Бета-субодиниця протеасоми 1

Бета-субодиниця протеасоми 1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4R3O, 4R67, 5A0Q
Ідентифікатори
Символи	PSMB1, HC5, PMSB1, PSC5, proteasome subunit beta 1, proteasome 20S subunit beta 1
Зовнішні ІД	OMIM: 602017 MGI: 104884 HomoloGene: 2087 GeneCards: PSMB1
Реагує на сполуку
Карфілзоміб, ixazomib, Oprozomib[1]
Онтологія гена Молекулярна функція • endopeptidase activity • GO:0070122 peptidase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • threonine-type endopeptidase activity • hydrolase activity Клітинна компонента • цитоплазма • гіалоплазма • нуклеоплазма • Протеасома • екзосома • клітинне ядро • proteasome core complex • extracellular region • secretory granule lumen • ficolin-1-rich granule lumen • proteasome core complex, beta-subunit complex Біологічний процес • regulation of cellular amino acid metabolic process • antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class I, TAP-dependent • regulation of mRNA stability • positive regulation of canonical Wnt signaling pathway • protein polyubiquitination • stimulatory C-type lectin receptor signaling pathway • tumor necrosis factor-mediated signaling pathway • MAPK cascade • протеоліз • Fc-epsilon receptor signaling pathway • NIK/NF-kappaB signaling • anaphase-promoting complex-dependent catabolic process • proteolysis involved in cellular protein catabolic process • T cell receptor signaling pathway • negative regulation of canonical Wnt signaling pathway • proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process • GO:0022415 viral process • Wnt signaling pathway, planar cell polarity pathway • negative regulation of G2/M transition of mitotic cell cycle • protein deubiquitination • SCF-dependent proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process • neutrophil degranulation • трансмембранний транспорт • regulation of transcription from RNA polymerase II promoter in response to hypoxia • посттрансляційна модифікація • regulation of hematopoietic stem cell differentiation • proteasomal protein catabolic process • proteasomal ubiquitin-independent protein catabolic process • interleukin-1-mediated signaling pathway • regulation of mitotic cell cycle phase transition Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	5689	19170
Ensembl	ENSG00000008018 ENSG00000281184	ENSMUSG00000014769
UniProt	P20618	O09061
RefSeq (мРНК)	NM_002793	NM_011185
RefSeq (білок)	NP_002784	NP_035315
Локус (UCSC)	Хр. 6: 170.54 – 170.55 Mb	Хр. 17: 15.7 – 15.72 Mb
PubMed search	[2]	[3]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Бета-субодиниця протеасоми 1 (англ. Proteasome subunit beta 1) – білок, який кодується геном PSMB1, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми. ^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 241 амінокислот, а молекулярна маса — 26 489^[5].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MLSSTAMYSA		PGRDLGMEPH		RAAGPLQLRF		SPYVFNGGTI		LAIAGEDFAI
VASDTRLSEG		FSIHTRDSPK		CYKLTDKTVI		GCSGFHGDCL		TLTKIIEARL
KMYKHSNNKA		MTTGAIAAML		STILYSRRFF		PYYVYNIIGG		LDEEGKGAVY
SFDPVGSYQR		DSFKAGGSAS		AMLQPLLDNQ		VGFKNMQNVE		HVPLSLDRAM
RLVKDVFISA		AERDVYTGDA		LRICIVTKEG		IREETVSLRK		D

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

Y: Тирозин

Цей білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, треонінових протеаз. Задіяний у такому біологічному процесі як взаємодія хазяїн-вірус. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504

Примітки

1. Сполуки, які фізично взаємодіють з Proteasome subunit beta 1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
2. Human PubMed Reference:.
3. Mouse PubMed Reference:.
4. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9537 (англ.) . Архів оригіналу за 14 жовтня 2017. Процитовано 6 лютого 2017. [Архівовано 2017-10-14 у Wayback Machine.]
5. UniProt, P20618 (англ.) . Архів оригіналу за 22 жовтня 2016. Процитовано 6 лютого 2017.

Див. також

• Хромосома 6