Лейцил-тРНК-синтаза

LARS
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2WFD
Ідентифікатори
Символи	LARS1, Leucyl-tRNA synthetase, ILFS1, HSPC192, LARS, leucyl-tRNA synthetase 1, LRS, LEUS, LFIS, PIG44, hr025Cl, LEURS, RNTLS
Зовнішні ІД	OMIM: 151350 MGI: 1913808 HomoloGene: 7083 GeneCards: LARS1
Онтологія гена Молекулярна функція • aminoacyl-tRNA ligase activity • nucleotide binding • leucine-tRNA ligase activity • ligase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • ATP binding • aminoacyl-tRNA editing activity • valine-tRNA ligase activity • GO:0005097, GO:0005099, GO:0005100 GTPase activator activity • glutamine-tRNA ligase activity Клітинна компонента • гіалоплазма • ядерні тільця • цитоплазма • лізосома • ендоплазматичний ретикулум • система ендомембран • aminoacyl-tRNA synthetase multienzyme complex Біологічний процес • tRNA aminoacylation for protein translation • Біосинтез білків • leucyl-tRNA aminoacylation • valyl-tRNA aminoacylation • protein targeting to lysosome • regulation of cell size • negative regulation of autophagy • cellular response to amino acid starvation • GO:0032320, GO:0032321, GO:0032855, GO:0043089, GO:0032854 positive regulation of GTPase activity • cellular response to amino acid stimulus • cellular response to leucine • positive regulation of TORC1 signaling • cellular response to leucine starvation • glutaminyl-tRNA aminoacylation • aminoacyl-tRNA metabolism involved in translational fidelity Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	51520	107045
Ensembl	ENSG00000133706	ENSMUSG00000024493
UniProt	Q9P2J5	Q8BMJ2
RefSeq (мРНК)	NM_020117 NM_001317964 NM_001317965 NM_016460	NM_134137
RefSeq (білок)	NP_001304893 NP_001304894 NP_057544 NP_064502	NP_598898
Локус (UCSC)	Хр. 5: 146.11 – 146.18 Mb	Хр. 18: 42.34 – 42.4 Mb
PubMed search	[1]	[2]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

LARS (англ. Leucyl-tRNA synthetase) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 176 амінокислот, а молекулярна маса — 134 466^[4].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAERKGTAKV		DFLKKIEKEI		QQKWDTERVF		EVNASNLEKQ		TSKGKYFVTF
PYPYMNGRLH		LGHTFSLSKC		EFAVGYQRLK		GKCCLFPFGL		HCTGMPIKAC
ADKLKREIEL		YGCPPDFPDE		EEEEEETSVK		TEDIIIKDKA		KGKKSKAAAK
AGSSKYQWGI		MKSLGLSDEE		IVKFSEAEHW		LDYFPPLAIQ		DLKRMGLKVD
WRRSFITTDV		NPYYDSFVRW		QFLTLRERNK		IKFGKRYTIY		SPKDGQPCMD
HDRQTGEGVG		PQEYTLLKLK		VLEPYPSKLS		GLKGKNIFLV		AATLRPETMF
GQTNCWVRPD		MKYIGFETVN		GDIFICTQKA		ARNMSYQGFT		KDNGVVPVVK
ELMGEEILGA		SLSAPLTSYK		VIYVLPMLTI		KEDKGTGVVT		SVPSDSPDDI
AALRDLKKKQ		ALRAKYGIRD		DMVLPFEPVP		VIEIPGFGNL		SAVTICDELK
IQSQNDREKL		AEAKEKIYLK		GFYEGIMLVD		GFKGQKVQDV		KKTIQKKMID
AGDALIYMEP		EKQVMSRSSD		ECVVALCDQW		YLDYGEENWK		KQTSQCLKNL
ETFCEETRRN		FEATLGWLQE		HACSRTYGLG		THLPWDEQWL		IESLSDSTIY
MAFYTVAHLL		QGGNLHGQAE		SPLGIRPQQM		TKEVWDYVFF		KEAPFPKTQI
AKEKLDQLKQ		EFEFWYPVDL		RVSGKDLVPN		HLSYYLYNHV		AMWPEQSDKW
PTAVRANGHL		LLNSEKMSKS		TGNFLTLTQA		IDKFSADGMR		LALADAGDTV
EDANFVEAMA		DAGILRLYTW		VEWVKEMVAN		WDSLRSGPAS		TFNDRVFASE
LNAGIIKTDQ		NYEKMMFKEA		LKTGFFEFQA		AKDKYRELAV		EGMHRELVFR
FIEVQTLLLA		PFCPHLCEHI		WTLLGKPDSI		MNASWPVAGP		VNEVLIHSSQ
YLMEVTHDLR		LRLKNYMMPA		KGKKTDKQPL		QKPSHCTIYV		AKNYPPWQHT
TLSVLRKHFE		ANNGKLPDNK		VIASELGSMP		ELKKYMKKVM		PFVAMIKENL
EKMGPRILDL		QLEFDEKAVL		MENIVYLTNS		LELEHIEVKF		ASEAEDKIRE
DCCPGKPLNV		FRIEPGVSVS		LVNPQPSNGH		FSTKIEIRQG		DNCDSIIRRL
MKMNRGIKDL		SKVKLMRFDD		PLLGPRRVPV		LGKEYTEKTP		ISEHAVFNVD
LMSKKIHLTE		NGIRVDIGDT		IIYLVH

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до лігаз, аміноацил-тРНК-синтетаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як біосинтез білка, ацетилювання, альтернативний сплайсинг, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у цитоплазмі.

Література

• Nagase T., Kikuno R., Ishikawa K., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVI. The complete sequences of 150 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 7: 65—73. PMID 10718198 doi:10.1093/dnares/7.1.65
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504

Примітки

1. Human PubMed Reference:.
2. Mouse PubMed Reference:.
3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6512 (англ.) . Процитовано 5 вересня 2017.
4. UniProt, Q9P2J5 (англ.) . Архів оригіналу за 9 серпня 2017. Процитовано 5 вересня 2017.

Див. також

• Хромосома 5

Портал «Біологія»   Портал «Хімія»