Важкий ланцюг клатрину

Важкий ланцюг клатрину
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2XZG, 4G55
Ідентифікатори
Символи	CLTC, CHC, CHC17, CLH-17, CLTCL2, Hc, clathrin heavy chain, MRD56
Зовнішні ІД	OMIM: 118955 MGI: 2388633 HomoloGene: 3572 GeneCards: CLTC
Пов'язані генетичні захворювання
autosomal dominant mental retardation 56[1]
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • double-stranded RNA binding • protein kinase binding • structural molecule activity • RNA binding • clathrin light chain binding • disordered domain specific binding • low-density lipoprotein particle receptor binding • ubiquitin-specific protease binding Клітинна компонента • extracellular vesicle • гіалоплазма • clathrin-coated endocytic vesicle membrane • clathrin coat of coated pit • trans-Golgi network membrane • clathrin coat of trans-Golgi network vesicle • focal adhesion • Меланосома • клітинна мембрана • endolysosome membrane • clathrin-coated pit • екзосома • cytoplasmic vesicle membrane • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • clathrin-coated vesicle • GO:0005578 Позаклітинна матриця • мембрана • mitotic spindle microtubule • цитоплазма • лізосома • ендосома • веретено поділу • цитоскелет • clathrin coat • Клатрин • GO:0009327 protein-containing complex • внутрішньоклітинна мембранна органела • clathrin-coated endocytic vesicle • mitotic spindle • внутрішньоклітинний Біологічний процес • antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class II • transferrin transport • receptor internalization • negative regulation of protein localization to plasma membrane • retrograde transport, endosome to Golgi • osteoblast differentiation • vesicle-mediated transport • negative regulation of hyaluronan biosynthetic process • intracellular protein transport • Wnt signaling pathway, planar cell polarity pathway • regulation of mitotic spindle organization • автофагія • microtubule-based movement • клітинний цикл • поділ клітини • membrane organization • GO:0007067 мітоз • рецептор-опосередкований ендоцитоз • low-density lipoprotein particle receptor catabolic process • low-density lipoprotein particle clearance • clathrin coat assembly • clathrin-dependent endocytosis • amyloid-beta clearance by transcytosis Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	1213	67300
Ensembl	ENSG00000141367	ENSMUSG00000047126
UniProt	Q00610	Q68FD5
RefSeq (мРНК)	NM_001288653 NM_004859	NM_001003908 NM_001356393
RefSeq (білок)	NP_001275582 NP_004850	NP_001003908 NP_001343322
Локус (UCSC)	Хр. 17: 59.62 – 59.7 Mb	Хр. 11: 86.59 – 86.65 Mb
PubMed search	[2]	[3]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Важкий ланцюг клатрину (англ. Clathrin heavy chain) — білок, який кодується геном CLTC, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми. ^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 675 амінокислот, а молекулярна маса — 191 615^[5].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAQILPIRFQ		EHLQLQNLGI		NPANIGFSTL		TMESDKFICI		REKVGEQAQV
VIIDMNDPSN		PIRRPISADS		AIMNPASKVI		ALKAGKTLQI		FNIEMKSKMK
AHTMTDDVTF		WKWISLNTVA		LVTDNAVYHW		SMEGESQPVK		MFDRHSSLAG
CQIINYRTDA		KQKWLLLTGI		SAQQNRVVGA		MQLYSVDRKV		SQPIEGHAAS
FAQFKMEGNA		EESTLFCFAV		RGQAGGKLHI		IEVGTPPTGN		QPFPKKAVDV
FFPPEAQNDF		PVAMQISEKH		DVVFLITKYG		YIHLYDLETG		TCIYMNRISG
ETIFVTAPHE		ATAGIIGVNR		KGQVLSVCVE		EENIIPYITN		VLQNPDLALR
MAVRNNLAGA		EELFARKFNA		LFAQGNYSEA		AKVAANAPKG		ILRTPDTIRR
FQSVPAQPGQ		TSPLLQYFGI		LLDQGQLNKY		ESLELCRPVL		QQGRKQLLEK
WLKEDKLECS		EELGDLVKSV		DPTLALSVYL		RANVPNKVIQ		CFAETGQVQK
IVLYAKKVGY		TPDWIFLLRN		VMRISPDQGQ		QFAQMLVQDE		EPLADITQIV
DVFMEYNLIQ		QCTAFLLDAL		KNNRPSEGPL		QTRLLEMNLM		HAPQVADAIL
GNQMFTHYDR		AHIAQLCEKA		GLLQRALEHF		TDLYDIKRAV		VHTHLLNPEW
LVNYFGSLSV		EDSLECLRAM		LSANIRQNLQ		ICVQVASKYH		EQLSTQSLIE
LFESFKSFEG		LFYFLGSIVN		FSQDPDVHFK		YIQAACKTGQ		IKEVERICRE
SNCYDPERVK		NFLKEAKLTD		QLPLIIVCDR		FDFVHDLVLY		LYRNNLQKYI
EIYVQKVNPS		RLPVVIGGLL		DVDCSEDVIK		NLILVVRGQF		STDELVAEVE
KRNRLKLLLP		WLEARIHEGC		EEPATHNALA		KIYIDSNNNP		ERFLRENPYY
DSRVVGKYCE		KRDPHLACVA		YERGQCDLEL		INVCNENSLF		KSLSRYLVRR
KDPELWGSVL		LESNPYRRPL		IDQVVQTALS		ETQDPEEVSV		TVKAFMTADL
PNELIELLEK		IVLDNSVFSE		HRNLQNLLIL		TAIKADRTRV		MEYINRLDNY
DAPDIANIAI		SNELFEEAFA		IFRKFDVNTS		AVQVLIEHIG		NLDRAYEFAE
RCNEPAVWSQ		LAKAQLQKGM		VKEAIDSYIK		ADDPSSYMEV		VQAANTSGNW
EELVKYLQMA		RKKARESYVE		TELIFALAKT		NRLAELEEFI		NGPNNAHIQQ
VGDRCYDEKM		YDAAKLLYNN		VSNFGRLAST		LVHLGEYQAA		VDGARKANST
RTWKEVCFAC		VDGKEFRLAQ		MCGLHIVVHA		DELEELINYY		QDRGYFEELI
TMLEAALGLE		RAHMGMFTEL		AILYSKFKPQ		KMREHLELFW		SRVNIPKVLR
AAEQAHLWAE		LVFLYDKYEE		YDNAIITMMN		HPTDAWKEGQ		FKDIITKVAN
VELYYRAIQF		YLEFKPLLLN		DLLMVLSPRL		DHTRAVNYFS		KVKQLPLVKP
YLRSVQNHNN		KSVNESLNNL		FITEEDYQAL		RTSIDAYDNF		DNISLAQRLE
KHELIEFRRI		AAYLFKGNNR		WKQSVELCKK		DSLYKDAMQY		ASESKDTELA
EELLQWFLQE		EKRECFGACL		FTCYDLLRPD		VVLETAWRHN		IMDFAMPYFI
QVMKEYLTKV		DKLDASESLR		KEEEQATETQ		PIVYGQPQLM		LTAGPSVAVP
PQAPFGYGYT		APPYGQPQPG		FGYSM

