ZFR

ZFR
Ідентифікатори
Символи	ZFR, SPG71, ZFR1, zinc finger RNA binding protein
Зовнішні ІД	OMIM: 615635 MGI: 1341890 HomoloGene: 8009 GeneCards: ZFR
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • nucleic acid binding • zinc ion binding • RNA binding • double-stranded RNA binding • single-stranded RNA binding Клітинна компонента • хромосома • цитоплазма • клітинне ядро Біологічний процес • multicellular organism development Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	51663	22763
Ensembl	ENSG00000056097	ENSMUSG00000022201
UniProt	Q96KR1	O88532
RefSeq (мРНК)	NM_016107	NM_011767 NM_001358823
RefSeq (білок)	NP_057191	NP_035897 NP_001345752
Локус (UCSC)	Хр. 5: 32.35 – 32.44 Mb	Хр. 15: 12.12 – 12.19 Mb
PubMed search	[1]	[2]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

ZFR (англ. Zinc finger RNA binding protein) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 074 амінокислот, а молекулярна маса — 117 012^[4].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MIPICPVVSF		TYVPSRLGED		AKMATGNYFG		FTHSGAAAAA		AAAQYSQQPA
SGVAYSHPTT		VASYTVHQAP		VAAHTVTAAY		APAAATVAVA		RPAPVAVAAA
ATAAAYGGYP		TAHTATDYGY		TQRQQEAPPP		PPPATTQNYQ		DSYSYVRSTA
PAVAYDSKQY		YQQPTATAAA		VAAAAQPQPS		VAETYYQTAP		KAGYSQGATQ
YTQAQQTRQV		TAIKPATPSP		ATTTFSIYPV		SSTVQPVAAA		ATVVPSYTQS
ATYSTTAVTY		SGTSYSGYEA		AVYSAASSYY		QQQQQQQKQA		AAAAAAAAAT
AAWTGTTFTK		KAPFQNKQLK		PKQPPKPPQI		HYCDVCKISC		AGPQTYKEHL
EGQKHKKKEA		ALKASQNTSS		SNSSTRGTQN		QLRCELCDVS		CTGADAYAAH
IRGAKHQKVV		KLHTKLGKPI		PSTEPNVVSQ		ATSSTAVSAS		KPTASPSSIA
ANNCTVNTSS		VATSSMKGLT		TTGNSSLNST		SNTKVSAVPT		NMAAKKTSTP
KINFVGGNKL		QSTGNKAEDI		KGTECVKSTP		VTSAVQIPEV		KQDTVSEPVT
PASLAALQSD		VQPVGHDYVE		EVRNDEGKVI		RFHCKLCECS		FNDPNAKEMH
LKGRRHRLQY		KKKVNPDLQV		EVKPSIRARK		IQEEKMRKQM		QKEEYWRRRE
EEERWRMEMR		RYEEDMYWRR		MEEEQHHWDD		RRRMPDGGYP		HGPPGPLGLL
GVRPGMPPQP		QGPAPLRRPD		SSDDRYVMTK		HATIYPTEEE		LQAVQKIVSI
TERALKLVSD		SLSEHEKNKN		KEGDDKKEGG		KDRALKGVLR		VGVLAKGLLL
RGDRNVNLVL		LCSEKPSKTL		LSRIAENLPK		QLAVISPEKY		DIKCAVSEAA
IILNSCVEPK		MQVTITLTSP		IIREENMREG		DVTSGMVKDP		PDVLDRQKCL
DALAALRHAK		WFQARANGLQ		SCVIIIRILR		DLCQRVPTWS		DFPSWAMELL
VEKAISSASS		PQSPGDALRR		VFECISSGII		LKGSPGLLDP		CEKDPFDTLA
TMTDQQREDI		TSSAQFALRL		LAFRQIHKVL		GMDPLPQMSQ		RFNIHNNRKR
RRDSDGVDGF		EAEGKKDKKD		YDNF

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до білків розвитку, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як ацетилювання, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з ДНК, РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, хромосомах.

Література

• Kleines M., Gaertner A., Ritter K., Schaade L. (2001). Cloning and expression of the human single copy homologue of the mouse zinc finger protein zfr. Gene. 275: 157—162. PMID 11574164 doi:10.1016/S0378-1119(01)00620-5
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504

Примітки

1. Human PubMed Reference:.
2. Mouse PubMed Reference:.
3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:17277 (англ.) . Процитовано 5 вересня 2017.
4. UniProt, Q96KR1 (англ.) . Архів оригіналу за 30 вересня 2017. Процитовано 5 вересня 2017.

Див. також

• Хромосома 5

Портал «Біологія»   Портал «Хімія»