軍艦奉行(日语:ぐんかんぶぎょう)為江戶時代後期、於幕末由江戶幕府所設置之公職名稱。
於1859年所設置。統領幕府海軍,管轄軍艦製造・購入及操錬技術者之養成等項目。其中一項績效為1860年、咸臨丸成軍出航。