XCL2

XCL2
Ідентифікатори
Символи	XCL2, SCM-1b, SCM1B, SCYC2, chemokine (C motif) ligand 2, X-C motif chemokine ligand 2
Зовнішні ІД	OMIM: 604828 MGI: 104593 HomoloGene: 130513 GeneCards: XCL2
Онтологія гена Молекулярна функція • cytokine activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • CCR chemokine receptor binding • chemokine activity Клітинна компонента • extracellular region • міжклітинний простір Біологічний процес • monocyte chemotaxis • chemokine-mediated signaling pathway • cellular response to tumor necrosis factor • кровообіг • neutrophil chemotaxis • хемотаксис • GO:0032320, GO:0032321, GO:0032855, GO:0043089, GO:0032854 positive regulation of GTPase activity • cellular response to interleukin-1 • GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь • positive regulation of ERK1 and ERK2 cascade • cellular response to interferon-gamma • lymphocyte chemotaxis • inflammatory response • GO:0072468 сигнальна трансдукція • regulation of signaling receptor activity • G protein-coupled receptor signaling pathway • positive regulation of T cell chemotaxis Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	6846	16963
Ensembl	ENSG00000143185	ENSMUSG00000026573
UniProt	Q9UBD3	P47993
RefSeq (мРНК)	NM_003175	NM_008510
RefSeq (білок)	NP_003166	NP_032536
Локус (UCSC)	Хр. 1: 168.54 – 168.54 Mb	Хр. 1: 164.76 – 164.76 Mb
PubMed search	[1]	[2]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

XCL2 (англ. X-C motif chemokine ligand 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 114 амінокислот, а молекулярна маса — 12 567^[4].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MRLLILALLG		ICSLTAYIVE		GVGSEVSHRR		TCVSLTTQRL		PVSRIKTYTI
TEGSLRAVIF		ITKRGLKVCA		DPQATWVRDV		VRSMDRKSNT		RNNMIQTKPT
GTQQSTNTAV		TLTG

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до цитокінів. Задіяний у такому біологічному процесі як хемотаксис. Секретований назовні.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Zhang Z., Henzel W.J. (2004). Signal peptide prediction based on analysis of experimentally verified cleavage sites. Protein Sci. 13: 2819—2824. PMID 15340161 DOI:10.1110/ps.04682504

Примітки

1. Human PubMed Reference:.
2. Mouse PubMed Reference:.
3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10646 (англ.) . Процитовано 25 серпня 2017.
4. UniProt, Q9UBD3 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 25 серпня 2017.

Див. також

• Хромосома 1

Портал «Біологія»   Портал «Хімія»