ZC3H13

ZC3H13
Ідентифікатори
Символи	ZC3H13, KIAA0853, zinc finger CCCH-type containing 13, Xio
Зовнішні ІД	OMIM: 616453 MGI: 1914552 GeneCards: ZC3H13
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • RNA binding Клітинна компонента • nuclear speck • клітинне ядро • нуклеоплазма • RNA N6-methyladenosine methyltransferase complex Біологічний процес • mRNA processing • multicellular organism development • Сплайсинг РНК • mRNA methylation • regulation of stem cell population maintenance Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	23091	67302
Ensembl	ENSG00000123200	ENSMUSG00000022000
UniProt	Q5T200	E9Q784
RefSeq (мРНК)	NM_015070 NM_001076788 NM_001330564 NM_001330565 NM_001330566 NM_001330567 NM_001382206 NM_001382207 NM_001382208 NM_001382209 NM_001382210 NM_001382211 NM_001382212 NM_001382213 NM_001382214	NM_026083 NM_027377 NM_001359875
RefSeq (білок)	NP_001070256 NP_001317493 NP_001317494 NP_001317495 NP_001317496 NP_055885 NP_001369135 NP_001369136 NP_001369137 NP_001369138 NP_001369139 NP_001369140 NP_001369141 NP_001369142 NP_001369143	NP_080359 NP_001346804
Локус (UCSC)	Хр. 13: 45.95 – 46.05 Mb	Хр. 14: 75.52 – 75.58 Mb
PubMed search	[1]	[2]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

ZC3H13 (англ. Zinc finger CCCH-type containing 13) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 13-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 668 амінокислот, а молекулярна маса — 196 635^[4].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSKIRRKVTV		ENTKTISDST		SRRPSVFERL		GPSTGSTAET		QCRNWLKTGN
CLYGNTCRFV		HGPSPRGKGY		SSNYRRSPER		PTGDLRERMK		NKRQDVDTEP
QKRNTEESSS		PVRKESSRGR		HREKEDIKIT		KERTPESEEE		NVEWETNRDD
SDNGDINYDY		VHELSLEMKR		QKIQRELMKL		EQENMEKREE		IIIKKEVSPE
VVRSKLSPSP		SLRKSSKSPK		RKSSPKSSSA		SKKDRKTSAV		SSPLLDQQRN
SKTNQSKKKG		PRTPSPPPPI		PEDIALGKKY		KEKYKVKDRI		EEKTRDGKDR
GRDFERQREK		RDKPRSTSPA		GQHHSPISSR		HHSSSSQSGS		SIQRHSPSPR
RKRTPSPSYQ		RTLTPPLRRS		ASPYPSHSLS		SPQRKQSPPR		HRSPMREKGR
HDHERTSQSH		DRRHERREDT		RGKRDREKDS		REEREYEQDQ		SSSRDHRDDR
EPRDGRDRRD		ARDTRDRREL		RDSRDMRDSR		EMRDYSRDTK		ESRDPRDSRS
TRDAHDYRDR		EGRDTHRKED		TYPEESRSYG		RNHLREESSR		TEIRNESRNE
SRSEIRNDRM		GRSRGRVPEL		PEKGSRGSRG		SQIDSHSSNS		NYHDSWETRS
SYPERDRYPE		RDNRDQARDS		SFERRHGERD		RRDNRERDQR		PSSPIRHQGR
NDELERDERR		EERRVDRVDD		RRDERARERD		RERERDRERE		RERERERDRE
REKERELERE		RARERERERE		KERDRERDRD		RDHDRERERE		RERDREKERE
REREERERER		ERERERERER		ERERERARER		DKERERQRDW		EDKDKGRDDR
REKREEIRED		RNPRDGHDER		KSKKRYRNEG		SPSPRQSPKR		RREHSPDSDA
YNSGDDKNEK		HRLLSQVVRP		QESRSLSPSH		LTEDRQGRWK		EEDRKPERKE
SSRRYEEQEL		KEKVSSVDKQ		REQTEILESS		RMRAQDIIGH		HQSEDRETSD
RAHDENKKKA		KIQKKPIKKK		KEDDVGIERG		NIETTSEDGQ		VFSPKKGQKK
KSIEKKRKKS		KGDSDISDEE		AAQQSKKKRG		PRTPPITTKE		ELVEMCNGKN
GILEDSQKKE		DTAFSDWSDE		DVPDRTEVTE		AEHTATATTP		GSTPSPLSSL
LPPPPPVATA		TATTVPATLA		ATTAAAATSF		STSAITISTS		ATPTNTTNNT
FANEDSHRKC		HRTRVEKVET		PHVTIEDAQH		RKPMDQKRSS		SLGSNRSNRS
HTSGRLRSPS		NDSAHRSGDD		QSGRKRVLHS		GSRDREKTKS		LEITGERKSR
IDQLKRGEPS		RSTSSDRQDS		RSHSSRRSSP		ESDRQVHSRS		GSFDSRDRLQ
ERDRYEHDRE		RERERRDTRQ		REWDRDADKD		WPRNRDRDRL		RERERERERD
KRRDLDRERE		RLISDSVERD		RDRDRDRTFE		SSQIESVKRC		EAKLEGEHER
DLESTSRDSL		ALDKERMDKD		LGSVQGFEET		NKSERTESLE		GDDESKLDDA
HSLGSGAGEG		YEPISDDELD		EILAGDAEKR		EDQQDEEKMP		DPLDVIDVDW
SGLMPKHPKE		PREPGAALLK		FTPGAVMLRV		GISKKLAGSE		LFAKVKETCQ
RLLEKPKDAD		NLFEHELGAL		NMAALLRKEE		RASLLSNLGP		CCKALCFRRD
SAIRKQLVKN		EKGTIKQAYT		SAPMVDNELL		RLSLRLFKRK		TTCHAPGHEK
TEDNKLSQSS		IQQELCVS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у ядрі.

Література

• Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 doi:10.1038/nbt1240
• Hendriks I.A., Treffers L.W., Verlaan-de Vries M., Olsen J.V., Vertegaal A.C. (2015). SUMO-2 orchestrates chromatin modifiers in response to DNA damage. Cell Rep. 10: 1778—1791. PMID 25772364 doi:10.1016/j.celrep.2015.02.033

Примітки

1. Human PubMed Reference:.
2. Mouse PubMed Reference:.
3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:20368 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.
4. UniProt, Q5T200 (англ.) . Архів оригіналу за 1 лютого 2018. Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

• Хромосома 13

Портал «Біологія»   Портал «Хімія»