Нуклеолін

Нуклеонін
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2FC8, 2FC9, 2KRR
Ідентифікатори
Символи	NCL, C23, nucleolin, Nsr1
Зовнішні ІД	OMIM: 164035 MGI: 97286 HomoloGene: 136488 GeneCards: NCL
Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding; • telomeric DNA binding; • protein C-terminus binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • RNA binding; • identical protein binding; • nucleic acid binding; • DNA topoisomerase binding; • mRNA 5'-UTR binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • мембрана; • нуклеоплазма; • cell cortex; • ядерце; • cytoplasmic ribonucleoprotein granule; • екзосома; • клітинне ядро; • Рибонуклеопротеїни;
Біологічний процес	• positive regulation of transcription of nucleolar large rRNA by RNA polymerase I; • Ангіогенез; • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II; • cellular response to epidermal growth factor stimulus; • negative regulation of translation; • cellular response to leukemia inhibitory factor;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	4691
	17975
	ENSG00000115053
	ENSMUSG00000026234
	P19338
	P09405
	NM_005381
	NM_010880
	NP_005372
	NP_035010
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

Нуклеонін (англ. Nucleolin) – білок, який кодується геном NCL, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 710 амінокислот, а молекулярна маса — 76 614^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MVKLAKAGKN	QGDPKKMAPP	PKEVEEDSED	EEMSEDEEDD	SSGEEVVIPQ
KKGKKAAATS	AKKVVVSPTK	KVAVATPAKK	AAVTPGKKAA	ATPAKKTVTP
AKAVTTPGKK	GATPGKALVA	TPGKKGAAIP	AKGAKNGKNA	KKEDSDEEED
DDSEEDEEDD	EDEDEDEDEI	EPAAMKAAAA	APASEDEDDE	DDEDDEDDDD
DEEDDSEEEA	METTPAKGKK	AAKVVPVKAK	NVAEDEDEEE	DDEDEDDDDD
EDDEDDDDED	DEEEEEEEEE	EPVKEAPGKR	KKEMAKQKAA	PEAKKQKVEG
TEPTTAFNLF	VGNLNFNKSA	PELKTGISDV	FAKNDLAVVD	VRIGMTRKFG
YVDFESAEDL	EKALELTGLK	VFGNEIKLEK	PKGKDSKKER	DARTLLAKNL
PYKVTQDELK	EVFEDAAEIR	LVSKDGKSKG	IAYIEFKTEA	DAEKTFEEKQ
GTEIDGRSIS	LYYTGEKGQN	QDYRGGKNST	WSGESKTLVL	SNLSYSATEE
TLQEVFEKAT	FIKVPQNQNG	KSKGYAFIEF	ASFEDAKEAL	NSCNKREIEG
RAIRLELQGP	RGSPNARSQP	SKTLFVKGLS	EDTTEETLKE	SFDGSVRARI
VTDRETGSSK	GFGFVDFNSE	EDAKAAKEAM	EDGEIDGNKV	TLDWAKPKGE
GGFGGRGGGR	GGFGGRGGGR	GGRGGFGGRG	RGGFGGRGGF	RGGRGGGGDH
KPQGKKTKFE

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Білок має сайт для зв'язування з ДНК, РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

Srivastava M., Fleming P.J., Pollard H.B., Burns A.L. (1989). Cloning and sequencing of the human nucleolin cDNA. FEBS Lett. 250: 99—105. PMID 2737305 DOI:10.1016/0014-5793(89)80692-1
Krantz S., Salazar R., Brandt R., Kellermann J., Lottspeich F. (1995). Purification and partial amino acid sequencing of a fructosyllysine-specific binding protein from cell membranes of the monocyte-like cell line U937. Biochim. Biophys. Acta. 1266: 109—112. PMID 7718615 DOI:10.1016/0167-4889(95)00028-Q
Jordan P., Heid H., Kinzel V., Kubler D. (1994). Major cell surface-located protein substrates of an ecto-protein kinase are homologs of known nuclear proteins. Biochemistry. 33: 14696—14706. PMID 7993898 DOI:10.1021/bi00253a007
Ishikawa F., Matunis M.J., Dreyfuss G., Cech T.R. (1993). Nuclear proteins that bind the pre-mRNA 3' splice site sequence r(UUAG/G) and the human telomeric DNA sequence d(TTAGGG)n. Mol. Cell. Biol. 13: 4301—4310. PMID 8321232 DOI:10.1128/MCB.13.7.4301
Parada C.A., Roeder R.G. (1999). A novel RNA polymerase II-containing complex potentiates Tat-enhanced HIV-1 transcription. EMBO J. 18: 3688—3701. PMID 10393184 DOI:10.1093/emboj/18.13.3688
Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:7667 (англ.) . Процитовано 30 січня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, P19338 (англ.) . Процитовано 30 січня 2017.

Див. також

Хромосома 2

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:7667 (англ.) . Процитовано 30 січня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-4] UniProt, P19338 (англ.) . Процитовано 30 січня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]