/pnas.102596199
• Lussier M.P., Lepage P.K., Bousquet S.M., Boulay G. (2008). RNF24, a new TRPC interacting protein, causes the intracellular retention of TRPC. Cell Calcium. 43: 432—443. PMID 17850865 DOI:10.1016/j.ceca.2007.07.009

Примітки

1. Сполуки, які фізично взаємодіють з Transient receptor potential cation channel subfamily C member 5 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
2. Human PubMed Reference:.
3. Mouse PubMed Reference:.
4. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:12337 (англ.) . Архів оригіналу за 18 квітня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
5. UniProt, Q9UL62 (англ.) . Архів оригіналу за 23 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

• Хромосома X

Портал «Біологія»   Портал «Хімія»