UBE2D1

UBE2D1
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2C4P, 2YHO, 3OJ4, 3PTF, 4AP4, 4QPL, 5FER
Ідентифікатори
Символи	UBE2D1, E2(17)KB1, SFT, UBC4/5, UBCH5, UBCH5A, ubiquitin conjugating enzyme E2 D1
Зовнішні ІД	OMIM: 602961 MGI: 2384911 HomoloGene: 20714 GeneCards: UBE2D1
шифр КФ	2.3.2.24
Онтологія гена
Молекулярна функція	• nucleotide binding; • ubiquitin conjugating enzyme activity; • ATP binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • GO:0050372 ubiquitin-protein transferase activity; • ubiquitin protein ligase binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • нуклеоплазма; • гіалоплазма; • ubiquitin ligase complex; • GO:0009327 protein-containing complex;
Біологічний процес	• protein K48-linked ubiquitination; • BMP signaling pathway; • protein polyubiquitination; • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II; • anaphase-promoting complex-dependent catabolic process; • positive regulation of protein ubiquitination; • ubiquitin-dependent protein catabolic process; • Убіквітин-залежний протеоліз; • protein deubiquitination; • positive regulation of protein polyubiquitination; • protein targeting to peroxisome; • regulation of mitotic cell cycle phase transition; • MyD88-independent toll-like receptor signaling pathway; • TRIF-dependent toll-like receptor signaling pathway;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	7321
	216080
	ENSG00000072401
	ENSMUSG00000019927
	P51668
	P61080
	NM_003338; NM_001204880
	NM_145420
	NP_001191809; NP_003329
	NP_663395
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

UBE2D1 (англ. Ubiquitin conjugating enzyme E2 D1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 10-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 147 амінокислот, а молекулярна маса — 16 602^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MALKRIQKEL	SDLQRDPPAH	CSAGPVGDDL	FHWQATIMGP	PDSAYQGGVF
FLTVHFPTDY	PFKPPKIAFT	TKIYHPNINS	NGSICLDILR	SQWSPALTVS
KVLLSICSLL	CDPNPDDPLV	PDIAQIYKSD	KEKYNRHARE	WTQKYAM

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до трансфераз. Задіяний у такому біологічному процесі, як убіквітинування білків. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у цитоплазмі.

Література

Scheffner M., Huibregtse J.M., Howley P.M. (1994). Identification of a human ubiquitin-conjugating enzyme that mediates the E6-AP-dependent ubiquitination of p53. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 91: 8797—8801. PMID 8090726 doi:10.1073/pnas.91.19.8797
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Gutierrez J.A., Yu J., Rivera S., Wessling-Resnick M. (1997). Functional expression cloning and characterization of SFT, a stimulator of Fe transport. J. Cell Biol. 139: 895—905. PMID 9362508 doi:10.1083/jcb.139.4.895
Matsuzawa S., Reed J.C. (2001). Siah-1, SIP, and Ebi collaborate in a novel pathway for beta-catenin degradation linked to p53 responses. Mol. Cell. 7: 915—926. PMID 11389839 doi:10.1016/S1097-2765(01)00242-8
Windheim M., Peggie M., Cohen P. (2008). Two different classes of E2 ubiquitin-conjugating enzymes are required for the mono-ubiquitination of proteins and elongation by polyubiquitin chains with a specific topology. Biochem. J. 409: 723—729. PMID 18042044 doi:10.1042/BJ20071338
Zeng W., Xu M., Liu S., Sun L., Chen Z.J. (2009). Key role of Ubc5 and lysine-63 polyubiquitination in viral activation of IRF3. Mol. Cell. 36: 315—325. PMID 19854139 doi:10.1016/j.molcel.2009.09.037

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:12474 (англ.) . Архів оригіналу за 19 липня 2017. Процитовано 8 вересня 2017. [Архівовано 2017-07-19 у Wayback Machine.]
↑ UniProt, P51668 (англ.) . Архів оригіналу за 17 вересня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 10

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:12474 (англ.) . Архів оригіналу за 19 липня 2017. Процитовано 8 вересня 2017. [Архівовано 2017-07-19 у Wayback Machine.]

[UniProt-4] UniProt, P51668 (англ.) . Архів оригіналу за 17 вересня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]