Глутаміл-проліл-тРНК-синтаза

Глутаміл-проліл-тРНК-синтаза
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1FYJ, 4HVC, 4K86, 4K87, 4K88, 5A34, 5BMU, 5A1N, 5A5H
Ідентифікатори
Символи	EPRS1, EARS, GLUPRORS, PARS, QARS, QPRS, PIG32, glutamyl-prolyl-tRNA synthetase, HLD15, glutamyl-prolyl-tRNA synthetase 1, EPRS
Зовнішні ІД	OMIM: 138295 MGI: 97838 HomoloGene: 5870 GeneCards: EPRS1
Онтологія гена Молекулярна функція • nucleotide binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA stem-loop binding • ATP binding • каталітична активність • ligase activity • aminoacyl-tRNA ligase activity • GTPase binding • RNA binding • glutamate-tRNA ligase activity • proline-tRNA ligase activity • zinc ion binding • protein homodimerization activity • зв'язування з іоном металу • identical protein binding Клітинна компонента • мембрана • GAIT complex • цитоплазма • aminoacyl-tRNA synthetase multienzyme complex • гіалоплазма • клітинна мембрана • Рибонуклеопротеїни Біологічний процес • regulation of translation • tRNA aminoacylation • обмін речовин • Біосинтез білків • tRNA aminoacylation for protein translation • negative regulation of translation • cellular response to interferon-gamma • glutamyl-tRNA aminoacylation • prolyl-tRNA aminoacylation • cellular response to insulin stimulus • long-chain fatty acid import into cell • GO:0034622 protein-containing complex assembly • regulation of long-chain fatty acid import into cell Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	2058	107508
Ensembl	ENSG00000136628	ENSMUSG00000026615
UniProt	P07814	Q8CGC7
RefSeq (мРНК)	NM_004446	NM_029735 NM_001357474
RefSeq (білок)	NP_004437	NP_084011 NP_001344403
Локус (UCSC)	Хр. 1: 219.97 – 220.05 Mb	Хр. 1: 185.1 – 185.16 Mb
PubMed search	[1]	[2]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Глутаміл-проліл-тРНК-синтаза (англ. Glutamyl-prolyl-tRNA synthetase) – білок, який кодується геном EPRS, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 512 амінокислот, а молекулярна маса — 170 591^[4].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MATLSLTVNS		GDPPLGALLA		VEHVKDDVSI		SVEEGKENIL		HVSENVIFTD
VNSILRYLAR		VATTAGLYGS		NLMEHTEIDH		WLEFSATKLS		SCDSFTSTIN
ELNHCLSLRT		YLVGNSLSLA		DLCVWATLKG		NAAWQEQLKQ		KKAPVHVKRW
FGFLEAQQAF		QSVGTKWDVS		TTKARVAPEK		KQDVGKFVEL		PGAEMGKVTV
RFPPEASGYL		HIGHAKAALL		NQHYQVNFKG		KLIMRFDDTN		PEKEKEDFEK
VILEDVAMLH		IKPDQFTYTS		DHFETIMKYA		EKLIQEGKAY		VDDTPAEQMK
AEREQRIDSK		HRKNPIEKNL		QMWEEMKKGS		QFGQSCCLRA		KIDMSSNNGC
MRDPTLYRCK		IQPHPRTGNK		YNVYPTYDFA		CPIVDSIEGV		THALRTTEYH
DRDEQFYWII		EALGIRKPYI		WEYSRLNLNN		TVLSKRKLTW		FVNEGLVDGW
DDPRFPTVRG		VLRRGMTVEG		LKQFIAAQGS		SRSVVNMEWD		KIWAFNKKVI
DPVAPRYVAL		LKKEVIPVNV		PEAQEEMKEV		AKHPKNPEVG		LKPVWYSPKV
FIEGADAETF		SEGEMVTFIN		WGNLNITKIH		KNADGKIISL		DAKLNLENKD
YKKTTKVTWL		AETTHALPIP		VICVTYEHLI		TKPVLGKDED		FKQYVNKNSK
HEELMLGDPC		LKDLKKGDII		QLQRRGFFIC		DQPYEPVSPY		SCKEAPCVLI
YIPDGHTKEM		PTSGSKEKTK		VEATKNETSA		PFKERPTPSL		NNNCTTSEDS
LVLYNRVAVQ		GDVVRELKAK		KAPKEDVDAA		VKQLLSLKAE		YKEKTGQEYK
PGNPPAEIGQ		NISSNSSASI		LESKSLYDEV		AAQGEVVRKL		KAEKSPKAKI
NEAVECLLSL		KAQYKEKTGK		EYIPGQPPLS		QSSDSSPTRN		SEPAGLETPE
AKVLFDKVAS		QGEVVRKLKT		EKAPKDQVDI		AVQELLQLKA		QYKSLIGVEY
KPVSATGAED		KDKKKKEKEN		KSEKQNKPQK		QNDGQRKDPS		KNQGGGLSSS
GAGEGQGPKK		QTRLGLEAKK		EENLADWYSQ		VITKSEMIEY		HDISGCYILR
PWAYAIWEAI		KDFFDAEIKK		LGVENCYFPM		FVSQSALEKE		KTHVADFAPE
VAWVTRSGKT		ELAEPIAIRP		TSETVMYPAY		AKWVQSHRDL		PIKLNQWCNV
VRWEFKHPQP		FLRTREFLWQ		EGHSAFATME		EAAEEVLQIL		DLYAQVYEEL
LAIPVVKGRK		TEKEKFAGGD		YTTTIEAFIS		ASGRAIQGGT		SHHLGQNFSK
MFEIVFEDPK		IPGEKQFAYQ		NSWGLTTRTI		GVMTMVHGDN		MGLVLPPRVA
CVQVVIIPCG		ITNALSEEDK		EALIAKCNDY		RRRLLSVNIR		VRADLRDNYS
PGWKFNHWEL		KGVPIRLEVG		PRDMKSCQFV		AVRRDTGEKL		TVAENEAETK
LQAILEDIQV		TLFTRASEDL		KTHMVVANTM		EDFQKILDSG		KIVQIPFCGE
IDCEDWIKKT		TARDQDLEPG		APSMGAKSLC		IPFKPLCELQ		PGAKCVCGKN
PAKYYTLFGR		SY

