UPF3B

UPF3B
Наявні структури
PDBПошук для людей: PDBe RCSB
Ідентифікатори
Символи UPF3B, HMRX62, MRXS14, RENT3B, UPF3X, Upf3p-X, UPF3BP1, UPF3BP2, UPF3BP3, UPF3 regulator of nonsense transcripts homolog B (yeast), UPF3 regulator of nonsense transcripts homolog B, regulator of nonsense mediated mRNA decay, UPF3B regulator of nonsense mediated mRNA decay, MRX82
Зовнішні ІД OMIM: 300298 MGI: 1915384 HomoloGene: 11307 GeneCards: UPF3B
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
NM_023010
NM_080632
NM_026573
RefSeq (білок)
NP_075386
NP_542199
н/д
Локус (UCSC) Хр. X: 119.81 – 119.85 Mb Хр. X: 37.09 – 37.11 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

UPF3B (англ. UPF3B, regulator of nonsense mediated mRNA decay) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на X-хромосомі.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 483 амінокислот, а молекулярна маса — 57 762[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MKEEKEHRPKEKRVTLLTPAGATGSGGGTSGDSSKGEDKQDRNKEKKEAL
SKVVIRRLPPTLTKEQLQEHLQPMPEHDYFEFFSNDTSLYPHMYARAYIN
FKNQEDIILFRDRFDGYVFLDNKGQEYPAIVEFAPFQKAAKKKTKKRDTK
VGTIDDDPEYRKFLESYATDNEKMTSTPETLLEEIEAKNRELIAKKTTPL
LSFLKNKQRMREEKREERRRREIERKRQREEERRKWKEEEKRKRKDIEKL
KKIDRIPERDKLKDEPKIKVHRFLLQAVNQKNLLKKPEKGDEKELDKREK
AKKLDKENLSDERASGQSCTLPKRSDSELKDEKPKRPEDESGRDYRERER
EYERDQERILRERERLKRQEEERRRQKERYEKEKTFKRKEEEMKKEKDTL
RDKGKKAESTESIGSSEKTEKKEEVVKRDRIRNKDRPAMQLYQPGARSRN
RLCPPDDSTKSGDSAAERKQESGISHRKEGGEE

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт мРНК, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

[ред. | ред. код]
  • Lykke-Andersen J., Shu M.-D., Steitz J.A. (2000). Human Upf proteins target an mRNA for nonsense-mediated decay when bound downstream of a termination codon. Cell. 103: 1121—1131. PMID 11163187 DOI:10.1016/S0092-8674(00)00214-2
  • Serin G., Gersappe A., Black J.D., Aronoff R., Maquat L.E. (2001). Identification and characterization of human orthologues to Saccharomyces cerevisiae Upf2 protein and Upf3 protein (Caenorhabditis elegans SMG-4). Mol. Cell. Biol. 21: 209—223. PMID 11113196 DOI:10.1128/MCB.21.1.209-223.2001
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Kim V.N., Kataoka N., Dreyfuss G. (2001). Role of the nonsense-mediated decay factor hUpf3 in the splicing-dependent exon-exon junction complex. Science. 293: 1832—1836. PMID 11546873 DOI:10.1126/science.1062829
  • Lykke-Andersen J., Shu M.-D., Steitz J.A. (2001). Communication of the position of exon-exon junctions to the mRNA surveillance machinery by the protein RNPS1. Science. 293: 1836—1839. PMID 11546874 DOI:10.1126/science.1062786
  • Gehring N.H., Neu-Yilik G., Schell T., Hentze M.W., Kulozik A.E. (2003). Y14 and hUpf3b form an NMD-activating complex. Mol. Cell. 11: 939—949. PMID 12718880 DOI:10.1016/S1097-2765(03)00142-4

Примітки

[ред. | ред. код]
  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:20439 (англ.) . Процитовано 13 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
  4. UniProt, Q9BZI7 (англ.) . Архів оригіналу за 9 серпня 2017. Процитовано 13 вересня 2017.

Див. також

[ред. | ред. код]