UBE2N

UBE2N
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1J7D, 2C2V, 3HCT, 3HCU, 3VON, 3W31, 4DHI, 4DHJ, 4DHZ, 4IP3, 4NR3, 4NRG, 4NRI, 4ONL, 4ONM, 4ONN, 4ORH, 4TKP, 5AIT, 5AIU, 4WHV
Ідентифікатори
Символи	UBE2N, HEL-S-71, UBC13, UBCHBEN; UBC13, UbcH-ben, UbcH13, ubiquitin conjugating enzyme E2 N, UBCHBEN
Зовнішні ІД	OMIM: 603679 MGI: 1934835 HomoloGene: 128406 GeneCards: UBE2N
Онтологія гена
Молекулярна функція	• transferase activity; • nucleotide binding; • GO:1904264, GO:1904822, GO:0090622, GO:0090302 ubiquitin protein ligase activity; • ubiquitin binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • ATP binding; • ubiquitin protein ligase binding; • RNA binding; • GO:0050372 ubiquitin-protein transferase activity; • ubiquitin conjugating enzyme activity;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • гіалоплазма; • UBC13-UEV1A complex; • ubiquitin ligase complex; • нуклеоплазма; • екзосома; • UBC13-MMS2 complex; • клітинне ядро; • fibrillar center; • GO:0009327 protein-containing complex;
Біологічний процес	• postreplication repair; • protein K63-linked ubiquitination; • regulation of DNA repair; • DNA double-strand break processing; • GO:1900404 positive regulation of DNA repair; • stimulatory C-type lectin receptor signaling pathway; • протеоліз; • cellular response to DNA damage stimulus; • Fc-epsilon receptor signaling pathway; • global genome nucleotide-excision repair; • GO:0033129 positive regulation of histone modification; • positive regulation of ubiquitin-protein transferase activity; • Убіквітин-залежний протеоліз; • regulation of histone ubiquitination; • positive regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling; • T cell receptor signaling pathway; • double-strand break repair via nonhomologous end joining; • nucleotide-binding oligomerization domain containing signaling pathway; • histone ubiquitination; • GO:0100026 Репарація ДНК; • double-strand break repair via homologous recombination; • JNK cascade; • positive regulation of NF-kappaB transcription factor activity; • ubiquitin-dependent protein catabolic process; • interleukin-1-mediated signaling pathway;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ; ; ;
	Більше даних
Ортологи
	7334
	93765
	ENSG00000177889
	ENSMUSG00000074781
	P61088
	P61089
	NM_003348
	NM_080560
	NP_003339
	NP_542127
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

UBE2N (англ. Ubiquitin conjugating enzyme E2 N) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 152 амінокислот, а молекулярна маса — 17 138^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAGLPRRIIK	ETQRLLAEPV	PGIKAEPDES	NARYFHVVIA	GPQDSPFEGG
TFKLELFLPE	EYPMAAPKVR	FMTKIYHPNV	DKLGRICLDI	LKDKWSPALQ
IRTVLLSIQA	LLSAPNPDDP	LANDVAEQWK	TNEAQAIETA	RAWTRLYAMN
NI

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до трансфераз. Задіяний у таких біологічних процесах, як пошкодження ДНК, репарація ДНК, убіквітинування білків, ацетилювання. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Hofmann R.M., Pickart C.M. (1999). Noncanonical MMS2-encoded ubiquitin-conjugating enzyme functions in assembly of novel polyubiquitin chains for DNA repair. Cell. 96: 645—653. PMID 10089880 doi:10.1016/S0092-8674(00)80575-9
Bothos J., Summers M.K., Venere M., Scolnick D.M., Halazonetis T.D. (2003). The Chfr mitotic checkpoint protein functions with Ubc13-Mms2 to form Lys63-linked polyubiquitin chains. Oncogene. 22: 7101—7107. PMID 14562038 doi:10.1038/sj.onc.1206831
Takeuchi T., Yokosawa H. (2005). ISG15 modification of Ubc13 suppresses its ubiquitin-conjugating activity. Biochem. Biophys. Res. Commun. 336: 9—13. PMID 16112642 doi:10.1016/j.bbrc.2005.08.034
Scheper J., Oliva B., Villa-Freixa J., Thomson T.M. (2009). Analysis of electrostatic contributions to the selectivity of interactions between RING-finger domains and ubiquitin-conjugating enzymes. Proteins. 74: 92—103. PMID 18615712 doi:10.1002/prot.22120
David Y., Ziv T., Admon A., Navon A. (2010). The E2 ubiquitin-conjugating enzymes direct polyubiquitination to preferred lysines. J. Biol. Chem. 285: 8595—8604. PMID 20061386 doi:10.1074/jbc.M109.089003

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:12492 (англ.) . Архів оригіналу за 10 вересня 2015. Процитовано 11 вересня 2017. [Архівовано 2015-09-10 у Wayback Machine.]
↑ UniProt, P61088 (англ.) . Архів оригіналу за 8 вересня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 12

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:12492 (англ.) . Архів оригіналу за 10 вересня 2015. Процитовано 11 вересня 2017. [Архівовано 2015-09-10 у Wayback Machine.]

[UniProt-4] UniProt, P61088 (англ.) . Архів оригіналу за 8 вересня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]