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах як клітинний цикл, поділ клітини, мітоз, автофагія. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, мембрані, клатрин-вкритих заглибинах мембрани, цитоплазматичних везикулах.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
• Royle S.J., Bright N.A., Lagnado L. (2005). Clathrin is required for the function of the mitotic spindle. Nature. 434: 1152—1157. PMID 15858577 doi:10.1038/nature03502
• Royle S.J., Lagnado L. (2006). Trimerisation is important for the function of clathrin at the mitotic spindle. J. Cell Sci. 119: 4071—4078. PMID 16968737 doi:10.1242/jcs.03192
• Jarczowski F., Fischer G., Edlich F. (2008). FKBP36 forms complexes with clathrin and Hsp72 in spermatocytes. Biochemistry. 47: 6946—6952. PMID 18529014 doi:10.1021/bi8001506
• Ravikumar B., Moreau K., Jahreiss L., Puri C., Rubinsztein D.C. (2010). Plasma membrane contributes to the formation of pre-autophagosomal structures. Nat. Cell Biol. 12: 747—757. PMID 20639872 doi:10.1038/ncb2078
• Booth D.G., Hood F.E., Prior I.A., Royle S.J. (2011). A TACC3/ch-TOG/clathrin complex stabilises kinetochore fibres by inter-microtubule bridging. EMBO J. 30: 906—919. PMID 21297582 doi:10.1038/emboj.2011.15

Примітки

1. Захворювання, генетично пов'язані з Важкий ланцюг клатрину переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
2. Human PubMed Reference:.
3. Mouse PubMed Reference:.
4. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2092 (англ.) . Архів оригіналу за 10 вересня 2015. Процитовано 30 січня 2017.
5. UniProt, Q00610 (англ.) . Архів оригіналу за 10 квітня 2017. Процитовано 30 січня 2017.

Див. також

• Хромосома 17

Портал «Біологія»   Портал «Хімія»