Embecovirus | |
---|---|
Phân loại virus | |
(kph): | Virus |
Vực: | Riboviria |
Ngành: | incertae sedis |
Bộ: | Nidovirales |
Họ: | Coronaviridae |
Chi: | Betacoronavirus |
Phân chi: | Embecovirus |
Species[1] | |
Embecovirus là một phân chi của coronavirus trong chi Betacoronavirus.[2] Các virut trong phân chi này, không giống như các coronavirus khác, có gen hemagglutinin esterase (HE).[3] Các virut trong thế hệ con trước đây được gọi là coronavirus nhóm 2a.[4][5]
Các virut của phân chi này, giống như các coronavirus khác, có lớp màng bọc lipid trong đó các protein cấu trúc màng (M), vỏ (E) và gai (S) được neo lại.[6] Không giống như các coronavirus khác, virus trong thế hệ con này cũng có một protein cấu trúc giống như gai ngắn hơn gọi là hemagglutinin esterase (HE).[3][7]
In all members of Betacoronavirus subgroup A, a haemagglutinin esterase (HE) gene, which encodes a glycoprotein with neuraminate O-acetyl-esterase activity and the active site FGDS, is present downstream to ORF1ab and upstream to S gene (Figure 1).
See figure 2.
CoVs are classified into four genera, Alphacoronavirus, Betacoronavirus, Gammacoronavirus and Deltacoronavirus. Within Betacoronavirus, they can be further subclassified into lineages A, B, C and D [1]. In 2018, these four lineages were reclassified as subgenera of Betacoronavirus, and renamed as Embecovirus (previous lineage A), Sarbecovirus (previous lineage B), Merbecovirus (previous lineage C) and Nobecovirus (previous lineage D) [2]. In addition, a fifth subgenus, Hibecovirus, was also included (Figure 1) [2].
The presence of HE genes exclusively in members of Betacoronavirus subgroup A, but not members of Betacoronavirus subgroup B, C and D suggested that the recombination had probably occurred in the ancestor of members of Betacoronavirus subgroup A, after diverging from the ancestor of other subgroups of Betacoronavirus.