TRPM6

TRPM6
Ідентифікатори
Символи	TRPM6, CHAK2, HMGX, HOMG, HOMG1, HSH, transient receptor potential cation channel subfamily M member 6
Зовнішні ІД	OMIM: 607009 MGI: 2675603 HomoloGene: 9767 GeneCards: TRPM6
Пов'язані генетичні захворювання
intestinal hypomagnesemia 1[1]
Реагує на сполуку
2-aminoethoxydiphenylborate, гідрон[2]
Онтологія гена Молекулярна функція • transferase activity • nucleotide binding • зв'язування з іоном металу • kinase activity • protein serine/threonine kinase activity • ion channel activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • cation channel activity • ATP binding • calcium channel activity Клітинна компонента • integral component of membrane • мембрана • клітинна мембрана • brush border membrane • apical plasma membrane Біологічний процес • фосфорилювання • GO:0070839 metal ion transport • cation transport • ion transport • protein tetramerization • protein phosphorylation • calcium ion transmembrane transport • response to toxic substance • calcium ion transport • трансмембранний транспорт Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	140803	225997
Ensembl	ENSG00000119121	ENSMUSG00000024727
UniProt	Q9BX84	Q8CIR4
RefSeq (мРНК)	NM_001177310 NM_001177311 NM_017662	NM_153417
RefSeq (білок)	NP_001170781 NP_001170782 NP_060132	NP_700466
Локус (UCSC)	Хр. 9: 74.72 – 74.89 Mb	Хр. 19: 18.73 – 18.87 Mb
PubMed search	[3]	[4]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