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Цей білок за функціями належить до лігаз, аміноацил-тРНК-синтетаз. Задіяний у таких біологічних процесах як регуляція трансляції, біосинтез білка. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, РНК. Локалізований у цитоплазмі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Thoemmes P., Fett R., Schray B., Kunze N., Knippers R. (1988). The core region of human glutaminyl-tRNA synthetase homologies with the Escherichia coli and yeast enzymes. Nucleic Acids Res. 16: 5391—5406. PMID 3290852 DOI:10.1093/nar/16.12.5391
• Kaiser E., Eberhard D., Knippers R. (1992). Exons encoding the highly conserved part of human glutaminyl-tRNA synthetase. J. Mol. Evol. 34: 45—53. PMID 1556743 DOI:10.1007/BF00163851
• Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
• Arif A., Jia J., Moodt R.A., DiCorleto P.E., Fox P.L. (2011). Phosphorylation of glutamyl-prolyl tRNA synthetase by cyclin-dependent kinase 5 dictates transcript-selective translational control. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 108: 1415—1420. PMID 21220307 DOI:10.1073/pnas.1011275108
• Arif A., Chatterjee P., Moodt R.A., Fox P.L. (2012). Heterotrimeric GAIT complex drives transcript-selective translation inhibition in murine macrophages. Mol. Cell. Biol. 32: 5046—5055. PMID 23071094 DOI:10.1128/MCB.01168-12

Примітки

1. Human PubMed Reference:.
2. Mouse PubMed Reference:.
3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:3418 (англ.) . Процитовано 30 січня 2017.
4. UniProt, P07814 (англ.) . Архів оригіналу за 1 лютого 2017. Процитовано 30 січня 2017.

Див. також

• Хромосома 1

Портал «Біологія»   Портал «Хімія»