Хлорофлексія (Chloroflexia) — клас бактерійтипухлорофлексів (Chloroflexi), відомий як нитчасті зелені несірчані бактерії. Вони отримують енергію від світла і мають таку назву через зелений пігмент, який знаходиться у фотосинтезуючих тілах — хлоросомах .
Хлорофлексія, як правило, нитчаста і може рухатись за допомогою бактеріального ковзання . Вони факультативно аеробні, але не виробляють кисень у процесі отримання енергії від світла або фототрофії . Крім того, хлорофлексія має інший метод фототрофії (фотогетеротрофія), ніж справжні фотосинтетизуючі бактерії.
Клас Chloroflexia є групою широко розгалужених видів фотосинтезуючих бактерій (за винятком видів Herpetosiphon і Kallotenue), які в даний час складаються з трьох порядків: Chloroflexales, Herpetosiphonales і Kallotenuales .[4][5][6][7][8] Кожен Herpetosiphonales і Kallotenuales складається з одного роду в межах власного сімейства, Herpetosiphonaceae (Herpetosiphon) і Kallotenuaceae (Kallotenue) в той чаз, тоді як хлорофлексали більш філогенетично різноманітні.
Порівняльний геномний аналіз недавно уточнив таксономію класу Хлорофлексія, розділивши Хлорофлекси на підряд Chloroflexineae, що складаються з сімейств Oscillachloridaceae та Chloroflexaceae, та підряд Roseiflexineae, що містять сімейство Roseiflexaceae .[4]Переглянута систематика ґрунтувалася на виявленні ряду збережених сигнатурних індексів (ЗСІ), які є надійними молекулярними маркерами спільного походження.[9][10][11][12] Додатковим аргументом щодо поділу хлорофлексалів на два підряди є спостережувані відмінності у фізіологічних характеристиках, коли кожен підряд характеризується чіткими профілями каротиноїдів, хінонів та жирних кислот, які відсутні в іншому підряді.[13][14] Крім розмежування таксономічних рангів, ЗСІ можуть відігравати певну роль в унікальних характеристиках членів кладу. Зокрема, чотириаміно-кислотна вставка в білковий піруват флаводоксин / ферредоксин оксидоредуктаза, білок, який відіграє важливу роль у фотосинтетезуючих організмах, була виявлена серед усіх представників роду Chloroflexus і вважається, що вона відіграє важливу функціональну роль .[15][16] Додаткова дослідження з використанням ЗСІ були проведені для розмежування філогенетичного положення хлорофлексії щодо сусідніх фотосинтетичних груп, таких як ціанобактерії.[17]Види хлорофлексії проявляють чіткий зв'язок з видами хлоробі, їх найближчими філогенетичними родичами. Було встановлено, що ЗСІ є спільним серед членів хлорофлексії та хлоробі, що було трактовано як результат горизонтальної передачі гена між двома родичами.[18]
Назва «Chloroflexi» — неолатинова множина «Chloroflexus», яка є назвою першого описаного роду. Іменник — це поєднання грецького chloros (χλωρός)[19] означає «зеленувато-жовтий» та латинського flexus (від flecto)[20] означає «зігнуте», що означає «зелений вигин».[21] Назва не обумовлена хлором, елементом, відкритого у 1810 році сером Хамфрі Деві і названого так через блідо-зелений колір.
↑Sutcliffe, I. C. (2010). A phylum level perspective on bacterial cell envelope architecture. Trends in Microbiology. 18 (10): 464—470. doi:10.1016/j.tim.2010.06.005. PMID20637628.
↑ абвGupta RS, Chander P, George S (2013). Phylogenetic framework and molecular signatures for the class Chloroflexia and its different clades; proposal for division of the class Chloroflexia class. nov. [corrected] into the suborder Chloroflexineae subord. nov., consisting of the emended family Oscillochloridaceae and the family Chloroflexaceae fam. nov., and the suborder Roseiflexineae subord. nov., containing the family Roseiflexaceae fam. nov. Antonie van Leeuwenhoek. 103 (1): 99—119. doi:10.1007/s10482-012-9790-3. PMID22903492.
↑ абCole JK, Gieler BA, Heisler DL, Palisoc MM, Williams AJ, Dohnalkova AC, Ming H, Yu TT, Dodsworth JA, Li WJ, Hedlund BP (2013). Kallotenue papyrolyticum gen. nov., sp. nov., a cellulolytic and filamentous thermophile that represents a novel lineage (Kallotenuales ord. nov., Kallotenuaceae fam. nov.) within the class Chloroflexia. Int J Syst Evol Microbiol. 63 (Pt 12): 4675—82. doi:10.1099/ijs.0.053348-0. PMID23950149.
↑Gupta RS, Mukhtar T, Singh B (1999). Evolutionary relationships among photosynthetic prokaryotes (Heliobacterium chlorum, Chloroflexus aurantiacus, cyanobacteria, Chlorobium tepidum and proteobacteria): implications regarding the origin of photosynthesis. Mol Microbiol. 32 (5): 893—906. doi:10.1046/j.1365-2958.1999.01417.x. PMID10361294.
↑Gupta, R. S.; Griffiths, E. (2002). Critical issues in bacterial phylogeny. Theoretical Population Biology. 61 (4): 423—434. doi:10.1006/tpbi.2002.1589. PMID12167362.
↑Hanada S, Pierson BK (2006) The Family Chloroflexaceae. In: The prokaryotes: a handbook on the biology of bacteria, pp. 815—842. Eds Dworkin M, Falkow S, Rosenberg E, Schleifer KH, Stackebrandt E Springer-: New York.
↑Pierson BK, Castenholz RW (1992) The Family Chloroflexaceae. In: The prokaryotes, pp. 3754-3775. Eds Balows A, Truper HG, Dworkin M, Harder W, Schleifer KH Springer-: New York.
↑Gupta RS (2010). Molecular signatures for the main phyla of photosynthetic bacteria and their subgroups. Photosynth Res. 104 (2–3): 357—372. doi:10.1007/s11120-010-9553-9. PMID20414806.
↑Khadka B, Adeolu M, Blankenship RE, Gupta RS (2016). Novel insights into the origin and diversification of photosynthesis based on analyses of conserved indels in the core reaction center proteins. Photosynth Res. Epub ahead of print (2): 159—171. doi:10.1007/s11120-016-0307-1. PMID27638319.
↑Lewis, Charlton T. and Charles Short, A Latin Dictionary. Oxford: Clarendon Press, 1879. Online version at Perseus
↑Don J. Brenner; Noel R. Krieg; James T. Staley (26 липня 2005). George M. Garrity (ред.). Introductory Essays. Bergey's Manual of Systematic Bacteriology. Т. 2A (вид. 2nd). New York: Springer. с. 304. ISBN978-0-387-24143-2. British Library no. GBA561951.