TRPM6 (англ. Transient receptor potential cation channel subfamily M member 6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми. ^[5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 022 амінокислот, а молекулярна маса — 231 708^[6].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MKEQPVLERL		QSQKSWIKGV		FDKRECSTII		PSSKNPHRCT		PVCQVCQNLI
RCYCGRLIGD		HAGIDYSWTI		SAAKGKESEQ		WSVEKHTTKS		PTDTFGTINF
QDGEHTHHAK		YIRTSYDTKL		DHLLHLMLKE		WKMELPKLVI		SVHGGIQNFT
MPSKFKEIFS		QGLVKAAETT		GAWIITEGIN		TGVSKHVGDA		LKSHSSHSLR
KIWTVGIPPW		GVIENQRDLI		GKDVVCLYQT		LDNPLSKLTT		LNSMHSHFIL
SDDGTVGKYG		NEMKLRRNLE		KYLSLQKIHC		RSRQGVPVVG		LVVEGGPNVI
LSVWETVKDK		DPVVVCEGTG		RAADLLAFTH		KHLADEGMLR		PQVKEEIICM
IQNTFNFSLK		QSKHLFQILM		ECMVHRDCIT		IFDADSEEQQ		DLDLAILTAL
LKGTNLSASE		QLNLAMAWDR		VDIAKKHILI		YEQHWKPDAL		EQAMSDALVM
DRVDFVKLLI		EYGVNLHRFL		TIPRLEELYN		TKQGPTNTLL		HHLVQDVKQH
TLLSGYRITL		IDIGLVVEYL		IGRAYRSNYT		RKHFRALYNN		LYRKYKHQRH
SSGNRNESAE		STLHSQFIRT		AQPYKFKEKS		IVLHKSRKKS		KEQNVSDDPE
STGFLYPYND		LLVWAVLMKR		QKMAMFFWQH		GEEATVKAVI		ACILYRAMAH
EAKESHMVDD		ASEELKNYSK		QFGQLALDLL		EKAFKQNERM		AMTLLTYELR
NWSNSTCLKL		AVSGGLRPFV		SHTCTQMLLT		DMWMGRLKMR		KNSWLKIIIS
IILPPTILTL		EFKSKAEMSH		VPQSQDFQFM		WYYSDQNASS		SKESASVKEY
DLERGHDEKL		DENQHFGLES		GHQHLPWTRK		VYEFYSAPIV		KFWFYTMAYL
AFLMLFTYTV		LVEMQPQPSV		QEWLVSIYIF		TNAIEVVREI		CISEPGKFTQ
KVKVWISEYW		NLTETVAIGL		FSAGFVLRWG		DPPFHTAGRL		IYCIDIIFWF
SRLLDFFAVN		QHAGPYVTMI		AKMTANMFYI		VIIMAIVLLS		FGVARKAILS
PKEPPSWSLA		RDIVFEPYWM		IYGEVYAGEI		DVCSSQPSCP		PGSFLTPFLQ
AVYLFVQYII		MVNLLIAFFN		NVYLDMESIS		NNLWKYNRYR		YIMTYHEKPW
LPPPLILLSH		VGLLLRRLCC		HRAPHDQEEG		DVGLKLYLSK		EDLKKLHDFE
EQCVEKYFHE		KMEDVNCSCE		ERIRVTSERV		TEMYFQLKEM		NEKVSFIKDS
LLSLDSQVGH		LQDLSALTVD		TLKVLSAVDT		LQEDEALLAK		RKHSTCKKLP
HSWSNVICAE		VLGSMEIAGE		KKYQYYSMPS		SLLRSLAGGR		HPPRVQRGAL
LEITNSKREA		TNVRNDQERQ		ETQSSIVVSG		VSPNRQAHSK		YGQFLLVPSN
LKRVPFSAET		VLPLSRPSVP		DVLATEQDIQ		TEVLVHLTGQ		TPVVSDWASV
DEPKEKHEPI		AHLLDGQDKA		EQVLPTLSCT		PEPMTMSSPL		SQAKIMQTGG
GYVNWAFSEG		DETGVFSIKK		KWQTCLPSTC		DSDSSRSEQH		QKQAQDSSLS
DNSTRSAQSS		ECSEVGPWLQ		PNTSFWINPL		RRYRPFARSH		SFRFHKEEKL
MKICKIKNLS		GSSEIGQGAW		VKAKMLTKDR		RLSKKKKNTQ		GLQVPIITVN
ACSQSDQLNP		EPGENSISEE		EYSKNWFTVS		KFSHTGVEPY		IHQKMKTKEI
GQCAIQISDY		LKQSQEDLSK		NSLWNSRSTN		LNRNSLLKSS		IGVDKISASL
KSPQEPHHHY		SAIERNNLMR		LSQTIPFTPV		QLFAGEEITV		YRLEESSPLN
LDKSMSSWSQ		RGRAAMIQVL		SREEMDGGLR		KAMRVVSTWS		EDDILKPGQV
FIVKSFLPEV		VRTWHKIFQE		STVLHLCLRE		IQQQRAAQKL		IYTFNQVKPQ
TIPYTPRFLE		VFLIYCHSAN		QWLTIEKYMT		GEFRKYNNNN		GDEITPTNTL
EELMLAFSHW		TYEYTRGELL		VLDLQGVGEN		LTDPSVIKPE		VKQSRGMVFG
PANLGEDAIR		NFIAKHHCNS		CCRKLKLPDL		KRNDYSPERI		NSTFGLEIKI
ESAEEPPARE		TGRNSPEDDM		QL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, кіназ, серин/треонінових протеїнкіназ, іонних каналів. Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт іонів, транспорт, транспорт кальцію. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, іонами металів, іоном цинку, іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

• Riazanova L.V., Pavur K.S., Petrov A.N., Dorovkov M.V., Riazanov A.G. (2001). Novel type of signaling molecules: protein kinases covalently linked to ion channels. Mol. Biol. (Mosk.). 35: 321—332. PMID 11357414

Примітки

1. Захворювання, генетично пов'язані з TRPM6 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
2. Сполуки, які фізично взаємодіють з Transient receptor potential cation channel subfamily M member 6 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
3. Human PubMed Reference:.
4. Mouse PubMed Reference:.
5. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:17995 (англ.) . Архів оригіналу за 28 травня 2017. Процитовано 22 серпня 2017.
6. UniProt, Q9BX84 (англ.) . Архів оригіналу за 22 липня 2017. Процитовано 22 серпня 2017.

Див. також

• Хромосома 9

Портал «Біологія»   Портал «Хімія»