Нідоген-2

NID2
Ідентифікатори
Символи	NID2, NID-2, nidogen 2
Зовнішні ІД	OMIM: 605399 MGI: 1298229 HomoloGene: 40575 GeneCards: NID2
Онтологія гена Молекулярна функція • calcium ion binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • collagen binding • extracellular matrix structural constituent Клітинна компонента • GO:0005578 Позаклітинна матриця • extracellular region • базальна мембрана • екзосома • міжклітинний простір • клітинна мембрана • collagen-containing extracellular matrix Біологічний процес • адгезія клітин • cell-matrix adhesion • extracellular matrix organization • basement membrane organization Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	22795	18074
Ensembl	ENSG00000087303	ENSMUSG00000021806
UniProt	Q14112	O88322
RefSeq (мРНК)	NM_007361	NM_008695
RefSeq (білок)	NP_031387	NP_032721
Локус (UCSC)	Хр. 14: 52 – 52.07 Mb	Хр. 14: 19.8 – 19.86 Mb
PubMed search	[1]	[2]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

NID2 (англ. Nidogen 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 14-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 375 амінокислот, а молекулярна маса — 151 254^[4].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MEGDRVAGRP		VLSSLPVLLL		LPLLMLRAAA		LHPDELFPHG		ESWGDQLLQE
GDDESSAVVK		LANPLHFYEA		RFSNLYVGTN		GIISTQDFPR		ETQYVDYDFP
TDFPAIAPFL		ADIDTSHGRG		RVLYREDTSP		AVLGLAARYV		RAGFPRSARF
TPTHAFLATW		EQVGAYEEVK		RGALPSGELN		TFQAVLASDG		SDSYALFLYP
ANGLQFLGTR		PKESYNVQLQ		LPARVGFCRG		EADDLKSEGP		YFSLTSTEQS
VKNLYQLSNL		GIPGVWAFHI		GSTSPLDNVR		PAAVGDLSAA		HSSVPLGRSF
SHATALESDY		NEDNLDYYDV		NEEEAEYLPG		EPEEALNGHS		SIDVSFQSKV
DTKPLEESST		LDPHTKEGTS		LGEVGGPDLK		GQVEPWDERE		TRSPAPPEVD
RDSLAPSWET		PPPYPENGSI		QPYPDGGPVP		SEMDVPPAHP		EEEIVLRSYP
ASGHTTPLSR		GTYEVGLEDN		IGSNTEVFTY		NAANKETCEH		NHRQCSRHAF
CTDYATGFCC		HCQSKFYGNG		KHCLPEGAPH		RVNGKVSGHL		HVGHTPVHFT
DVDLHAYIVG		NDGRAYTAIS		HIPQPAAQAL		LPLTPIGGLF		GWLFALEKPG
SENGFSLAGA		AFTHDMEVTF		YPGEETVRIT		QTAEGLDPEN		YLSIKTNIQG
QVPYVSANFT		AHISPYKELY		HYSDSTVTST		SSRDYSLTFG		AINQTWSYRI
HQNITYQVCR		HAPRHPSFPT		TQQLNVDRVF		ALYNDEERVL		RFAVTNQIGP
VKEDSDPTPG		NPCYDGSHMC		DTTARCHPGT		GVDYTCECAS		GYQGDGRNCV
DENECATGFH		RCGPNSVCIN		LPGSYRCECR		SGYEFADDRH		TCILITPPAN
PCEDGSHTCA		PAGQARCVHH		GGSTFSCACL		PGYAGDGHQC		TDVDECSENR
CHPAATCYNT		PGSFSCRCQP		GYYGDGFQCI		PDSTSSLTPC		EQQQRHAQAQ
YAYPGARFHI		PQCDEQGNFL		PLQCHGSTGF		CWCVDPDGHE		VPGTQTPPGS
TPPHCGPSPE		PTQRPPTICE		RWRENLLEHY		GGTPRDDQYV		PQCDDLGHFI
PLQCHGKSDF		CWCVDKDGRE		VQGTRSQPGT		TPACIPTVAP		PMVRPTPRPD
VTPPSVGTFL		LYTQGQQIGY		LPLNGTRLQK		DAAKTLLSLH		GSIIVGIDYD
CRERMVYWTD		VAGRTISRAG		LELGAEPETI		VNSGLISPEG		LAIDHIRRTM
YWTDSVLDKI		ESALLDGSER		KVLFYTDLVN		PRAIAVDPIR		GNLYWTDWNR
EAPKIETSSL		DGENRRILIN		TDIGLPNGLT		FDPFSKLLCW		ADAGTKKLEC
TLPDGTGRRV		IQNNLKYPFS		IVSYADHFYH		TDWRRDGVVS		VNKHSGQFTD
EYLPEQRSHL		YGITAVYPYC		PTGRK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іоном кальцію. Локалізований у позаклітинному матриксі, базальній мембрані. Також секретований назовні.

Література

• Kohfeldt E., Sasaki T., Goehring W., Timpl R. (1998). Nidogen-2: a new basement membrane protein with diverse binding properties. J. Mol. Biol. 282: 99—109. PMID 9733643 doi:10.1006/jmbi.1998.2004

Примітки

1. Human PubMed Reference:.
2. Mouse PubMed Reference:.
3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:13389 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.
4. UniProt, Q14112 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

• Хромосома 14

Портал «Біологія»   Портал «Хімія»