YTHDC1

YTHDC1
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2YUD, 4R3H, 4R3I
Ідентифікатори
Символи	YTHDC1, YT521, YT521-B, YTH domain containing 1
Зовнішні ІД	OMIM: 617283 MGI: 2443713 HomoloGene: 15796 GeneCards: YTHDC1
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • RNA binding; • N6-methyladenosine-containing RNA binding;
Клітинна компонента	• клітинне ядро; • nuclear speck; • клітинна мембрана; • нуклеоплазма;
Біологічний процес	• mRNA processing; • mRNA splice site selection; • Сплайсинг РНК; • regulation of mRNA splicing, via spliceosome; • mRNA export from nucleus; • dosage compensation by inactivation of X chromosome; • posttranscriptional regulation of gene expression;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	91746
	231386
	ENSG00000275272; ENSG00000083896
	ENSMUSG00000035851
	Q96MU7
	E9Q5K9
	NM_001031732; NM_133370; NM_001330698
	NM_177680; NM_001347375; NM_001347376; NM_001359907; NM_001359908
	NP_001026902; NP_001317627; NP_588611
	NP_001334304; NP_001334305; NP_808348; NP_001346836; NP_001346837
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

YTHDC1 (англ. YTH domain containing 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 727 амінокислот, а молекулярна маса — 84 700^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAADSREEKD	GELNVLDDIL	TEVPEQDDEL	YNPESEQDKN	EKKGSKRKSD
RMESTDTKRQ	KPSVHSRQLV	SKPLSSSVSN	NKRIVSTKGK	SATEYKNEEY
QRSERNKRLD	ADRKIRLSSS	ASREPYKNQP	EKTCVRKRDP	ERRAKSPTPD
GSERIGLEVD	RRASRSSQSS	KEEVNSEEYG	SDHETGSSGS	SDEQGNNTEN
EEEGVEEDVE	EDEEVEEDAE	EDEEVDEDGE	EEEEEEEEEE	EEEEEEEEEY
EQDERDQKEE	GNDYDTRSEA	SDSGSESVSF	TDGSVRSGSG	TDGSDEKKKE
RKRARGISPI	VFDRSGSSAS	ESYAGSEKKH	EKLSSSVRAV	RKDQTSKLKY
VLQDARFFLI	KSNNHENVSL	AKAKGVWSTL	PVNEKKLNLA	FRSARSVILI
FSVRESGKFQ	GFARLSSESH	HGGSPIHWVL	PAGMSAKMLG	GVFKIDWICR
RELPFTKSAH	LTNPWNEHKP	VKIGRDGQEI	ELECGTQLCL	LFPPDESIDL
YQVIHKMRHK	RRMHSQPRSR	GRPSRREPVR	DVGRRRPEDY	DIHNSRKKPR
IDYPPEFHQR	PGYLKDPRYQ	EVDRRFSGVR	RDVFLNGSYN	DYVREFHNMG
PPPPWQGMPP	YPGMEQPPHH	PYYQHHAPPP	QAHPPYSGHH	PVPHEARYRD
KRVHDYDMRV	DDFLRRTQAV	VSGRRSRPRE	RDRERERDRP	RDNRRDRERD
RGRDRERERE	RLCDRDRDRG	ERGRYRR

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як процесінг мРНК, сплайсінг мРНК, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 10.1101/gr.2596504
Nagase T., Kikuno R., Ohara O. (2001). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XXII. The complete sequences of 50 new cDNA clones which code for large proteins. DNA Res. 8: 319—327. PMID 11853319 10.1093/dnares/8.6.319

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:30626 (англ.) . Процитовано 30 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q96MU7 (англ.) . Архів оригіналу за 7 листопада 2016. Процитовано 30 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 4

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:30626 (англ.) . Процитовано 30 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-4] UniProt, Q96MU7 (англ.) . Архів оригіналу за 7 листопада 2016. Процитовано 30 серпня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]